横纹金蛛rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Wasp spider rRNA Removal Kit

横纹金蛛rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Wasp spider rRNA Removal Kit

产品说明书

FAQ

COA

已发表文献

 

Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Wasp spider) with purification beads是利用链霉亲和素标记的磁珠去除横纹金蛛来源总RNA中的核糖体RNA以保留信使RNA(mRNA)和其他非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析的mRNA和非编码RNA,可显著提高测序结果中有效数据比例,也可用于cDNA合成及其它下游应用。

 

适用范围

适用于横纹金蛛来源的10 ng~1 μg 总RNA样品。

 

产品组分

组分编号和名称

12286ES04

12286ES24

12286ES96

BOX I

12286-A

PM, Probe Mix

13.5 μL

80 μL

317 μL

BOX II

12286-B

HB, Hybridization buffer

25 μL

150 μL

600 μL

12286-C

DB, Depletion buffer

800 μL

4.6 mL

18.5 mL

12286-D

SMB, Streptavidin-coated magnetic beads

176 μL

1056 μL

4.23 mL

12286-E

PB, Purification beads

795 μL

4.75 mL

19 mL

 

储存条件

试剂盒BOXI(Probe Mix)-25~-15℃保存,BOXII2~8℃保存,有效期1年。

 

注意事项

1. 请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。

2. RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。

3. 使用前,磁珠需提前平衡至室温。

4. RNA投入量为10 ng- 1000 ng。

5. 在操作过程种,避免EP管或PCR管管盖开封(孵育过程中)或长时间处于室温状态。

6.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

7.本产品仅用作科研用途!

 

自备材料

1. qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix(No Rox)(Cat#11201)或其他等效产品;

2. 其他材料: 无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

 

操作步骤

1. 探针杂交

1.1 将探针、Streptavidin-coated magnetic beads和杂交Buffer从-20°C 取出,解冻后颠倒混匀,探针置于冰上放置,其余试剂平衡至室温备用。

1.2 准备RNA样品:根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用Nuclease free H2O稀释至12 μL。

1.3 按照表1于200 μL PCR管中配制rRNA去除反应体系。

1 探针杂交反应体系

名称

体积(μL)

Hybridization Buffer

5

Probe Mix

3

Total RNA

12(10 ng~1 μg)

Total

20

1.4 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

1.5 将上述 PCR 管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。

2 探针杂交反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

68℃

10 min

68℃-37℃

0.1℃/s

37℃*

2 min

*注:采用梯度退火之后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
2. 链酶亲和素磁珠准备

2.1低速涡旋振荡链酶亲和素磁珠使磁珠重悬。

2.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

2.3 吸取40 μL Streptavidin-coated magnetic beads于新的PCR管中,将PCR管置于磁力架上,静置2 min;。

2.4待溶液澄清后,去掉所有上清液。

2.5向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

2.6将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,去上清。

2.7向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

3. rRNA去除

3.1瞬离将步骤1中杂交样品离心至管底。

3.2 将步骤2中的链酶亲和素磁珠加入步骤1的样品中,用移液器吹打10次混匀后,置于PCR仪中,按照表3所示反应程序,进行探针捕获。

3 rRNA去除反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

37℃

15 min

50℃

5 min

*立即进入下一步骤

*注:去除反应程序完成后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
3.3 瞬离将反应液离心至管底

3.4 将样品管置于磁力架上,静置2 min。

3.5 待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中。

3.6 将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中(建议)。

4. RNA纯化

4.1 准备工作:将Purification beads由冰箱中取出,室温平衡至少30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。

4.2 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。

4.3 吸取 180 μL Purification beads至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育 5 min。

4.4 将PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3 min),小心移除上清。

4.5 保持PCR管始终置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec 后,小心移除上清。

4.6 重复步骤 4.5,总计漂洗两次。用 10 μL移液器吸干净残留液体。

4.7 保持 PCR 管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠(5~10 min)。

4.8 RNA洗脱:将PCR 管从磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用适合下游实验的相应体积Nuclease free H2O或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min。

4.9 将 PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3 min),小心移取 10 μL上清(可根据步骤4.8选择的实际洗脱体积进行相应调整)至新的Nuclease free PCR 管中。

【注】洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80℃存放。

Ver.CN20230316 

横纹金蛛rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Wasp spider rRNA Removal Kit

暂无内容

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暂无内容

 

Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Wasp spider) with purification beads是利用链霉亲和素标记的磁珠去除横纹金蛛来源总RNA中的核糖体RNA以保留信使RNA(mRNA)和其他非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析的mRNA和非编码RNA,可显著提高测序结果中有效数据比例,也可用于cDNA合成及其它下游应用。

 

适用范围

适用于横纹金蛛来源的10 ng~1 μg 总RNA样品。

 

产品组分

组分编号和名称

12286ES04

12286ES24

12286ES96

BOX I

12286-A

PM, Probe Mix

13.5 μL

80 μL

317 μL

BOX II

12286-B

HB, Hybridization buffer

25 μL

150 μL

600 μL

12286-C

DB, Depletion buffer

800 μL

4.6 mL

18.5 mL

12286-D

SMB, Streptavidin-coated magnetic beads

176 μL

1056 μL

4.23 mL

12286-E

PB, Purification beads

795 μL

4.75 mL

19 mL

 

储存条件

试剂盒BOXI(Probe Mix)-25~-15℃保存,BOXII2~8℃保存,有效期1年。

 

注意事项

1. 请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。

2. RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。

3. 使用前,磁珠需提前平衡至室温。

4. RNA投入量为10 ng- 1000 ng。

5. 在操作过程种,避免EP管或PCR管管盖开封(孵育过程中)或长时间处于室温状态。

6.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

7.本产品仅用作科研用途!

 

自备材料

1. qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix(No Rox)(Cat#11201)或其他等效产品;

2. 其他材料: 无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

 

操作步骤

1. 探针杂交

1.1 将探针、Streptavidin-coated magnetic beads和杂交Buffer从-20°C 取出,解冻后颠倒混匀,探针置于冰上放置,其余试剂平衡至室温备用。

1.2 准备RNA样品:根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用Nuclease free H2O稀释至12 μL。

1.3 按照表1于200 μL PCR管中配制rRNA去除反应体系。

1 探针杂交反应体系

名称

体积(μL)

Hybridization Buffer

5

Probe Mix

3

Total RNA

12(10 ng~1 μg)

Total

20

1.4 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

1.5 将上述 PCR 管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。

2 探针杂交反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

68℃

10 min

68℃-37℃

0.1℃/s

37℃*

2 min

*注:采用梯度退火之后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
2. 链酶亲和素磁珠准备

2.1低速涡旋振荡链酶亲和素磁珠使磁珠重悬。

2.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

2.3 吸取40 μL Streptavidin-coated magnetic beads于新的PCR管中,将PCR管置于磁力架上,静置2 min;。

2.4待溶液澄清后,去掉所有上清液。

2.5向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

2.6将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,去上清。

2.7向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

3. rRNA去除

3.1瞬离将步骤1中杂交样品离心至管底。

3.2 将步骤2中的链酶亲和素磁珠加入步骤1的样品中,用移液器吹打10次混匀后,置于PCR仪中,按照表3所示反应程序,进行探针捕获。

3 rRNA去除反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

37℃

15 min

50℃

5 min

*立即进入下一步骤

*注:去除反应程序完成后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
3.3 瞬离将反应液离心至管底

3.4 将样品管置于磁力架上,静置2 min。

3.5 待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中。

3.6 将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中(建议)。

4. RNA纯化

4.1 准备工作:将Purification beads由冰箱中取出,室温平衡至少30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。

4.2 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。

4.3 吸取 180 μL Purification beads至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育 5 min。

4.4 将PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3 min),小心移除上清。

4.5 保持PCR管始终置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec 后,小心移除上清。

4.6 重复步骤 4.5,总计漂洗两次。用 10 μL移液器吸干净残留液体。

4.7 保持 PCR 管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠(5~10 min)。

4.8 RNA洗脱:将PCR 管从磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用适合下游实验的相应体积Nuclease free H2O或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min。

4.9 将 PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3 min),小心移取 10 μL上清(可根据步骤4.8选择的实际洗脱体积进行相应调整)至新的Nuclease free PCR 管中。

【注】洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80℃存放。

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横纹金蛛rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Wasp spider rRNA Removal Kit

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暂无内容

海绵动物rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Sponge rRNA Removal Kit

海绵动物rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Sponge rRNA Removal Kit

产品说明书

FAQ

COA

已发表文献

 

Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Sponge) with purification beads是利用链霉亲和素标记的磁珠去除海绵动物来源总RNA中的核糖体RNA以保留信使RNA(mRNA)和其他非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析的mRNA和非编码RNA,可显著提高测序结果中有效数据比例,也可用于cDNA合成及其它下游应用。

 

适用范围

适用于海绵动物来源的10 ng~1 μg 总RNA样品。

 

产品组分

组分编号和名称

12282ES04

12282ES24

12282ES96

BOX I

12282-A

PM, Probe Mix

13.5 μL

80 μL

317 μL

BOX II

12282-B

HB, Hybridization buffer

25 μL

150 μL

600 μL

12282-C

DB, Depletion buffer

800 μL

4.6 mL

18.5 mL

12282-D

SMB, Streptavidin-coated magnetic beads

176 μL

1056 μL

4.23 mL

12282-E

PB, Purification beads

795 μL

4.75 mL

19 mL

 

储存条件

试剂盒BOXI(Probe Mix)-25~-15℃保存,BOXII2~8℃保存,有效期1年。

 

注意事项

1. 请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。

2. RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。

3. 使用前,磁珠需提前平衡至室温。

4. RNA投入量为10 ng- 1000 ng。

5. 在操作过程种,避免EP管或PCR管管盖开封(孵育过程中)或长时间处于室温状态。

6.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

7.本产品仅用作科研用途!

 

自备材料

1. qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix(No Rox)(Cat#11201)或其他等效产品;

2. 其他材料: 无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

 

操作步骤

1. 探针杂交

1.1 将探针、Streptavidin-coated magnetic beads和杂交Buffer从-20°C 取出,解冻后颠倒混匀,探针置于冰上放置,其余试剂平衡至室温备用。

1.2 准备RNA样品:根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用Nuclease free H2O稀释至12 μL。

1.3 按照表1于200 μL PCR管中配制rRNA去除反应体系。

1 探针杂交反应体系

名称

体积(μL)

Hybridization Buffer

5

Probe Mix

3

Total RNA

12(10 ng~1 μg)

Total

20

1.4 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

1.5 将上述 PCR 管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。

2 探针杂交反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

68℃

10 min

68℃-37℃

0.1℃/s

37℃*

2 min

*注:采用梯度退火之后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
2. 链酶亲和素磁珠准备

2.1低速涡旋振荡链酶亲和素磁珠使磁珠重悬。

2.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

2.3 吸取40 μL Streptavidin-coated magnetic beads于新的PCR管中,将PCR管置于磁力架上,静置2 min;。

2.4待溶液澄清后,去掉所有上清液。

2.5向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

2.6将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,去上清。

2.7向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

3. rRNA去除

3.1瞬离将步骤1中杂交样品离心至管底。

3.2 将步骤2中的链酶亲和素磁珠加入步骤1的样品中,用移液器吹打10次混匀后,置于PCR仪中,按照表3所示反应程序,进行探针捕获。

3 rRNA去除反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

37℃

15 min

50℃

5 min

*立即进入下一步骤

*注:去除反应程序完成后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
3.3 瞬离将反应液离心至管底

3.4 将样品管置于磁力架上,静置2 min。

3.5 待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中。

3.6 将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中(建议)。

4. RNA纯化

4.1 准备工作:将Purification beads由冰箱中取出,室温平衡至少30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。

4.2 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。

4.3 吸取 180 μL Purification beads至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育 5 min。

4.4 将PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3 min),小心移除上清。

4.5 保持PCR管始终置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec 后,小心移除上清。

4.6 重复步骤 4.5,总计漂洗两次。用 10 μL移液器吸干净残留液体。

4.7 保持 PCR 管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠(5~10 min)。

4.8 RNA洗脱:将PCR 管从磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用适合下游实验的相应体积Nuclease free H2O或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min。

4.9 将 PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3 min),小心移取 10 μL上清(可根据步骤4.8选择的实际洗脱体积进行相应调整)至新的Nuclease free PCR 管中。

【注】洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80℃存放。

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海绵动物rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Sponge rRNA Removal Kit

暂无内容

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暂无内容

 

Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Sponge) with purification beads是利用链霉亲和素标记的磁珠去除海绵动物来源总RNA中的核糖体RNA以保留信使RNA(mRNA)和其他非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析的mRNA和非编码RNA,可显著提高测序结果中有效数据比例,也可用于cDNA合成及其它下游应用。

 

适用范围

适用于海绵动物来源的10 ng~1 μg 总RNA样品。

 

产品组分

组分编号和名称

12282ES04

12282ES24

12282ES96

BOX I

12282-A

PM, Probe Mix

13.5 μL

80 μL

317 μL

BOX II

12282-B

HB, Hybridization buffer

25 μL

150 μL

600 μL

12282-C

DB, Depletion buffer

800 μL

4.6 mL

18.5 mL

12282-D

SMB, Streptavidin-coated magnetic beads

176 μL

1056 μL

4.23 mL

12282-E

PB, Purification beads

795 μL

4.75 mL

19 mL

 

储存条件

试剂盒BOXI(Probe Mix)-25~-15℃保存,BOXII2~8℃保存,有效期1年。

 

注意事项

1. 请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。

2. RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。

3. 使用前,磁珠需提前平衡至室温。

4. RNA投入量为10 ng- 1000 ng。

5. 在操作过程种,避免EP管或PCR管管盖开封(孵育过程中)或长时间处于室温状态。

6.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

7.本产品仅用作科研用途!

 

自备材料

1. qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix(No Rox)(Cat#11201)或其他等效产品;

2. 其他材料: 无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

 

操作步骤

1. 探针杂交

1.1 将探针、Streptavidin-coated magnetic beads和杂交Buffer从-20°C 取出,解冻后颠倒混匀,探针置于冰上放置,其余试剂平衡至室温备用。

1.2 准备RNA样品:根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用Nuclease free H2O稀释至12 μL。

1.3 按照表1于200 μL PCR管中配制rRNA去除反应体系。

1 探针杂交反应体系

名称

体积(μL)

Hybridization Buffer

5

Probe Mix

3

Total RNA

12(10 ng~1 μg)

Total

20

1.4 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

1.5 将上述 PCR 管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。

2 探针杂交反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

68℃

10 min

68℃-37℃

0.1℃/s

37℃*

2 min

*注:采用梯度退火之后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
2. 链酶亲和素磁珠准备

2.1低速涡旋振荡链酶亲和素磁珠使磁珠重悬。

2.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

2.3 吸取40 μL Streptavidin-coated magnetic beads于新的PCR管中,将PCR管置于磁力架上,静置2 min;。

2.4待溶液澄清后,去掉所有上清液。

2.5向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

2.6将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,去上清。

2.7向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

3. rRNA去除

3.1瞬离将步骤1中杂交样品离心至管底。

3.2 将步骤2中的链酶亲和素磁珠加入步骤1的样品中,用移液器吹打10次混匀后,置于PCR仪中,按照表3所示反应程序,进行探针捕获。

3 rRNA去除反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

37℃

15 min

50℃

5 min

*立即进入下一步骤

*注:去除反应程序完成后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
3.3 瞬离将反应液离心至管底

3.4 将样品管置于磁力架上,静置2 min。

3.5 待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中。

3.6 将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中(建议)。

4. RNA纯化

4.1 准备工作:将Purification beads由冰箱中取出,室温平衡至少30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。

4.2 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。

4.3 吸取 180 μL Purification beads至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育 5 min。

4.4 将PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3 min),小心移除上清。

4.5 保持PCR管始终置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec 后,小心移除上清。

4.6 重复步骤 4.5,总计漂洗两次。用 10 μL移液器吸干净残留液体。

4.7 保持 PCR 管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠(5~10 min)。

4.8 RNA洗脱:将PCR 管从磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用适合下游实验的相应体积Nuclease free H2O或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min。

4.9 将 PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3 min),小心移取 10 μL上清(可根据步骤4.8选择的实际洗脱体积进行相应调整)至新的Nuclease free PCR 管中。

【注】洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80℃存放。

Ver.CN20230316

海绵动物rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Sponge rRNA Removal Kit

暂无内容

海绵动物rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Sponge rRNA Removal Kit

暂无内容

蜱虫rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Ixodes scapular rRNA Removal Kit

蜱虫rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Ixodes scapular rRNA Removal Kit

产品说明书

FAQ

COA

已发表文献

 

Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Ixodes scapular) with purification beads是利用链霉亲和素标记的磁珠去除蜱虫来源总RNA中的核糖体RNA以保留信使RNA(mRNA)和其他非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析的mRNA和非编码RNA,可显著提高测序结果中有效数据比例,也可用于cDNA合成及其它下游应用。

 

适用范围

适用于蜱虫来源的10 ng~1 μg 总RNA样品。

 

产品组分

组分编号和名称

12289ES04

12289ES24

12289ES96

BOX I

12289-A

PM, Probe Mix

13.5 μL

80 μL

317 μL

BOX II

12289-B

HB, Hybridization buffer

25 μL

150 μL

600 μL

12289-C

DB, Depletion buffer

800 μL

4.6 mL

18.5 mL

12289-D

SMB, Streptavidin-coated magnetic beads

176 μL

1056 μL

4.23 mL

12289-E

PB, Purification beads

795 μL

4.75 mL

19 mL

 

储存条件

试剂盒BOXI(Probe Mix)-25~-15℃保存,BOXII2~8℃保存,有效期1年。

 

注意事项

1. 请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。

2. RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。

3. 使用前,磁珠需提前平衡至室温。

4. RNA投入量为10 ng- 1000 ng。

5. 在操作过程种,避免EP管或PCR管管盖开封(孵育过程中)或长时间处于室温状态。

6.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

7.本产品仅用作科研用途!

 

自备材料

1. qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix(No Rox)(Cat#11201)或其他等效产品;

2. 其他材料: 无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

 

操作步骤

1. 探针杂交

1.1 将探针、Streptavidin-coated magnetic beads和杂交Buffer从-20°C 取出,解冻后颠倒混匀,探针置于冰上放置,其余试剂平衡至室温备用。

1.2 准备RNA样品:根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用Nuclease free H2O稀释至12 μL。

1.3 按照表1于200 μL PCR管中配制rRNA去除反应体系。

1 探针杂交反应体系

名称

体积(μL)

Hybridization Buffer

5

Probe Mix

3

Total RNA

12(10 ng~1 μg)

Total

20

1.4 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

1.5 将上述 PCR 管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。

2 探针杂交反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

68℃

10 min

68℃-37℃

0.1℃/s

37℃*

2 min

*注:采用梯度退火之后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
2. 链酶亲和素磁珠准备

2.1低速涡旋振荡链酶亲和素磁珠使磁珠重悬。

2.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

2.3 吸取40 μL Streptavidin-coated magnetic beads于新的PCR管中,将PCR管置于磁力架上,静置2 min;。

2.4待溶液澄清后,去掉所有上清液。

2.5向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

2.6将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,去上清。

2.7向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

3. rRNA去除

3.1瞬离将步骤1中杂交样品离心至管底。

3.2 将步骤2中的链酶亲和素磁珠加入步骤1的样品中,用移液器吹打10次混匀后,置于PCR仪中,按照表3所示反应程序,进行探针捕获。

3 rRNA去除反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

37℃

15 min

50℃

5 min

*立即进入下一步骤

*注:去除反应程序完成后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
3.3 瞬离将反应液离心至管底

3.4 将样品管置于磁力架上,静置2 min。

3.5 待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中。

3.6 将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中(建议)。

4. RNA纯化

4.1 准备工作:将Purification beads由冰箱中取出,室温平衡至少30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。

4.2 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。

4.3 吸取 180 μL Purification beads至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育 5 min。

4.4 将PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3 min),小心移除上清。

4.5 保持PCR管始终置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec 后,小心移除上清。

4.6 重复步骤 4.5,总计漂洗两次。用 10 μL移液器吸干净残留液体。

4.7 保持 PCR 管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠(5~10 min)。

4.8 RNA洗脱:将PCR 管从磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用适合下游实验的相应体积Nuclease free H2O或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min。

4.9 将 PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3 min),小心移取 10 μL上清(可根据步骤4.8选择的实际洗脱体积进行相应调整)至新的Nuclease free PCR 管中。

【注】洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80℃存放。

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蜱虫rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Ixodes scapular rRNA Removal Kit

暂无内容

蜱虫rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Ixodes scapular rRNA Removal Kit

暂无内容

 

Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Ixodes scapular) with purification beads是利用链霉亲和素标记的磁珠去除蜱虫来源总RNA中的核糖体RNA以保留信使RNA(mRNA)和其他非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析的mRNA和非编码RNA,可显著提高测序结果中有效数据比例,也可用于cDNA合成及其它下游应用。

 

适用范围

适用于蜱虫来源的10 ng~1 μg 总RNA样品。

 

产品组分

组分编号和名称

12289ES04

12289ES24

12289ES96

BOX I

12289-A

PM, Probe Mix

13.5 μL

80 μL

317 μL

BOX II

12289-B

HB, Hybridization buffer

25 μL

150 μL

600 μL

12289-C

DB, Depletion buffer

800 μL

4.6 mL

18.5 mL

12289-D

SMB, Streptavidin-coated magnetic beads

176 μL

1056 μL

4.23 mL

12289-E

PB, Purification beads

795 μL

4.75 mL

19 mL

 

储存条件

试剂盒BOXI(Probe Mix)-25~-15℃保存,BOXII2~8℃保存,有效期1年。

 

注意事项

1. 请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。

2. RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。

3. 使用前,磁珠需提前平衡至室温。

4. RNA投入量为10 ng- 1000 ng。

5. 在操作过程种,避免EP管或PCR管管盖开封(孵育过程中)或长时间处于室温状态。

6.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

7.本产品仅用作科研用途!

 

自备材料

1. qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix(No Rox)(Cat#11201)或其他等效产品;

2. 其他材料: 无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

 

操作步骤

1. 探针杂交

1.1 将探针、Streptavidin-coated magnetic beads和杂交Buffer从-20°C 取出,解冻后颠倒混匀,探针置于冰上放置,其余试剂平衡至室温备用。

1.2 准备RNA样品:根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用Nuclease free H2O稀释至12 μL。

1.3 按照表1于200 μL PCR管中配制rRNA去除反应体系。

1 探针杂交反应体系

名称

体积(μL)

Hybridization Buffer

5

Probe Mix

3

Total RNA

12(10 ng~1 μg)

Total

20

1.4 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

1.5 将上述 PCR 管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。

2 探针杂交反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

68℃

10 min

68℃-37℃

0.1℃/s

37℃*

2 min

*注:采用梯度退火之后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
2. 链酶亲和素磁珠准备

2.1低速涡旋振荡链酶亲和素磁珠使磁珠重悬。

2.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

2.3 吸取40 μL Streptavidin-coated magnetic beads于新的PCR管中,将PCR管置于磁力架上,静置2 min;。

2.4待溶液澄清后,去掉所有上清液。

2.5向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

2.6将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,去上清。

2.7向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

3. rRNA去除

3.1瞬离将步骤1中杂交样品离心至管底。

3.2 将步骤2中的链酶亲和素磁珠加入步骤1的样品中,用移液器吹打10次混匀后,置于PCR仪中,按照表3所示反应程序,进行探针捕获。

3 rRNA去除反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

37℃

15 min

50℃

5 min

*立即进入下一步骤

*注:去除反应程序完成后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
3.3 瞬离将反应液离心至管底

3.4 将样品管置于磁力架上,静置2 min。

3.5 待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中。

3.6 将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中(建议)。

4. RNA纯化

4.1 准备工作:将Purification beads由冰箱中取出,室温平衡至少30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。

4.2 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。

4.3 吸取 180 μL Purification beads至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育 5 min。

4.4 将PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3 min),小心移除上清。

4.5 保持PCR管始终置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec 后,小心移除上清。

4.6 重复步骤 4.5,总计漂洗两次。用 10 μL移液器吸干净残留液体。

4.7 保持 PCR 管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠(5~10 min)。

4.8 RNA洗脱:将PCR 管从磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用适合下游实验的相应体积Nuclease free H2O或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min。

4.9 将 PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3 min),小心移取 10 μL上清(可根据步骤4.8选择的实际洗脱体积进行相应调整)至新的Nuclease free PCR 管中。

【注】洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80℃存放。

Ver.CN20230316

蜱虫rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Ixodes scapular rRNA Removal Kit

暂无内容

蜱虫rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Ixodes scapular rRNA Removal Kit

暂无内容

堡礁海绵rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Amphimedon queenslandica rRNA Removal Kit

堡礁海绵rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Amphimedon queenslandica rRNA Removal Kit

产品说明书

FAQ

COA

已发表文献

 

Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Amphimedon queenslandica) with purification beads是利用链霉亲和素标记的磁珠去除堡礁海绵来源总RNA中的核糖体RNA以保留信使RNA(mRNA)和其他非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析的mRNA和非编码RNA,可显著提高测序结果中有效数据比例,也可用于cDNA合成及其它下游应用。

 

适用范围

适用于堡礁海绵来源的10 ng~1 μg 总RNA样品。

 

产品组分

组分编号和名称

12277ES04

12277ES24

12277ES96

BOX I

12277-A

PM, Probe Mix

13.5 μL

80 μL

317 μL

BOX II

12277-B

HB, Hybridization buffer

25 μL

150 μL

600 μL

12277-C

DB, Depletion buffer

800 μL

4.6 mL

18.5 mL

12277-D

SMB, Streptavidin-coated magnetic beads

176 μL

1056 μL

4.23 mL

12277-E

PB, Purification beads

795 μL

4.75 mL

19 mL

 

储存条件

试剂盒BOXI(Probe Mix)-25~-15℃保存,BOXII2~8℃保存,有效期1年。

 

注意事项

1. 请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。

2. RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。

3. 使用前,磁珠需提前平衡至室温。

4. RNA投入量为10 ng- 1000 ng。

5. 在操作过程种,避免EP管或PCR管管盖开封(孵育过程中)或长时间处于室温状态。

6.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

7.本产品仅用作科研用途!

 

自备材料

1. qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix(No Rox)(Cat#11201)或其他等效产品;

2. 其他材料: 无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

 

操作步骤

1. 探针杂交

1.1 将探针、Streptavidin-coated magnetic beads和杂交Buffer从-20°C 取出,解冻后颠倒混匀,探针置于冰上放置,其余试剂平衡至室温备用。

1.2 准备RNA样品:根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用Nuclease free H2O稀释至12 μL。

1.3 按照表1于200 μL PCR管中配制rRNA去除反应体系。

1 探针杂交反应体系

名称

体积(μL)

Hybridization Buffer

5

Probe Mix

3

Total RNA

12(10 ng~1 μg)

Total

20

1.4 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

1.5 将上述 PCR 管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。

2 探针杂交反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

68℃

10 min

68℃-37℃

0.1℃/s

37℃*

2 min

*注:采用梯度退火之后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
2. 链酶亲和素磁珠准备

2.1低速涡旋振荡链酶亲和素磁珠使磁珠重悬。

2.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

2.3 吸取40 μL Streptavidin-coated magnetic beads于新的PCR管中,将PCR管置于磁力架上,静置2 min;。

2.4待溶液澄清后,去掉所有上清液。

2.5向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

2.6将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,去上清。

2.7向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

3. rRNA去除

3.1瞬离将步骤1中杂交样品离心至管底。

3.2 将步骤2中的链酶亲和素磁珠加入步骤1的样品中,用移液器吹打10次混匀后,置于PCR仪中,按照表3所示反应程序,进行探针捕获。

3 rRNA去除反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

37℃

15 min

50℃

5 min

*立即进入下一步骤

*注:去除反应程序完成后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
3.3 瞬离将反应液离心至管底

3.4 将样品管置于磁力架上,静置2 min。

3.5 待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中。

3.6 将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中(建议)。

4. RNA纯化

4.1 准备工作:将Purification beads由冰箱中取出,室温平衡至少30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。

4.2 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。

4.3 吸取 180 μL Purification beads至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育 5 min。

4.4 将PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3 min),小心移除上清。

4.5 保持PCR管始终置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec 后,小心移除上清。

4.6 重复步骤 4.5,总计漂洗两次。用 10 μL移液器吸干净残留液体。

4.7 保持 PCR 管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠(5~10 min)。

4.8 RNA洗脱:将PCR 管从磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用适合下游实验的相应体积Nuclease free H2O或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min。

4.9 将 PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3 min),小心移取 10 μL上清(可根据步骤4.8选择的实际洗脱体积进行相应调整)至新的Nuclease free PCR 管中。

【注】洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80℃存放。

Ver.CN20230316

堡礁海绵rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Amphimedon queenslandica rRNA Removal Kit

暂无内容

堡礁海绵rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Amphimedon queenslandica rRNA Removal Kit

暂无内容

 

Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Amphimedon queenslandica) with purification beads是利用链霉亲和素标记的磁珠去除堡礁海绵来源总RNA中的核糖体RNA以保留信使RNA(mRNA)和其他非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析的mRNA和非编码RNA,可显著提高测序结果中有效数据比例,也可用于cDNA合成及其它下游应用。

 

适用范围

适用于堡礁海绵来源的10 ng~1 μg 总RNA样品。

 

产品组分

组分编号和名称

12277ES04

12277ES24

12277ES96

BOX I

12277-A

PM, Probe Mix

13.5 μL

80 μL

317 μL

BOX II

12277-B

HB, Hybridization buffer

25 μL

150 μL

600 μL

12277-C

DB, Depletion buffer

800 μL

4.6 mL

18.5 mL

12277-D

SMB, Streptavidin-coated magnetic beads

176 μL

1056 μL

4.23 mL

12277-E

PB, Purification beads

795 μL

4.75 mL

19 mL

 

储存条件

试剂盒BOXI(Probe Mix)-25~-15℃保存,BOXII2~8℃保存,有效期1年。

 

注意事项

1. 请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。

2. RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。

3. 使用前,磁珠需提前平衡至室温。

4. RNA投入量为10 ng- 1000 ng。

5. 在操作过程种,避免EP管或PCR管管盖开封(孵育过程中)或长时间处于室温状态。

6.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

7.本产品仅用作科研用途!

 

自备材料

1. qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix(No Rox)(Cat#11201)或其他等效产品;

2. 其他材料: 无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

 

操作步骤

1. 探针杂交

1.1 将探针、Streptavidin-coated magnetic beads和杂交Buffer从-20°C 取出,解冻后颠倒混匀,探针置于冰上放置,其余试剂平衡至室温备用。

1.2 准备RNA样品:根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用Nuclease free H2O稀释至12 μL。

1.3 按照表1于200 μL PCR管中配制rRNA去除反应体系。

1 探针杂交反应体系

名称

体积(μL)

Hybridization Buffer

5

Probe Mix

3

Total RNA

12(10 ng~1 μg)

Total

20

1.4 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

1.5 将上述 PCR 管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。

2 探针杂交反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

68℃

10 min

68℃-37℃

0.1℃/s

37℃*

2 min

*注:采用梯度退火之后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
2. 链酶亲和素磁珠准备

2.1低速涡旋振荡链酶亲和素磁珠使磁珠重悬。

2.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

2.3 吸取40 μL Streptavidin-coated magnetic beads于新的PCR管中,将PCR管置于磁力架上,静置2 min;。

2.4待溶液澄清后,去掉所有上清液。

2.5向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

2.6将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,去上清。

2.7向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

3. rRNA去除

3.1瞬离将步骤1中杂交样品离心至管底。

3.2 将步骤2中的链酶亲和素磁珠加入步骤1的样品中,用移液器吹打10次混匀后,置于PCR仪中,按照表3所示反应程序,进行探针捕获。

3 rRNA去除反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

37℃

15 min

50℃

5 min

*立即进入下一步骤

*注:去除反应程序完成后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
3.3 瞬离将反应液离心至管底

3.4 将样品管置于磁力架上,静置2 min。

3.5 待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中。

3.6 将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中(建议)。

4. RNA纯化

4.1 准备工作:将Purification beads由冰箱中取出,室温平衡至少30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。

4.2 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。

4.3 吸取 180 μL Purification beads至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育 5 min。

4.4 将PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3 min),小心移除上清。

4.5 保持PCR管始终置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec 后,小心移除上清。

4.6 重复步骤 4.5,总计漂洗两次。用 10 μL移液器吸干净残留液体。

4.7 保持 PCR 管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠(5~10 min)。

4.8 RNA洗脱:将PCR 管从磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用适合下游实验的相应体积Nuclease free H2O或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min。

4.9 将 PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3 min),小心移取 10 μL上清(可根据步骤4.8选择的实际洗脱体积进行相应调整)至新的Nuclease free PCR 管中。

【注】洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80℃存放。

Ver.CN20230316

堡礁海绵rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Amphimedon queenslandica rRNA Removal Kit

暂无内容

堡礁海绵rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Amphimedon queenslandica rRNA Removal Kit

暂无内容

原核生物rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Prokaryote rRNA Removal Kit

原核生物rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Prokaryote rRNA Removal Kit

产品说明书

FAQ

COA

已发表文献

 

Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Prokaryote) with purification beads是利用链霉亲和素标记的磁珠去除原核生物(细菌和古生菌通用)来源总RNA中的核糖体RNA以保留信使RNA(mRNA)和其他非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析的mRNA和非编码RNA,可显著提高测序结果中有效数据比例,也可用于cDNA合成及其它下游应用。

 

适用范围

适用于原核生物(细菌和古生菌通用)来源的10 ng~1 μg 总RNA样品若实验时去除单一物种rRNA,总RNA量不能超过200 ng,推荐使用100-200 ng

 

产品组分

组分编号和名称

12265ES04

12265ES24

12265ES96

BOX I

12265-A

PM, Probe Mix

13.5 μL

80 μL

317 μL

BOX II

12265-B

HB, Hybridization buffer

25 μL

150 μL

600 μL

12265-C

DB, Depletion buffer

800 μL

4.6 mL

18.5 mL

12265-D

SMB, Streptavidin-coated magnetic beads

176 μL

1056 μL

4.23 mL

12265-E

PB, Purification beads

795 μL

4.75 mL

19 mL

 

储存条件

试剂盒BOXI(Probe Mix)-25~-15℃保存,BOXII2~8℃保存,有效期1年。

 

注意事项

1. 请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。

2. RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。

3. 使用前,磁珠需提前平衡至室温。

4. RNA投入量为10 ng- 1000 ng,但当实验时去除单一物种rRNA,总RNA量不能超过200 ng,推荐使用100-200 ng

5. 在操作过程种,避免EP管或PCR管管盖开封(孵育过程中)或长时间处于室温状态。

6.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

7.本产品仅用作科研用途!

 

自备材料

1. qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix(No Rox)(Cat#11201)或其他等效产品;

2. 其他材料: 无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

 

操作步骤

1. 探针杂交

1.1 将探针、Streptavidin-coated magnetic beads和杂交Buffer从-20°C 取出,解冻后颠倒混匀,探针置于冰上放置,其余试剂平衡至室温备用。

1.2 准备RNA样品:根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用Nuclease free H2O稀释至12 μL。

1.3 按照表1于200 μL PCR管中配制rRNA去除反应体系。

1 探针杂交反应体系

名称

体积(μL)

Hybridization Buffer

5

Probe Mix

3

Total RNA*

12(10 ng~1 μg)

Total

20

*注:若为单一物种,Total RNA总量不能超过200 ng,推荐使用100-200 ng。
1.4 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

1.5 将上述 PCR 管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。

2 探针杂交反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

68℃

10 min

68℃-37℃

0.1℃/s

37℃*

2 min

*注:采用梯度退火之后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
2. 链酶亲和素磁珠准备

2.1低速涡旋振荡链酶亲和素磁珠使磁珠重悬。

2.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

2.3 吸取40 μL Streptavidin-coated magnetic beads于新的PCR管中,将PCR管置于磁力架上,静置2 min;。

2.4待溶液澄清后,去掉所有上清液。

2.5向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

2.6将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,去上清。

2.7向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

3. rRNA去除

3.1瞬离将步骤1中杂交样品离心至管底。

3.2 将步骤2中的链酶亲和素磁珠加入步骤1的样品中,用移液器吹打10次混匀后,置于PCR仪中,按照表3所示反应程序,进行探针捕获。

3 rRNA去除反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

37℃

15 min

50℃

5 min

*立即进入下一步骤

*注:去除反应程序完成后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
3.3 瞬离将反应液离心至管底

3.4 将样品管置于磁力架上,静置2 min。

3.5 待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中。

3.6 将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中(建议)。

4. RNA纯化

4.1 准备工作:将Purification beads由冰箱中取出,室温平衡至少30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。

4.2 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。

4.3 吸取 180 μL Purification beads至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育 5 min。

4.4 将PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3 min),小心移除上清。

4.5 保持PCR管始终置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec 后,小心移除上清。

4.6 重复步骤 4.5,总计漂洗两次。用 10 μL移液器吸干净残留液体。

4.7 保持 PCR 管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠(5~10 min)。

4.8 RNA洗脱:将PCR 管从磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用适合下游实验的相应体积Nuclease free H2O或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min。

4.9 将 PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3 min),小心移取 10 μL上清(可根据步骤4.8选择的实际洗脱体积进行相应调整)至新的Nuclease free PCR 管中。

【注】洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80℃存放。

Ver.CN20230316 

原核生物rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Prokaryote rRNA Removal Kit

暂无内容

原核生物rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Prokaryote rRNA Removal Kit

暂无内容

 

Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Prokaryote) with purification beads是利用链霉亲和素标记的磁珠去除原核生物(细菌和古生菌通用)来源总RNA中的核糖体RNA以保留信使RNA(mRNA)和其他非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析的mRNA和非编码RNA,可显著提高测序结果中有效数据比例,也可用于cDNA合成及其它下游应用。

 

适用范围

适用于原核生物(细菌和古生菌通用)来源的10 ng~1 μg 总RNA样品若实验时去除单一物种rRNA,总RNA量不能超过200 ng,推荐使用100-200 ng

 

产品组分

组分编号和名称

12265ES04

12265ES24

12265ES96

BOX I

12265-A

PM, Probe Mix

13.5 μL

80 μL

317 μL

BOX II

12265-B

HB, Hybridization buffer

25 μL

150 μL

600 μL

12265-C

DB, Depletion buffer

800 μL

4.6 mL

18.5 mL

12265-D

SMB, Streptavidin-coated magnetic beads

176 μL

1056 μL

4.23 mL

12265-E

PB, Purification beads

795 μL

4.75 mL

19 mL

 

储存条件

试剂盒BOXI(Probe Mix)-25~-15℃保存,BOXII2~8℃保存,有效期1年。

 

注意事项

1. 请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。

2. RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。

3. 使用前,磁珠需提前平衡至室温。

4. RNA投入量为10 ng- 1000 ng,但当实验时去除单一物种rRNA,总RNA量不能超过200 ng,推荐使用100-200 ng

5. 在操作过程种,避免EP管或PCR管管盖开封(孵育过程中)或长时间处于室温状态。

6.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

7.本产品仅用作科研用途!

 

自备材料

1. qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix(No Rox)(Cat#11201)或其他等效产品;

2. 其他材料: 无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

 

操作步骤

1. 探针杂交

1.1 将探针、Streptavidin-coated magnetic beads和杂交Buffer从-20°C 取出,解冻后颠倒混匀,探针置于冰上放置,其余试剂平衡至室温备用。

1.2 准备RNA样品:根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用Nuclease free H2O稀释至12 μL。

1.3 按照表1于200 μL PCR管中配制rRNA去除反应体系。

1 探针杂交反应体系

名称

体积(μL)

Hybridization Buffer

5

Probe Mix

3

Total RNA*

12(10 ng~1 μg)

Total

20

*注:若为单一物种,Total RNA总量不能超过200 ng,推荐使用100-200 ng。
1.4 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

1.5 将上述 PCR 管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。

2 探针杂交反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

68℃

10 min

68℃-37℃

0.1℃/s

37℃*

2 min

*注:采用梯度退火之后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
2. 链酶亲和素磁珠准备

2.1低速涡旋振荡链酶亲和素磁珠使磁珠重悬。

2.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

2.3 吸取40 μL Streptavidin-coated magnetic beads于新的PCR管中,将PCR管置于磁力架上,静置2 min;。

2.4待溶液澄清后,去掉所有上清液。

2.5向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

2.6将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,去上清。

2.7向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

3. rRNA去除

3.1瞬离将步骤1中杂交样品离心至管底。

3.2 将步骤2中的链酶亲和素磁珠加入步骤1的样品中,用移液器吹打10次混匀后,置于PCR仪中,按照表3所示反应程序,进行探针捕获。

3 rRNA去除反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

37℃

15 min

50℃

5 min

*立即进入下一步骤

*注:去除反应程序完成后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
3.3 瞬离将反应液离心至管底

3.4 将样品管置于磁力架上,静置2 min。

3.5 待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中。

3.6 将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中(建议)。

4. RNA纯化

4.1 准备工作:将Purification beads由冰箱中取出,室温平衡至少30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。

4.2 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。

4.3 吸取 180 μL Purification beads至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育 5 min。

4.4 将PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3 min),小心移除上清。

4.5 保持PCR管始终置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec 后,小心移除上清。

4.6 重复步骤 4.5,总计漂洗两次。用 10 μL移液器吸干净残留液体。

4.7 保持 PCR 管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠(5~10 min)。

4.8 RNA洗脱:将PCR 管从磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用适合下游实验的相应体积Nuclease free H2O或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min。

4.9 将 PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3 min),小心移取 10 μL上清(可根据步骤4.8选择的实际洗脱体积进行相应调整)至新的Nuclease free PCR 管中。

【注】洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80℃存放。

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原核生物rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Prokaryote rRNA Removal Kit

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原核生物rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Prokaryote rRNA Removal Kit

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血内寄生虫rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Blood Parasite rRNA Removal Kit

血内寄生虫rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Blood Parasite rRNA Removal Kit

产品说明书

FAQ

COA

已发表文献

 

Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Blood Parasite) with purification beads是利用链霉亲和素标记的磁珠去除血内寄生虫来源总RNA中的核糖体RNA以保留信使RNA(mRNA)和其他非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析的mRNA和非编码RNA,可显著提高测序结果中有效数据比例,也可用于cDNA合成及其它下游应用。

 

适用范围

适用于血内寄生虫来源的10 ng~1 μg 总RNA样品。

 

产品组分

组分编号和名称

12283ES04

12283ES24

12283ES96

BOX I

12283-A

PM, Probe Mix

13.5 μL

80 μL

317 μL

BOX II

12283-B

HB, Hybridization buffer

25 μL

150 μL

600 μL

12283-C

DB, Depletion buffer

800 μL

4.6 mL

18.5 mL

12283-D

SMB, Streptavidin-coated magnetic beads

176 μL

1056 μL

4.23 mL

12283-E

PB, Purification beads

795 μL

4.75 mL

19 mL

 

储存条件

试剂盒BOXI(Probe Mix)-25~-15℃保存,BOXII2~8℃保存,有效期1年。

 

注意事项

1. 请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。

2. RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。

3. 使用前,磁珠需提前平衡至室温。

4. RNA投入量为10 ng- 1000 ng。

5. 在操作过程种,避免EP管或PCR管管盖开封(孵育过程中)或长时间处于室温状态。

6.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

7.本产品仅用作科研用途!

 

自备材料

1. qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix(No Rox)(Cat#11201)或其他等效产品;

2. 其他材料: 无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

 

操作步骤

1. 探针杂交

1.1 将探针、Streptavidin-coated magnetic beads和杂交Buffer从-20°C 取出,解冻后颠倒混匀,探针置于冰上放置,其余试剂平衡至室温备用。

1.2 准备RNA样品:根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用Nuclease free H2O稀释至12 μL。

1.3 按照表1于200 μL PCR管中配制rRNA去除反应体系。

1 探针杂交反应体系

名称

体积(μL)

Hybridization Buffer

5

Probe Mix

3

Total RNA

12(10 ng~1 μg)

Total

20

1.4 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

1.5 将上述 PCR 管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。

2 探针杂交反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

68℃

10 min

68℃-37℃

0.1℃/s

37℃*

2 min

*注:采用梯度退火之后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
2. 链酶亲和素磁珠准备

2.1低速涡旋振荡链酶亲和素磁珠使磁珠重悬。

2.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

2.3 吸取40 μL Streptavidin-coated magnetic beads于新的PCR管中,将PCR管置于磁力架上,静置2 min;。

2.4待溶液澄清后,去掉所有上清液。

2.5向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

2.6将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,去上清。

2.7向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

3. rRNA去除

3.1瞬离将步骤1中杂交样品离心至管底。

3.2 将步骤2中的链酶亲和素磁珠加入步骤1的样品中,用移液器吹打10次混匀后,置于PCR仪中,按照表3所示反应程序,进行探针捕获。

3 rRNA去除反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

37℃

15 min

50℃

5 min

*立即进入下一步骤

*注:去除反应程序完成后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
3.3 瞬离将反应液离心至管底

3.4 将样品管置于磁力架上,静置2 min。

3.5 待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中。

3.6 将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中(建议)。

4. RNA纯化

4.1 准备工作:将Purification beads由冰箱中取出,室温平衡至少30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。

4.2 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。

4.3 吸取 180 μL Purification beads至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育 5 min。

4.4 将PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3 min),小心移除上清。

4.5 保持PCR管始终置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec 后,小心移除上清。

4.6 重复步骤 4.5,总计漂洗两次。用 10 μL移液器吸干净残留液体。

4.7 保持 PCR 管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠(5~10 min)。

4.8 RNA洗脱:将PCR 管从磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用适合下游实验的相应体积Nuclease free H2O或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min。

4.9 将 PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3 min),小心移取 10 μL上清(可根据步骤4.8选择的实际洗脱体积进行相应调整)至新的Nuclease free PCR 管中。

【注】洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80℃存放。

Ver.CN20230316 

血内寄生虫rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Blood Parasite rRNA Removal Kit

暂无内容

血内寄生虫rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Blood Parasite rRNA Removal Kit

暂无内容

 

Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Blood Parasite) with purification beads是利用链霉亲和素标记的磁珠去除血内寄生虫来源总RNA中的核糖体RNA以保留信使RNA(mRNA)和其他非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析的mRNA和非编码RNA,可显著提高测序结果中有效数据比例,也可用于cDNA合成及其它下游应用。

 

适用范围

适用于血内寄生虫来源的10 ng~1 μg 总RNA样品。

 

产品组分

组分编号和名称

12283ES04

12283ES24

12283ES96

BOX I

12283-A

PM, Probe Mix

13.5 μL

80 μL

317 μL

BOX II

12283-B

HB, Hybridization buffer

25 μL

150 μL

600 μL

12283-C

DB, Depletion buffer

800 μL

4.6 mL

18.5 mL

12283-D

SMB, Streptavidin-coated magnetic beads

176 μL

1056 μL

4.23 mL

12283-E

PB, Purification beads

795 μL

4.75 mL

19 mL

 

储存条件

试剂盒BOXI(Probe Mix)-25~-15℃保存,BOXII2~8℃保存,有效期1年。

 

注意事项

1. 请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。

2. RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。

3. 使用前,磁珠需提前平衡至室温。

4. RNA投入量为10 ng- 1000 ng。

5. 在操作过程种,避免EP管或PCR管管盖开封(孵育过程中)或长时间处于室温状态。

6.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

7.本产品仅用作科研用途!

 

自备材料

1. qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix(No Rox)(Cat#11201)或其他等效产品;

2. 其他材料: 无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

 

操作步骤

1. 探针杂交

1.1 将探针、Streptavidin-coated magnetic beads和杂交Buffer从-20°C 取出,解冻后颠倒混匀,探针置于冰上放置,其余试剂平衡至室温备用。

1.2 准备RNA样品:根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用Nuclease free H2O稀释至12 μL。

1.3 按照表1于200 μL PCR管中配制rRNA去除反应体系。

1 探针杂交反应体系

名称

体积(μL)

Hybridization Buffer

5

Probe Mix

3

Total RNA

12(10 ng~1 μg)

Total

20

1.4 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

1.5 将上述 PCR 管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。

2 探针杂交反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

68℃

10 min

68℃-37℃

0.1℃/s

37℃*

2 min

*注:采用梯度退火之后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
2. 链酶亲和素磁珠准备

2.1低速涡旋振荡链酶亲和素磁珠使磁珠重悬。

2.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

2.3 吸取40 μL Streptavidin-coated magnetic beads于新的PCR管中,将PCR管置于磁力架上,静置2 min;。

2.4待溶液澄清后,去掉所有上清液。

2.5向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

2.6将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,去上清。

2.7向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

3. rRNA去除

3.1瞬离将步骤1中杂交样品离心至管底。

3.2 将步骤2中的链酶亲和素磁珠加入步骤1的样品中,用移液器吹打10次混匀后,置于PCR仪中,按照表3所示反应程序,进行探针捕获。

3 rRNA去除反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

37℃

15 min

50℃

5 min

*立即进入下一步骤

*注:去除反应程序完成后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
3.3 瞬离将反应液离心至管底

3.4 将样品管置于磁力架上,静置2 min。

3.5 待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中。

3.6 将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中(建议)。

4. RNA纯化

4.1 准备工作:将Purification beads由冰箱中取出,室温平衡至少30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。

4.2 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。

4.3 吸取 180 μL Purification beads至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育 5 min。

4.4 将PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3 min),小心移除上清。

4.5 保持PCR管始终置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec 后,小心移除上清。

4.6 重复步骤 4.5,总计漂洗两次。用 10 μL移液器吸干净残留液体。

4.7 保持 PCR 管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠(5~10 min)。

4.8 RNA洗脱:将PCR 管从磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用适合下游实验的相应体积Nuclease free H2O或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min。

4.9 将 PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3 min),小心移取 10 μL上清(可根据步骤4.8选择的实际洗脱体积进行相应调整)至新的Nuclease free PCR 管中。

【注】洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80℃存放。

Ver.CN20230316 

血内寄生虫rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Blood Parasite rRNA Removal Kit

暂无内容

血内寄生虫rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Blood Parasite rRNA Removal Kit

暂无内容

蜜蜂rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Honeybee rRNA Removal Kit

蜜蜂rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Honeybee rRNA Removal Kit

产品说明书

FAQ

COA

已发表文献

 

Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Honeybee) with purification beads是利用链霉亲和素标记的磁珠去除蜜蜂来源总RNA中的核糖体RNA以保留信使RNA(mRNA)和其他非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析的mRNA和非编码RNA,可显著提高测序结果中有效数据比例,也可用于cDNA合成及其它下游应用。

 

适用范围

适用于蜜蜂来源的10 ng~1 μg 总RNA样品。

 

产品组分

组分编号和名称

12285ES04

12285ES24

12285ES96

BOX I

12285-A

PM, Probe Mix

13.5 μL

80 μL

317 μL

BOX II

12285-B

HB, Hybridization buffer

25 μL

150 μL

600 μL

12285-C

DB, Depletion buffer

800 μL

4.6 mL

18.5 mL

12285-D

SMB, Streptavidin-coated magnetic beads

176 μL

1056 μL

4.23 mL

12285-E

PB, Purification beads

795 μL

4.75 mL

19 mL

 

储存条件

试剂盒BOXI(Probe Mix)-25~-15℃保存,BOXII2~8℃保存,有效期1年。

 

注意事项

1. 请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。

2. RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。

3. 使用前,磁珠需提前平衡至室温。

4. RNA投入量为10 ng- 1000 ng。

5. 在操作过程种,避免EP管或PCR管管盖开封(孵育过程中)或长时间处于室温状态。

6.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

7.本产品仅用作科研用途!

 

自备材料

1. qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix(No Rox)(Cat#11201)或其他等效产品;

2. 其他材料: 无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

 

操作步骤

1. 探针杂交

1.1 将探针、Streptavidin-coated magnetic beads和杂交Buffer从-20°C 取出,解冻后颠倒混匀,探针置于冰上放置,其余试剂平衡至室温备用。

1.2 准备RNA样品:根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用Nuclease free H2O稀释至12 μL。

1.3 按照表1于200 μL PCR管中配制rRNA去除反应体系。

1 探针杂交反应体系

名称

体积(μL)

Hybridization Buffer

5

Probe Mix

3

Total RNA

12(10 ng~1 μg)

Total

20

1.4 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

1.5 将上述 PCR 管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。

2 探针杂交反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

68℃

10 min

68℃-37℃

0.1℃/s

37℃*

2 min

*注:采用梯度退火之后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
2. 链酶亲和素磁珠准备

2.1低速涡旋振荡链酶亲和素磁珠使磁珠重悬。

2.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

2.3 吸取40 μL Streptavidin-coated magnetic beads于新的PCR管中,将PCR管置于磁力架上,静置2 min;。

2.4待溶液澄清后,去掉所有上清液。

2.5向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

2.6将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,去上清。

2.7向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

3. rRNA去除

3.1瞬离将步骤1中杂交样品离心至管底。

3.2 将步骤2中的链酶亲和素磁珠加入步骤1的样品中,用移液器吹打10次混匀后,置于PCR仪中,按照表3所示反应程序,进行探针捕获。

3 rRNA去除反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

37℃

15 min

50℃

5 min

*立即进入下一步骤

*注:去除反应程序完成后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
3.3 瞬离将反应液离心至管底

3.4 将样品管置于磁力架上,静置2 min。

3.5 待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中。

3.6 将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中(建议)。

4. RNA纯化

4.1 准备工作:将Purification beads由冰箱中取出,室温平衡至少30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。

4.2 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。

4.3 吸取 180 μL Purification beads至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育 5 min。

4.4 将PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3 min),小心移除上清。

4.5 保持PCR管始终置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec 后,小心移除上清。

4.6 重复步骤 4.5,总计漂洗两次。用 10 μL移液器吸干净残留液体。

4.7 保持 PCR 管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠(5~10 min)。

4.8 RNA洗脱:将PCR 管从磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用适合下游实验的相应体积Nuclease free H2O或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min。

4.9 将 PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3 min),小心移取 10 μL上清(可根据步骤4.8选择的实际洗脱体积进行相应调整)至新的Nuclease free PCR 管中。

【注】洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80℃存放。

Ver.CN20230316 

蜜蜂rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Honeybee rRNA Removal Kit

暂无内容

蜜蜂rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Honeybee rRNA Removal Kit

暂无内容

 

Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Honeybee) with purification beads是利用链霉亲和素标记的磁珠去除蜜蜂来源总RNA中的核糖体RNA以保留信使RNA(mRNA)和其他非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析的mRNA和非编码RNA,可显著提高测序结果中有效数据比例,也可用于cDNA合成及其它下游应用。

 

适用范围

适用于蜜蜂来源的10 ng~1 μg 总RNA样品。

 

产品组分

组分编号和名称

12285ES04

12285ES24

12285ES96

BOX I

12285-A

PM, Probe Mix

13.5 μL

80 μL

317 μL

BOX II

12285-B

HB, Hybridization buffer

25 μL

150 μL

600 μL

12285-C

DB, Depletion buffer

800 μL

4.6 mL

18.5 mL

12285-D

SMB, Streptavidin-coated magnetic beads

176 μL

1056 μL

4.23 mL

12285-E

PB, Purification beads

795 μL

4.75 mL

19 mL

 

储存条件

试剂盒BOXI(Probe Mix)-25~-15℃保存,BOXII2~8℃保存,有效期1年。

 

注意事项

1. 请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。

2. RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。

3. 使用前,磁珠需提前平衡至室温。

4. RNA投入量为10 ng- 1000 ng。

5. 在操作过程种,避免EP管或PCR管管盖开封(孵育过程中)或长时间处于室温状态。

6.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

7.本产品仅用作科研用途!

 

自备材料

1. qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix(No Rox)(Cat#11201)或其他等效产品;

2. 其他材料: 无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

 

操作步骤

1. 探针杂交

1.1 将探针、Streptavidin-coated magnetic beads和杂交Buffer从-20°C 取出,解冻后颠倒混匀,探针置于冰上放置,其余试剂平衡至室温备用。

1.2 准备RNA样品:根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用Nuclease free H2O稀释至12 μL。

1.3 按照表1于200 μL PCR管中配制rRNA去除反应体系。

1 探针杂交反应体系

名称

体积(μL)

Hybridization Buffer

5

Probe Mix

3

Total RNA

12(10 ng~1 μg)

Total

20

1.4 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

1.5 将上述 PCR 管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。

2 探针杂交反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

68℃

10 min

68℃-37℃

0.1℃/s

37℃*

2 min

*注:采用梯度退火之后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
2. 链酶亲和素磁珠准备

2.1低速涡旋振荡链酶亲和素磁珠使磁珠重悬。

2.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

2.3 吸取40 μL Streptavidin-coated magnetic beads于新的PCR管中,将PCR管置于磁力架上,静置2 min;。

2.4待溶液澄清后,去掉所有上清液。

2.5向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

2.6将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,去上清。

2.7向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

3. rRNA去除

3.1瞬离将步骤1中杂交样品离心至管底。

3.2 将步骤2中的链酶亲和素磁珠加入步骤1的样品中,用移液器吹打10次混匀后,置于PCR仪中,按照表3所示反应程序,进行探针捕获。

3 rRNA去除反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

37℃

15 min

50℃

5 min

*立即进入下一步骤

*注:去除反应程序完成后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
3.3 瞬离将反应液离心至管底

3.4 将样品管置于磁力架上,静置2 min。

3.5 待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中。

3.6 将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中(建议)。

4. RNA纯化

4.1 准备工作:将Purification beads由冰箱中取出,室温平衡至少30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。

4.2 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。

4.3 吸取 180 μL Purification beads至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育 5 min。

4.4 将PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3 min),小心移除上清。

4.5 保持PCR管始终置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec 后,小心移除上清。

4.6 重复步骤 4.5,总计漂洗两次。用 10 μL移液器吸干净残留液体。

4.7 保持 PCR 管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠(5~10 min)。

4.8 RNA洗脱:将PCR 管从磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用适合下游实验的相应体积Nuclease free H2O或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min。

4.9 将 PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3 min),小心移取 10 μL上清(可根据步骤4.8选择的实际洗脱体积进行相应调整)至新的Nuclease free PCR 管中。

【注】洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80℃存放。

Ver.CN20230316 

蜜蜂rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Honeybee rRNA Removal Kit

暂无内容

蜜蜂rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Honeybee rRNA Removal Kit

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MaxUp核糖体RNA去除试剂盒(Human rRNA&ITS/ETS)|Hieff NGS MaxUp Human rRNA Depletion Kit(rRNA & ITS/ETS)

MaxUp核糖体RNA去除试剂盒(Human rRNA&ITS/ETS)|Hieff NGS MaxUp Human rRNA Depletion Kit(rRNA & ITS/ETS)

产品说明书

FAQ

COA

已发表文献

Hieff NGS® MaxUp Human rRNA Depletion Kit (rRNA & ITS/ETS)利用RNase H消化法去除人小鼠和大鼠来源RNA中的核糖体RNA45S ITS/ETS区域以保留信使RNA (mRNA)和其它非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA(如FFPE RNA)均具有良好的rRNA去除效果。由于降解的FFPE样本相比新鲜组织样本通常含有较高比例的ITS/ETS,该试剂盒人、小鼠和大鼠45S ITS/ETS区域的探针,经该试剂盒去除后可显著提高测序结果中有效数据比例。

适用范围
适用于人小鼠和大鼠来源100 ng~1 μgRNA样品;适用于完整或部分降解RNA(如FFPE RNA)样品。

产品组分

组分编号和名称

12257ES24

12257ES96

12257-A

MaxUp核糖体RNA去除试剂盒(Human rRNA&ITS/ETS)|Hieff NGS MaxUp Human rRNA Depletion Kit(rRNA & ITS/ETS)

Hybridization Buffer

72 μL

288 μL

12257-B

MaxUp核糖体RNA去除试剂盒(Human rRNA&ITS/ETS)|Hieff NGS MaxUp Human rRNA Depletion Kit(rRNA & ITS/ETS)

Human Probe Mix (rRNA & ITS/ETS)

48 μL

192 μL

12257-C

MaxUp核糖体RNA去除试剂盒(Human rRNA&ITS/ETS)|Hieff NGS MaxUp Human rRNA Depletion Kit(rRNA & ITS/ETS)

RNase H Buffer

72 μL

288 μL

12257-D

MaxUp核糖体RNA去除试剂盒(Human rRNA&ITS/ETS)|Hieff NGS MaxUp Human rRNA Depletion Kit(rRNA & ITS/ETS)

RNase H

48 μL

192 μL

12257-E

MaxUp核糖体RNA去除试剂盒(Human rRNA&ITS/ETS)|Hieff NGS MaxUp Human rRNA Depletion Kit(rRNA & ITS/ETS)

DNase I Buffer

660 μL

2×1320 μL

12257-F

MaxUp核糖体RNA去除试剂盒(Human rRNA&ITS/ETS)|Hieff NGS MaxUp Human rRNA Depletion Kit(rRNA & ITS/ETS)

DNase I

60 μL

240 μL

运输与保存方法
干冰运输,
-20 °C存放。有效期1年。

注意事项

1. 请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM 高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。

2. RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。

3. RNA样品最大投入体积为10 μL,若样品体积较大,可先进行浓缩。
4. RNase H 消化步骤如需配Mix使用,请现配现用。

5. 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

6. 本产品仅作科研用途!

自备材料

1. RNA纯化磁珠:Hieff NGS® Cleaner (Cat#12602)或其他等效产品。

2. qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix (No Rox) (Cat#11201)或其他等效产品

3. 其他材料: 无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

操作步骤

1. 探针杂交
 

1.1 将探针和杂交Buffer-20 °C 取出,解冻后颠倒混匀,置于冰上备用。

1.2 准备RNA样品:根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用Nuclease free H2O稀释至10 μL

1.3 按照表1200 μL PCR管中配制rRNA去除反应体系。

1 探针杂交反应体系

名称

体积 (μL)

Hybridization Buffer

3

Human Probe Mix (rRNA&ITS/ETS)

2

Total RNA

10 (100 ng~1 μg)

Total

15

1.4 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

1.5 将上述 PCR 管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。

2 探针杂交反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

95 °C

2 min

95 °C-22 °C

0.1 °C/s

22 °C

5 min

4 °C

hold

2. RNase H消化
 

2.1 RNase H消化试剂从-20 °C取出,解冻后颠倒混匀,置于冰上备用。按照表 3 所示,配制RNase H消化反应体系。

3 RNase H消化反应体系

名称

体积 (μL)

RNase H Buffer

3

RNase H

2

上步产物

15

Total

20

注:RNase H BufferRNase H需单独添加,若因样本量较多需配置mix,请现配现用,否则会影响去除效果。

2.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

2.3 将上述 PCR 管置于PCR仪中,设置反应程序:热盖50 °C37 °C30 min4 °Chold,进行RNase H消化反应。

3. DNase I 消化
 

3.1 DNase I消化试剂从-20 °C 取出,解冻后颠倒混匀,置于冰上备用。按照表4所示,配制DNase I消化反应体系。

4 DNase I消化反应体系

名称

体积 (μL)

DNase I Buffer

27.5

DNase I

2.5

上一步产物

20

Total

50

3.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

3.3 将上述 PCR 管置于PCR仪中,设置反应程序:热盖50 °C37 °C30 min4 °Chold,进行DNase I消化反应。

4. RNA纯化
 

4.1 准备工作:将Hieff NGS® RNA Cleaner (Cat#12602)磁珠由冰箱中取出,室温平衡至少 30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。

4.2 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。

4.3 吸取110 μL Hieff NGS® RNA Cleaner (2.2×Beads:DNA=2.2:1)至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育 5 min

4.4 PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3 min),小心移除上清。

4.5 保持PCR管始终置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec 后,小心移除上清。

4.6 重复步骤 4.5,总计漂洗两次。用 10 μL移液器吸干净残留液体。

4.7 保持PCR 管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠 (5~10 min)

4.8 RNA洗脱:将PCR 管从磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用适合下游实验的相应体积Nuclease free H2O或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min

4.9 PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3 min),小心移取10 μL上清(可根据步骤4.7选择的实际洗脱体积进行相应调整)至新的Nuclease free PCR 管中。

【注】洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80 °C存放。

案例展示
不同Human RNA样本分别不含ITS/ETS去除rRNA、使用ITS/ETSCat#12257去除rRNAITS/ETS后衔接RNA建库试剂盒进行文库构建,经测序分析rRNAITS/ETS在下机数据中的占比。

表:不同RNA质量样本使用含或者不含ITS/ETS探针的测试数据展示

RNA质量

去除方案

Input

rRNA (%)

ITS/ETS (%)

Mapping (%)

293T RNA; RIN=10

去除rRNA

1 μg

0.19

4.6

98.28

去除rRNAITS/ETS

1 μg

0.15

0.04

98.79

FFPE RNA
DV200 =90%

去除rRNA

500 ng

0.23

4.75

95.35

去除rRNAITS/ETS

500 ng

0.21

0.02

95.42

FFPE RNA
DV200 =50%

去除rRNA

500 ng

1.4

16.28

95.57

去除rRNAITS/ETS

500 ng

0.56

0.11

95.51

FFPE RNA
DV200 =20%

去除rRNA

1 μg

0.35

67.61

58.4

去除rRNAITS/ETS

1 μg

0.79

0.84

60.35

 

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建库试剂盒

产品编号

规格

Hieff NGS® Ultima DNA Library Prep Kit for Illumina®

12199ES24/96

24/96 T

Hieff NGS® MaxUpⅡ DNA Library Prep Kit for Illumina®

12200ES24/96

24/96 T

Hieff NGS® OnePot DNA Library Prep Kit for Illumina®

12205ES24/96

24/96 T

Hieff NGS® OnePotⅡ DNA Library Prep Kit for Illumina®

12204ES24/96

24/96 T

Hieff NGS® Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina®

12206/7ES24/96

24/96 T

Hieff NGS® MaxUpⅡ Dual-mode RNA Library Prep Kit

12308ES24/96

24/96 T

Hieff NGS® MaxUpⅡ Dual-mode mRNA Library Prep Kit

12309ES24/96

24/96 T

文库构建磁珠

产品编号

规格

Hieff NGS® Smarter DNA Clean beads (>50 bp)

12600ES08/56

5/60 mL

Hieff NGS® DNA Selection Beads (Superior AMPure XP alternative)

12601ES08/56

5/60 mL

Hieff NGS® RNA Cleaner

12602ES08/56

5/60 mL

Hieff NGS® mRNA Isolation Master Kit

12603ES24/96

24/96 T

建库接头

产品编号

规格

Hieff NGS® 96 Single Index Primer Kit for Illumina®, Set 1/2

12611/12612ES02

48×2 T

Hieff NGS® 384 Dual Index Primer Kit for Illumina®, Set 1/2

12412/12413ES02

96×2 T

Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina®, Set 1/2

12615/12616ES04/16

12×4/12×16 T

Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina®, Set 3/4

12617/12618ES04/16

12×4/12×16 T

Hieff NGS® Tagment Index Kit for Illumina®, (96 Index)

12416ES96/384

96 T/384 T

建库模块

产品编号

规格

Hieff NGS® Fast-Pace DNA Fragmentation Reagent

12609ES24/96

24/96 T

Hieff NGS® Ultima DNA Ligation Module

12604ES24/96

24/96 T

Hieff NGS® Ultima Endprep Mix

12605ES24/96

24/96 T

Hieff NGS® Fast-Pace DNA Ligation Module

12607ES24/96

24/96 T

Hieff NGS® Fast-Pace End Repair/dA-Tailing Module

12608ES24/96

24/96 T

2×Ultima Amplification Mix

12620ES24/96

24/96 T

2×Super Canace® High-Fidelity Mix

12621ES03/08

24/96 T

Hieff NGS® Dual-Mode cDNA Synthesis Kit

12250ES24/96

24/96 T

Hieff NGS® FFPE DNA Repair Reagent

12606ES24/96

24/96 T

文库定量

产品编号

规格

Hieff NGS® Library Quantification Kit for Illumina®, qPCR Master Mix

12302ES05

500 T

Hieff NGS® Library Quantification Kit for Illumina®, DNA Standard (1-6)

12307ES09

6×96 μL

dsDNA HS Assay Kit for Qubit® 

12640ES60/76

100/500 T

多重PCR定制咨询

NGS建库原料酶咨询

HB220923

 

Q:12257去除rRNA有残留?

A:(1)RNase H Buf&RNase H混Mix放置稳定性较差,建议RNase H消化步骤单加或配Mix现配现用(配置好后10min内用完);(2)混匀不彻底导致rRNA残留,建议使用振荡器“隔手轻振”的方式混匀样品。

Q:RNaseH单酶稳定性如何?4℃放置会影响rRNA去除效果吗?

A:RNaseH单酶稳定性良好,翌圣测试4℃放置11天rRNA去除效果仍然正常。

[1]Liu Y, Han R, Zhou L, et al. Comparative performance of the GenoLab M and NovaSeq 6000 sequencing platforms for transcriptome and LncRNA analysis [published correction appears in BMC Genomics. 2022 Jan 26;23(1):81]. BMC Genomics. 2021;22(1):829. Published 2021 Nov 17. doi:10.1186/s12864-021-08150-8(IF:4.547)

[2]Li M, Guo D, Chen X, Lu X, Huang X, Wu Y. Transcriptome profiling and co-expression network analysis of lncRNAs and mRNAs in colorectal cancer by RNA sequencing. BMC Cancer. 2022;22(1):780. Published 2022 Jul 16. doi:10.1186/s12885-022-09878-6(IF:4.638)

Hieff NGS® MaxUp Human rRNA Depletion Kit (rRNA & ITS/ETS)利用RNase H消化法去除人小鼠和大鼠来源RNA中的核糖体RNA45S ITS/ETS区域以保留信使RNA (mRNA)和其它非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA(如FFPE RNA)均具有良好的rRNA去除效果。由于降解的FFPE样本相比新鲜组织样本通常含有较高比例的ITS/ETS,该试剂盒人、小鼠和大鼠45S ITS/ETS区域的探针,经该试剂盒去除后可显著提高测序结果中有效数据比例。

适用范围
适用于人小鼠和大鼠来源100 ng~1 μgRNA样品;适用于完整或部分降解RNA(如FFPE RNA)样品。

产品组分

组分编号和名称

12257ES24

12257ES96

12257-A

MaxUp核糖体RNA去除试剂盒(Human rRNA&ITS/ETS)|Hieff NGS MaxUp Human rRNA Depletion Kit(rRNA & ITS/ETS)

Hybridization Buffer

72 μL

288 μL

12257-B

MaxUp核糖体RNA去除试剂盒(Human rRNA&ITS/ETS)|Hieff NGS MaxUp Human rRNA Depletion Kit(rRNA & ITS/ETS)

Human Probe Mix (rRNA & ITS/ETS)

48 μL

192 μL

12257-C

MaxUp核糖体RNA去除试剂盒(Human rRNA&ITS/ETS)|Hieff NGS MaxUp Human rRNA Depletion Kit(rRNA & ITS/ETS)

RNase H Buffer

72 μL

288 μL

12257-D

MaxUp核糖体RNA去除试剂盒(Human rRNA&ITS/ETS)|Hieff NGS MaxUp Human rRNA Depletion Kit(rRNA & ITS/ETS)

RNase H

48 μL

192 μL

12257-E

MaxUp核糖体RNA去除试剂盒(Human rRNA&ITS/ETS)|Hieff NGS MaxUp Human rRNA Depletion Kit(rRNA & ITS/ETS)

DNase I Buffer

660 μL

2×1320 μL

12257-F

MaxUp核糖体RNA去除试剂盒(Human rRNA&ITS/ETS)|Hieff NGS MaxUp Human rRNA Depletion Kit(rRNA & ITS/ETS)

DNase I

60 μL

240 μL

运输与保存方法
干冰运输,
-20 °C存放。有效期1年。

注意事项

1. 请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM 高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。

2. RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。

3. RNA样品最大投入体积为10 μL,若样品体积较大,可先进行浓缩。
4. RNase H 消化步骤如需配Mix使用,请现配现用。

5. 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

6. 本产品仅作科研用途!

自备材料

1. RNA纯化磁珠:Hieff NGS® Cleaner (Cat#12602)或其他等效产品。

2. qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix (No Rox) (Cat#11201)或其他等效产品

3. 其他材料: 无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

操作步骤

1. 探针杂交
 

1.1 将探针和杂交Buffer-20 °C 取出,解冻后颠倒混匀,置于冰上备用。

1.2 准备RNA样品:根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用Nuclease free H2O稀释至10 μL

1.3 按照表1200 μL PCR管中配制rRNA去除反应体系。

1 探针杂交反应体系

名称

体积 (μL)

Hybridization Buffer

3

Human Probe Mix (rRNA&ITS/ETS)

2

Total RNA

10 (100 ng~1 μg)

Total

15

1.4 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

1.5 将上述 PCR 管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。

2 探针杂交反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

95 °C

2 min

95 °C-22 °C

0.1 °C/s

22 °C

5 min

4 °C

hold

2. RNase H消化
 

2.1 RNase H消化试剂从-20 °C取出,解冻后颠倒混匀,置于冰上备用。按照表 3 所示,配制RNase H消化反应体系。

3 RNase H消化反应体系

名称

体积 (μL)

RNase H Buffer

3

RNase H

2

上步产物

15

Total

20

注:RNase H BufferRNase H需单独添加,若因样本量较多需配置mix,请现配现用,否则会影响去除效果。

2.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

2.3 将上述 PCR 管置于PCR仪中,设置反应程序:热盖50 °C37 °C30 min4 °Chold,进行RNase H消化反应。

3. DNase I 消化
 

3.1 DNase I消化试剂从-20 °C 取出,解冻后颠倒混匀,置于冰上备用。按照表4所示,配制DNase I消化反应体系。

4 DNase I消化反应体系

名称

体积 (μL)

DNase I Buffer

27.5

DNase I

2.5

上一步产物

20

Total

50

3.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

3.3 将上述 PCR 管置于PCR仪中,设置反应程序:热盖50 °C37 °C30 min4 °Chold,进行DNase I消化反应。

4. RNA纯化
 

4.1 准备工作:将Hieff NGS® RNA Cleaner (Cat#12602)磁珠由冰箱中取出,室温平衡至少 30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。

4.2 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。

4.3 吸取110 μL Hieff NGS® RNA Cleaner (2.2×Beads:DNA=2.2:1)至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育 5 min

4.4 PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3 min),小心移除上清。

4.5 保持PCR管始终置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec 后,小心移除上清。

4.6 重复步骤 4.5,总计漂洗两次。用 10 μL移液器吸干净残留液体。

4.7 保持PCR 管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠 (5~10 min)

4.8 RNA洗脱:将PCR 管从磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用适合下游实验的相应体积Nuclease free H2O或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min

4.9 PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3 min),小心移取10 μL上清(可根据步骤4.7选择的实际洗脱体积进行相应调整)至新的Nuclease free PCR 管中。

【注】洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80 °C存放。

案例展示
不同Human RNA样本分别不含ITS/ETS去除rRNA、使用ITS/ETSCat#12257去除rRNAITS/ETS后衔接RNA建库试剂盒进行文库构建,经测序分析rRNAITS/ETS在下机数据中的占比。

表:不同RNA质量样本使用含或者不含ITS/ETS探针的测试数据展示

RNA质量

去除方案

Input

rRNA (%)

ITS/ETS (%)

Mapping (%)

293T RNA; RIN=10

去除rRNA

1 μg

0.19

4.6

98.28

去除rRNAITS/ETS

1 μg

0.15

0.04

98.79

FFPE RNA
DV200 =90%

去除rRNA

500 ng

0.23

4.75

95.35

去除rRNAITS/ETS

500 ng

0.21

0.02

95.42

FFPE RNA
DV200 =50%

去除rRNA

500 ng

1.4

16.28

95.57

去除rRNAITS/ETS

500 ng

0.56

0.11

95.51

FFPE RNA
DV200 =20%

去除rRNA

1 μg

0.35

67.61

58.4

去除rRNAITS/ETS

1 μg

0.79

0.84

60.35

 

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12308ES24/96

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产品编号

规格

Hieff NGS® Smarter DNA Clean beads (>50 bp)

12600ES08/56

5/60 mL

Hieff NGS® DNA Selection Beads (Superior AMPure XP alternative)

12601ES08/56

5/60 mL

Hieff NGS® RNA Cleaner

12602ES08/56

5/60 mL

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12603ES24/96

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12611/12612ES02

48×2 T

Hieff NGS® 384 Dual Index Primer Kit for Illumina®, Set 1/2

12412/12413ES02

96×2 T

Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina®, Set 1/2

12615/12616ES04/16

12×4/12×16 T

Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina®, Set 3/4

12617/12618ES04/16

12×4/12×16 T

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12416ES96/384

96 T/384 T

建库模块

产品编号

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Hieff NGS® Fast-Pace DNA Fragmentation Reagent

12609ES24/96

24/96 T

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12604ES24/96

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Hieff NGS® Ultima Endprep Mix

12605ES24/96

24/96 T

Hieff NGS® Fast-Pace DNA Ligation Module

12607ES24/96

24/96 T

Hieff NGS® Fast-Pace End Repair/dA-Tailing Module

12608ES24/96

24/96 T

2×Ultima Amplification Mix

12620ES24/96

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2×Super Canace® High-Fidelity Mix

12621ES03/08

24/96 T

Hieff NGS® Dual-Mode cDNA Synthesis Kit

12250ES24/96

24/96 T

Hieff NGS® FFPE DNA Repair Reagent

12606ES24/96

24/96 T

文库定量

产品编号

规格

Hieff NGS® Library Quantification Kit for Illumina®, qPCR Master Mix

12302ES05

500 T

Hieff NGS® Library Quantification Kit for Illumina®, DNA Standard (1-6)

12307ES09

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12640ES60/76

100/500 T

多重PCR定制咨询

NGS建库原料酶咨询

HB220923

 

Q:12257去除rRNA有残留?

A:(1)RNase H Buf&RNase H混Mix放置稳定性较差,建议RNase H消化步骤单加或配Mix现配现用(配置好后10min内用完);(2)混匀不彻底导致rRNA残留,建议使用振荡器“隔手轻振”的方式混匀样品。

Q:RNaseH单酶稳定性如何?4℃放置会影响rRNA去除效果吗?

A:RNaseH单酶稳定性良好,翌圣测试4℃放置11天rRNA去除效果仍然正常。

[1]Liu Y, Han R, Zhou L, et al. Comparative performance of the GenoLab M and NovaSeq 6000 sequencing platforms for transcriptome and LncRNA analysis [published correction appears in BMC Genomics. 2022 Jan 26;23(1):81]. BMC Genomics. 2021;22(1):829. Published 2021 Nov 17. doi:10.1186/s12864-021-08150-8(IF:4.547)

[2]Li M, Guo D, Chen X, Lu X, Huang X, Wu Y. Transcriptome profiling and co-expression network analysis of lncRNAs and mRNAs in colorectal cancer by RNA sequencing. BMC Cancer. 2022;22(1):780. Published 2022 Jul 16. doi:10.1186/s12885-022-09878-6(IF:4.638)

放线菌rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Actinomycetes rRNA Removal Kit

放线菌rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Actinomycetes rRNA Removal Kit

产品说明书

FAQ

COA

已发表文献

 

Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Actinomycetes) with purification beads是利用链霉亲和素标记的磁珠去除放线菌来源总RNA中的核糖体RNA以保留信使RNA(mRNA)和其他非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析的mRNA和非编码RNA,可显著提高测序结果中有效数据比例,也可用于cDNA合成及其它下游应用。

 

适用范围

适用于放线菌来源的10 ng~1 μg 总RNA样品。

 

产品组分

组分编号和名称

12279ES04

12279ES24

12279ES96

BOX I

12279-A

PM, Probe Mix

13.5 μL

80 μL

317 μL

BOX II

12279-B

HB, Hybridization buffer

25 μL

150 μL

600 μL

12279-C

DB, Depletion buffer

800 μL

4.6 mL

18.5 mL

12279-D

SMB, Streptavidin-coated magnetic beads

176 μL

1056 μL

4.23 mL

12279-E

PB, Purification beads

795 μL

4.75 mL

19 mL

 

储存条件

试剂盒BOXI(Probe Mix)-25~-15℃保存,BOXII2~8℃保存,有效期1年。

 

注意事项

1. 请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。

2. RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。

3. 使用前,磁珠需提前平衡至室温。

4. RNA投入量为10 ng- 1000 ng。

5. 在操作过程种,避免EP管或PCR管管盖开封(孵育过程中)或长时间处于室温状态。

6.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

7.本产品仅用作科研用途!

 

自备材料

1. qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix(No Rox)(Cat#11201)或其他等效产品;

2. 其他材料: 无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

 

操作步骤

1. 探针杂交

1.1 将探针、Streptavidin-coated magnetic beads和杂交Buffer从-20°C 取出,解冻后颠倒混匀,探针置于冰上放置,其余试剂平衡至室温备用。

1.2 准备RNA样品:根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用Nuclease free H2O稀释至12 μL。

1.3 按照表1于200 μL PCR管中配制rRNA去除反应体系。

1 探针杂交反应体系

名称

体积(μL)

Hybridization Buffer

5

Probe Mix

3

Total RNA

12(10 ng~1 μg)

Total

20

1.4 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

1.5 将上述 PCR 管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。

2 探针杂交反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

68℃

10 min

68℃-37℃

0.1℃/s

37℃*

2 min

*注:采用梯度退火之后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
2. 链酶亲和素磁珠准备

2.1低速涡旋振荡链酶亲和素磁珠使磁珠重悬。

2.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

2.3 吸取40 μL Streptavidin-coated magnetic beads于新的PCR管中,将PCR管置于磁力架上,静置2 min;。

2.4待溶液澄清后,去掉所有上清液。

2.5向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

2.6将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,去上清。

2.7向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

3. rRNA去除

3.1瞬离将步骤1中杂交样品离心至管底。

3.2 将步骤2中的链酶亲和素磁珠加入步骤1的样品中,用移液器吹打10次混匀后,置于PCR仪中,按照表3所示反应程序,进行探针捕获。

3 rRNA去除反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

37℃

15 min

50℃

5 min

*立即进入下一步骤

*注:去除反应程序完成后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
3.3 瞬离将反应液离心至管底

3.4 将样品管置于磁力架上,静置2 min。

3.5 待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中。

3.6 将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中(建议)。

4. RNA纯化

4.1 准备工作:将Purification beads由冰箱中取出,室温平衡至少30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。

4.2 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。

4.3 吸取 180 μL Purification beads至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育 5 min。

4.4 将PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3 min),小心移除上清。

4.5 保持PCR管始终置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec 后,小心移除上清。

4.6 重复步骤 4.5,总计漂洗两次。用 10 μL移液器吸干净残留液体。

4.7 保持 PCR 管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠(5~10 min)。

4.8 RNA洗脱:将PCR 管从磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用适合下游实验的相应体积Nuclease free H2O或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min。

4.9 将 PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3 min),小心移取 10 μL上清(可根据步骤4.8选择的实际洗脱体积进行相应调整)至新的Nuclease free PCR 管中。

【注】洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80℃存放。

Ver.CN20230316  

放线菌rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Actinomycetes rRNA Removal Kit

暂无内容

放线菌rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Actinomycetes rRNA Removal Kit

暂无内容

 

Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Actinomycetes) with purification beads是利用链霉亲和素标记的磁珠去除放线菌来源总RNA中的核糖体RNA以保留信使RNA(mRNA)和其他非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析的mRNA和非编码RNA,可显著提高测序结果中有效数据比例,也可用于cDNA合成及其它下游应用。

 

适用范围

适用于放线菌来源的10 ng~1 μg 总RNA样品。

 

产品组分

组分编号和名称

12279ES04

12279ES24

12279ES96

BOX I

12279-A

PM, Probe Mix

13.5 μL

80 μL

317 μL

BOX II

12279-B

HB, Hybridization buffer

25 μL

150 μL

600 μL

12279-C

DB, Depletion buffer

800 μL

4.6 mL

18.5 mL

12279-D

SMB, Streptavidin-coated magnetic beads

176 μL

1056 μL

4.23 mL

12279-E

PB, Purification beads

795 μL

4.75 mL

19 mL

 

储存条件

试剂盒BOXI(Probe Mix)-25~-15℃保存,BOXII2~8℃保存,有效期1年。

 

注意事项

1. 请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。

2. RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。

3. 使用前,磁珠需提前平衡至室温。

4. RNA投入量为10 ng- 1000 ng。

5. 在操作过程种,避免EP管或PCR管管盖开封(孵育过程中)或长时间处于室温状态。

6.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

7.本产品仅用作科研用途!

 

自备材料

1. qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix(No Rox)(Cat#11201)或其他等效产品;

2. 其他材料: 无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

 

操作步骤

1. 探针杂交

1.1 将探针、Streptavidin-coated magnetic beads和杂交Buffer从-20°C 取出,解冻后颠倒混匀,探针置于冰上放置,其余试剂平衡至室温备用。

1.2 准备RNA样品:根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用Nuclease free H2O稀释至12 μL。

1.3 按照表1于200 μL PCR管中配制rRNA去除反应体系。

1 探针杂交反应体系

名称

体积(μL)

Hybridization Buffer

5

Probe Mix

3

Total RNA

12(10 ng~1 μg)

Total

20

1.4 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

1.5 将上述 PCR 管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。

2 探针杂交反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

68℃

10 min

68℃-37℃

0.1℃/s

37℃*

2 min

*注:采用梯度退火之后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
2. 链酶亲和素磁珠准备

2.1低速涡旋振荡链酶亲和素磁珠使磁珠重悬。

2.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

2.3 吸取40 μL Streptavidin-coated magnetic beads于新的PCR管中,将PCR管置于磁力架上,静置2 min;。

2.4待溶液澄清后,去掉所有上清液。

2.5向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

2.6将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,去上清。

2.7向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

3. rRNA去除

3.1瞬离将步骤1中杂交样品离心至管底。

3.2 将步骤2中的链酶亲和素磁珠加入步骤1的样品中,用移液器吹打10次混匀后,置于PCR仪中,按照表3所示反应程序,进行探针捕获。

3 rRNA去除反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

37℃

15 min

50℃

5 min

*立即进入下一步骤

*注:去除反应程序完成后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
3.3 瞬离将反应液离心至管底

3.4 将样品管置于磁力架上,静置2 min。

3.5 待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中。

3.6 将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中(建议)。

4. RNA纯化

4.1 准备工作:将Purification beads由冰箱中取出,室温平衡至少30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。

4.2 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。

4.3 吸取 180 μL Purification beads至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育 5 min。

4.4 将PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3 min),小心移除上清。

4.5 保持PCR管始终置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec 后,小心移除上清。

4.6 重复步骤 4.5,总计漂洗两次。用 10 μL移液器吸干净残留液体。

4.7 保持 PCR 管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠(5~10 min)。

4.8 RNA洗脱:将PCR 管从磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用适合下游实验的相应体积Nuclease free H2O或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min。

4.9 将 PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3 min),小心移取 10 μL上清(可根据步骤4.8选择的实际洗脱体积进行相应调整)至新的Nuclease free PCR 管中。

【注】洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80℃存放。

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放线菌rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Actinomycetes rRNA Removal Kit

暂无内容

放线菌rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Actinomycetes rRNA Removal Kit

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果蝇rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Drosophila rRNA Removal Kit

果蝇rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Drosophila rRNA Removal Kit

产品说明书

FAQ

COA

已发表文献

 

Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Drosophila) with purification beads是利用链霉亲和素标记的磁珠去除果蝇来源总RNA中的核糖体RNA以保留信使RNA(mRNA)和其他非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析的mRNA和非编码RNA,可显著提高测序结果中有效数据比例,也可用于cDNA合成及其它下游应用。

 

适用范围

适用于果蝇来源的10 ng~1 μg 总RNA样品。

 

产品组分

组分编号和名称

12288ES04

12288ES24

12288ES96

BOX I

12288-A

PM, Probe Mix

13.5 μL

80 μL

317 μL

BOX II

12288-B

HB, Hybridization buffer

25 μL

150 μL

600 μL

12288-C

DB, Depletion buffer

800 μL

4.6 mL

18.5 mL

12288-D

SMB, Streptavidin-coated magnetic beads

176 μL

1056 μL

4.23 mL

12288-E

PB, Purification beads

795 μL

4.75 mL

19 mL

 

储存条件

试剂盒BOXI(Probe Mix)-25~-15℃保存,BOXII2~8℃保存,有效期1年。

 

注意事项

1. 请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。

2. RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。

3. 使用前,磁珠需提前平衡至室温。

4. RNA投入量为10 ng- 1000 ng。

5. 在操作过程种,避免EP管或PCR管管盖开封(孵育过程中)或长时间处于室温状态。

6.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

7.本产品仅用作科研用途!

 

自备材料

1. qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix(No Rox)(Cat#11201)或其他等效产品;

2. 其他材料: 无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

 

操作步骤

1. 探针杂交

1.1 将探针、Streptavidin-coated magnetic beads和杂交Buffer从-20°C 取出,解冻后颠倒混匀,探针置于冰上放置,其余试剂平衡至室温备用。

1.2 准备RNA样品:根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用Nuclease free H2O稀释至12 μL。

1.3 按照表1于200 μL PCR管中配制rRNA去除反应体系。

1 探针杂交反应体系

名称

体积(μL)

Hybridization Buffer

5

Probe Mix

3

Total RNA

12(10 ng~1 μg)

Total

20

1.4 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

1.5 将上述 PCR 管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。

2 探针杂交反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

68℃

10 min

68℃-37℃

0.1℃/s

37℃*

2 min

*注:采用梯度退火之后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
2. 链酶亲和素磁珠准备

2.1低速涡旋振荡链酶亲和素磁珠使磁珠重悬。

2.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

2.3 吸取40 μL Streptavidin-coated magnetic beads于新的PCR管中,将PCR管置于磁力架上,静置2 min;。

2.4待溶液澄清后,去掉所有上清液。

2.5向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

2.6将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,去上清。

2.7向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

3. rRNA去除

3.1瞬离将步骤1中杂交样品离心至管底。

3.2 将步骤2中的链酶亲和素磁珠加入步骤1的样品中,用移液器吹打10次混匀后,置于PCR仪中,按照表3所示反应程序,进行探针捕获。

3 rRNA去除反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

37℃

15 min

50℃

5 min

*立即进入下一步骤

*注:去除反应程序完成后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
3.3 瞬离将反应液离心至管底

3.4 将样品管置于磁力架上,静置2 min。

3.5 待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中。

3.6 将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中(建议)。

4. RNA纯化

4.1 准备工作:将Purification beads由冰箱中取出,室温平衡至少30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。

4.2 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。

4.3 吸取 180 μL Purification beads至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育 5 min。

4.4 将PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3 min),小心移除上清。

4.5 保持PCR管始终置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec 后,小心移除上清。

4.6 重复步骤 4.5,总计漂洗两次。用 10 μL移液器吸干净残留液体。

4.7 保持 PCR 管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠(5~10 min)。

4.8 RNA洗脱:将PCR 管从磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用适合下游实验的相应体积Nuclease free H2O或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min。

4.9 将 PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3 min),小心移取 10 μL上清(可根据步骤4.8选择的实际洗脱体积进行相应调整)至新的Nuclease free PCR 管中。

【注】洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80℃存放。

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果蝇rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Drosophila rRNA Removal Kit

暂无内容

果蝇rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Drosophila rRNA Removal Kit

暂无内容

 

Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Drosophila) with purification beads是利用链霉亲和素标记的磁珠去除果蝇来源总RNA中的核糖体RNA以保留信使RNA(mRNA)和其他非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析的mRNA和非编码RNA,可显著提高测序结果中有效数据比例,也可用于cDNA合成及其它下游应用。

 

适用范围

适用于果蝇来源的10 ng~1 μg 总RNA样品。

 

产品组分

组分编号和名称

12288ES04

12288ES24

12288ES96

BOX I

12288-A

PM, Probe Mix

13.5 μL

80 μL

317 μL

BOX II

12288-B

HB, Hybridization buffer

25 μL

150 μL

600 μL

12288-C

DB, Depletion buffer

800 μL

4.6 mL

18.5 mL

12288-D

SMB, Streptavidin-coated magnetic beads

176 μL

1056 μL

4.23 mL

12288-E

PB, Purification beads

795 μL

4.75 mL

19 mL

 

储存条件

试剂盒BOXI(Probe Mix)-25~-15℃保存,BOXII2~8℃保存,有效期1年。

 

注意事项

1. 请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。

2. RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。

3. 使用前,磁珠需提前平衡至室温。

4. RNA投入量为10 ng- 1000 ng。

5. 在操作过程种,避免EP管或PCR管管盖开封(孵育过程中)或长时间处于室温状态。

6.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

7.本产品仅用作科研用途!

 

自备材料

1. qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix(No Rox)(Cat#11201)或其他等效产品;

2. 其他材料: 无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

 

操作步骤

1. 探针杂交

1.1 将探针、Streptavidin-coated magnetic beads和杂交Buffer从-20°C 取出,解冻后颠倒混匀,探针置于冰上放置,其余试剂平衡至室温备用。

1.2 准备RNA样品:根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用Nuclease free H2O稀释至12 μL。

1.3 按照表1于200 μL PCR管中配制rRNA去除反应体系。

1 探针杂交反应体系

名称

体积(μL)

Hybridization Buffer

5

Probe Mix

3

Total RNA

12(10 ng~1 μg)

Total

20

1.4 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

1.5 将上述 PCR 管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。

2 探针杂交反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

68℃

10 min

68℃-37℃

0.1℃/s

37℃*

2 min

*注:采用梯度退火之后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
2. 链酶亲和素磁珠准备

2.1低速涡旋振荡链酶亲和素磁珠使磁珠重悬。

2.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

2.3 吸取40 μL Streptavidin-coated magnetic beads于新的PCR管中,将PCR管置于磁力架上,静置2 min;。

2.4待溶液澄清后,去掉所有上清液。

2.5向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

2.6将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,去上清。

2.7向PCR管中加入80 μL Depletion buffer后,用移液器吹打10次混匀。

3. rRNA去除

3.1瞬离将步骤1中杂交样品离心至管底。

3.2 将步骤2中的链酶亲和素磁珠加入步骤1的样品中,用移液器吹打10次混匀后,置于PCR仪中,按照表3所示反应程序,进行探针捕获。

3 rRNA去除反应程序

温度

时间

热盖105°C

On

37℃

15 min

50℃

5 min

*立即进入下一步骤

*注:去除反应程序完成后,需要尽快进入下一操作步骤,严禁PCR程序中出现4℃ hold,否则会影响去除效果。
3.3 瞬离将反应液离心至管底

3.4 将样品管置于磁力架上,静置2 min。

3.5 待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中。

3.6 将PCR管置于磁力架上,静置2 min,待溶液澄清后,小心转移上清至新的PCR管中(建议)。

4. RNA纯化

4.1 准备工作:将Purification beads由冰箱中取出,室温平衡至少30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。

4.2 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。

4.3 吸取 180 μL Purification beads至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育 5 min。

4.4 将PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3 min),小心移除上清。

4.5 保持PCR管始终置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec 后,小心移除上清。

4.6 重复步骤 4.5,总计漂洗两次。用 10 μL移液器吸干净残留液体。

4.7 保持 PCR 管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠(5~10 min)。

4.8 RNA洗脱:将PCR 管从磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用适合下游实验的相应体积Nuclease free H2O或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min。

4.9 将 PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3 min),小心移取 10 μL上清(可根据步骤4.8选择的实际洗脱体积进行相应调整)至新的Nuclease free PCR 管中。

【注】洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80℃存放。

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果蝇rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Drosophila rRNA Removal Kit

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果蝇rRNA(核糖体RNA)去除试剂盒(含纯化磁珠)|Drosophila rRNA Removal Kit

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