内切糖苷酶
– 内切
糖苷酶从清洁制剂中的糖蛋白 – 高度稳定的酶切割完整的聚糖 – 不含甘油,NaCl或其他添加剂,如EDTA。
– 测试所有酶不存在蛋白水解或意外的糖苷活性
内切糖苷酶是用于分析糖蛋白的广泛使用的酶。这些酶从糖蛋白释放完整的聚糖,而外切糖苷酶释放单个单糖(即唾液酸,半乳糖,β-N-乙酰基葡糖胺,甘露糖等)。
PNGase F通常包含在酶组中,因为其切割完整的N-连接聚糖的活性相似,尽管它实际上是酰胺酶。它在天冬酰胺氨基酸和N-连接聚糖的壳二糖核心的个β-N-乙酰葡糖胺糖(GlcNAc)之间切割。Endo F酶和Endo H在和第二GlcNAc之间切割N-连接的聚糖,留下带电荷的残基,其有助于增加去糖基化蛋白质的溶解度,降低蛋白质聚集体沉淀的可能性。PNGase F切割所有N-连接的聚糖,而Endo H和Endo F酶切除特定类型的N-连接聚糖。
酶的这种分类还包括O-糖苷酶,其从丝氨酸或苏氨酸氨基酸中除去核心1O-连接的聚糖(Galβ1,3GalNAcα)。O-连接的聚糖通常含有在分支和线性连接中与半乳糖连接的另外的单糖,需要使用外切糖苷酶如唾液酸酶和半乳糖苷酶来除去额外的糖。
qa-bio E-PNG01说明书
PNGase F.
PNGase F从糖蛋白切割N-连接(天冬酰胺连接的)寡糖。
产品编号 – 酶的量
E-PNG01 – 60μLs¹E
-PNG01-20 – 20μLs¹E
-PNG01-200 – 200μls²(以前的E-PNG05)
¹包括缓冲液,变性剂和Triton-
X²仅含酶
PNGase F,肽N糖苷酶F,N-糖苷酶,N-聚糖酶
PNGase F从糖蛋白切割N-连接(天冬酰胺连接的)寡糖。该酶将天冬酰胺脱氨基成天冬氨酸,使寡糖保持完整。变性增加了解理速率。大多数天然蛋白质仍然可以*N-去糖基化,但必须增加孵育时间。酶在反应条件(37℃)下保持*活性至少96小时。PNGase F不会去除通常在植物糖蛋白上发现的含有α-(1,3) – 连接的核心岩藻糖的寡糖; 为此目的,使用肽N-糖苷酶A.
有许多替代酶可用于去除N-聚糖,特别是Endo F家族的酶和Endo H.这些酶切割寡糖核心中的两个N-乙酰氨基葡萄糖残基,产生截短的糖在天冬酰胺上残留一个N-乙酰氨基葡萄糖残基的分子。这留下带电荷的糖,其可以帮助将蛋白质保持在溶液中,所述溶液在用PNGase F去糖基化后沉淀,其去除了完整的寡糖。Endo F1切割高甘露糖和一些杂合型N-聚糖。Endo F2将去除双触角和高甘露糖(降低40倍速率)。Endo F3释放出triantennarry和岩藻糖基化的双触角N-聚糖。远藤H. 去除杂交或高甘露糖聚糖。
来源 Elizabethkingia miricola(是Chryseobacterium meningosepticum)
EC 3.5.1.52
PDB 1PGS
UniProt Q9XBM8
内容
PNG酶的F的20mM的Tris-HCl,pH 7.5中
包含20μL和60μL包装尺寸:
5x反应缓冲液7.5 – 250 mM磷酸钠,pH 7.5
变性溶液 – 2%SDS,1Mβ-巯基乙醇
Triton X-100 – 15%溶液
比活力 > 25 U / mg
活性 5U / ml
分子量 36,000道尔顿
pH范围 6-10,宜7.5
方案
1.在Eppendorf管中加入高达200μg的糖蛋白。用去离子水调节至35μl终体积。
2.加入10μl5x反应缓冲液7.5和2.5μl变性溶液。在100°C加热5分钟。
很酷。加入2.5μlTritonX-100并混合。
4.向反应中加入2.0μl酶。在37°C孵育3小时。
特异性切除所有天冬酰胺连接的复合物,杂交或高甘露糖寡糖,除非α(1-3)核心岩藻糖基化; 天冬酰胺必须在两个末端肽结合,Endo F游离
比活性定义为在37℃,pH7.5下在1分钟内催化从1微摩尔变性的RNase B释放N-连接的寡糖所需的酶量。通过SDS-PAGE监测切割(切割的RNase B迁移更快)。
储存在4°C储存酶。