His标签蛋白琼脂糖纯化树脂 Ni-NTA琼脂糖凝胶|HisSep Ni-NTA Agarose Resin

His标签蛋白琼脂糖纯化树脂 Ni-NTA琼脂糖凝胶|HisSep Ni-NTA Agarose Resin

产品说明书

FAQ

COA

已发表文献

产品描述

HisSep Ni-NTA Agarose Resin以交联的6%琼脂糖凝胶为基质,通过化学方法偶联四配位的氮川三乙酸(NTA)为配体,螯合镍离子(Ni2+)后,形成非常稳定的八面体结构,镍离子处于八面体的中心,这样的结构可保护镍离子免受小分子的进攻,Ni-IDA树脂相比,更加稳定,可以耐受一定浓度的还原剂、变性剂或耦合剂等苛刻条件。已经成为实验室纯化His标签蛋白不可或缺的树脂之一

 

产品性质

基质(Matrix

交联的6%琼脂糖凝胶

径(Bead size

45-165 µm

载量(Capacity

40 mg 6×His-tagged protein/mL基质

耐压(Tolerance Pressuremax

0.1 MPa, 1 bar

储存缓冲液(Buffer

20%乙醇的1×PBS

 

运输和保存方法

冰袋运输。4保存有效期2年。

 

注意事项

1.了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

2.产品仅作科研用途!

 

使用方法

(一)纯化流程

1 缓冲液的准备

缓冲液使用原理:低咪唑上样,高咪唑洗脱,或者高pH上样,低pH洗脱。Buffer 在使用前最好用0.22 µm0.45 µm滤膜过滤除菌。

附表1 可溶性His标签蛋白纯化所需缓冲液及配方

缓冲液名称

配方

配制1L溶液所需各种试剂量

Lysis Buffer (pH8.0)

50 mM NaH2PO4 

300 mM NaCl

10 mM imidazole

NaOHpH8.0, 0.22 µm0.45 µm过滤除菌

NaH2PO4 ·2H2O    7.8 g

NaCl             17.54 g

Imidazole         0.68 g

Wash Buffer (pH8.0)

50 mM NaH2PO4 

300 mM NaCl

20 mM imidazole

NaOHpH8.0, 0.22 µm0.45 µm过滤除菌

NaH2PO4 ·2H2O    7.8 g

NaCl             17.54 g

Imidazole         1.36 g

Elution Buffer(pH8.0)

50 mM NaH2PO4 

300 mM NaCl

250 mM imidazole

NaOHpH8.0, 0.22 µm0.45 µm过滤除菌

NaH2PO4 ·2H2O    7.8 g

NaCl             17.54 g

Imidazole         17.0 g

 

包涵体组氨酸标签蛋白纯化所需缓冲液及配方详见附表2

附表2 包涵体His标签蛋白纯化所需缓冲液及配方

缓冲液名称

配方

配制1L溶液所需各种试剂量

Lysis Buffer (pH8.0)

8 M Urea

100 mM NaH2PO4 

100 mM Tris·HCl

盐酸溶液调pH8.0, 0.22 µm0.45 µm过滤除菌

Urea             480.5 g

NaH2PO4 ·2H2O    15.6 g

Tris·HCl              15.76 g

Wash Buffer (pH6.3)

8 M Urea

100 mM NaH2PO4 

100 mM Tris·HCl

盐酸溶液调pH6.3, 0.22 µm0.45 µm过滤除菌

Urea             480.5 g

NaH2PO4 ·2H2O    15.6 g

Tris·HCl              15.76 g

Elution Buffer(pH4.5)

8 M Urea

100 mM NaH2PO4 

100 mM Tris·HCl

盐酸溶液调pH4.5, 0.22 µm0.45 µm过滤除菌

Urea             480.5 g

NaH2PO4 ·2H2O    15.6 g

Tris·HCl              15.76 g

 

 

2 样品准备

2.1 细菌表达的蛋白(本说明以细菌表达的蛋白纯化为例)

1)挑取单菌落到含有适合抗性的LB培养基中,根据载体说明加入相应的诱导剂诱导相应的时间。

2)表达结束后,将培养液转至离心瓶,7000 rpm,离心15 min,收集菌体,然后加入1/10体积的裂解液(Lysis buffer)和PMSFPMSF在破碎前加入,其终浓度为1 mM),同时也可加入其他蛋白酶抑制剂,但不能影响目的蛋白与树脂的结合。

3)之后加入溶菌酶,使其工作浓度为1 mg/mL。【注】如果表达的宿主细胞内含pLysSpLysE,可以不加入溶菌酶。

4)将菌体沉淀悬浮起来(如果菌液浓度高,可考虑加入10 µg/mL RNase A5 µg/mL DNase I),混匀,置于冰上超声破碎细胞,至菌液基本保持澄清。

5)收集上述澄清蛋白液,10000 rpm4离心20-30 min。取上清0.22 µm0.45 µm滤膜过滤后置于冰上备用或-20保存。

 

2.2 酵母、昆虫和哺乳细胞分泌表达的可溶性蛋白

将细胞培养液转移至离心瓶,5000 rpm离心10 min,收集上清。如上清中不含EDTA、组氨酸和还原剂等,即可直接上柱纯化;如含有EDTA、组氨酸和还原剂等物质,则需用1×PBS 4下透析后方可上柱。【注】对于大量体积的上清,需加入硫酸铵进行沉淀浓缩,之后经1×PBS 4下透析后上柱。

 

2.3 包涵体蛋白纯化(以细菌为例)

1)将培养液转移至离心瓶,7000 rpm,离心15 min,收集菌体去上清。

2)按照菌体:裂解液=1:10w/v)的比例将菌体充分悬浮,混匀,冰浴超声破碎。

3)将破碎液转移至离心管,10000 rpm4离心20-30 min,去上清。可重复步骤2)和3)一次。

4)按照菌体:裂解液(含8 M尿素)=1:10w/v)的比例将包涵体充分悬浮。

5)变性条件下纯化His标签蛋白纯化。

 

3样品纯化

1装柱:将HisSep Ni-NTA Agarose Resin借助重力的作用装入合适的纯化中。

2清洗3-5倍柱体积去离子水冲洗色谱柱

3平衡至少5倍柱体积的Lysis Buffer 平衡色谱柱。

4上样:注意控制加样速度,确保目的蛋白与Ni2+充分接触,以提高纯化得率。【注】注意收集流出液,用于后续SDS-PAGE检测蛋白的结合情况。 

5平衡/洗杂Wash Buffer 平衡柱子,直到紫外吸收达到一个稳定的基线(一般至少10-15个柱体积)。注意收集流出液。【注】在样品和结合缓冲液中加入低浓度咪唑可以提高样品纯度。

6洗脱:使用5-10倍柱体积Elution Buffer洗脱,收集洗脱液即目的蛋白溶液。

7清洗:依次用3倍柱体积的Lysis Buffer5倍柱体积的去离子水清洗树脂。【注】建议在清洗之前用更高浓度咪唑(如500 mM)彻底清洗纯化柱上结合的杂蛋白。

8保存5倍柱体积的20%乙醇平衡树脂,最后将树脂保存在20%乙醇1×PBS中,置于4保存。

 

4 SDS-PAGE检测

将纯化过程中得到的样品(包括原始样品、流出组分、洗杂及洗脱组分等)利用SDS-PAGE进行检测,判定其纯化效果。

 

(二)在位清洗

当填料使用过程中发现反压过高(>0.5 Mpa)或者填料上面出现明显的污染时,需对其进行在位清洗(Cleaning-in-PlaceCIP)。在位清洗时,先把Ni2+脱掉,清洗结束后,将填料保存在20%乙醇中,后者重新挂Ni后再保存在20%乙醇中。建议按照下面操作去除填料上残留的污染物,如沉淀蛋白、疏水蛋白和脂蛋白等。

 

1 去除强疏水结合的蛋白,脂蛋白和脂类

使用30%异丙醇清洗5-10个柱体积,接触时间为15-20 min可以去除此类污染物。之后再用去离子水清洗10倍柱体积。也可以选择使用含有去污剂的酸性或者碱性溶液清洗填料2倍柱体积。例如含有0.1-0.5%非离子去污剂的0.1 M醋酸溶液,接触时间为1-2 h。去污剂处理后,需用70%的乙醇清洗5倍柱体积,彻底去除去污剂。最后利用去离子水清洗10倍柱体积。

 

2 去除离子作用结合的蛋白

使用1.5 M NaCl 溶液接触10-15 min,之后用去离子水清洗10倍柱体积。

 

(三)填料再生

当填料使用过程中发现反压过高,填料上面出现明显的污染,或填料载量明显变低时,需要对其进行镍离子剥离及重新挂镍处理,即填料再生。按照下面操作流程进行:

1使用5倍柱体积去离子水清洗填料;

2使用5倍柱体积100 mM EDTApH 8.0)剥落镍离子;

3使用10倍柱体积去离子水清洗填料

4使用0.5 M NaOH清洗5倍柱体积,停留10-15 min

5使用10倍柱体积去离子水清洗填料

6使用3-5倍柱体积100 mM NiSO4再生挂镍

7)去离子水清洗10倍柱体积。

填料再生后,可立即使用,也可保存在20%乙醇中,置于4备用。

 

附表3 HisSep Ni-NTA Agarose Resin试剂耐受情况

试剂种类

浓度

还原剂

5 mM DTE

0.5-1 mM DTT

20 mM β-mercaptoethanol

5 mM TCEP

10 mM reduced glutathione

变性剂

8 M urea

6 M Gua-HCl

去污剂

2% TritonTM X-100(nonionic)

2% TweenTM20(nonionic)

2% NP-40(nonionic)

2% Cholate (anionic)

1% CHAPS (zwitterionic)

其他类

500 mM imidazole

20% ethanol

50% glycerol

100 mM Na2SO4

1.5 M NaCl

1 mM EDTA

60 mM citrate

缓冲液

50 mM sodium phosphate, pH7.4

100 mM Tris-HCl, pH7.4

100 mM Tris-acetate, pH7.4

100 mM HEPJP, pH7.4

100 mM MOPS, pH7.4

100 mM sodium acetate, pH7.4

 

附表4 问题及解决方案

问题

可能原因

推荐解决方案

柱子反压过高

填料被堵塞

裂解液中可能含微小的固体颗粒,建议上柱前使用滤膜(0.22 µm0.45 µm)过滤,或离心去除。

样品中含高浓度的核酸,延长破碎时间直至粘度降低,或添加DNaseI (终浓度为5 µg/mL),Mg2+(终浓度1 mM),冰上孵育10-15 min

样品太黏稠

有机试剂或蛋白稳定试剂(如甘油等)可能会引起反压增高,降低操作流速。

洗脱组分中无目的蛋白

蛋白可能是包涵体

可通过电泳检测裂解液,分析上清中是否有目的蛋白,包涵体蛋白需按照包涵体蛋白的纯化方式

表达量太低

优化表达条件,使用包涵体纯化缓冲体系

目的蛋白结合比较弱,在洗杂步骤中已被洗下来

提高Wash BufferpH值,或者降低咪唑浓度

目的蛋白结合过强,不容易洗脱下来

降低Elution Buffer pH,或者增加Elution Buffer中的咪唑浓度

使用10-100 mM EDTA溶液剥离镍离子,同时得到蛋白

蛋白降解

菌体破碎时需添加一些蛋白酶抑制剂

4下进行纯化操作

洗脱组分不纯(含多种蛋白)

洗杂不彻底

增加Wash Buffer 体积

样品中含有其他His标签蛋白

通过调节pH值或咪唑浓度来优化洗杂条件。再使用其他纯化手段(如去离子交换,疏水等)进一步纯化洗脱组分。

填料颜色变浅或变成白色

镍离子脱落或者剥离

按照填料再生的操作重新挂镍离子

填料呈现褐色

缓冲液中含有DTT等还原剂

参考附3适当降低还原剂DTT的浓度,或改用巯基乙醇

上样过程中蛋白发生沉淀

操作温度太低

室温下进行上样

 

蛋白发生聚集

在样品和所有缓冲液中添加稳定剂,如0.1%Triton X-100Tween-20

 

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                                          HB20220718

Q:柱子反压过高是什么原因?

A:填料可能被堵塞:裂解液中可能含微小的固体颗粒,建议上柱前使用滤膜(0.22µm 或 0.45µm)过滤,或离心去除。

Q:为什么洗脱组分中无目的蛋白?

A:蛋白可能是包涵体:可通过电泳检测裂解液,分析上清中是否有目的蛋白,包涵体蛋白需按照包涵体蛋白的纯化方式;

Q:洗脱组分不纯(含多种蛋白)是什么原因?

A 样品中含有其他 His 标签蛋白:通过调节 pH 值或咪唑浓度来优化洗杂条件。再使用其他纯化手段(如去离子交换,疏水等)进一步纯化洗脱组分。

Q:为什么填料颜色会变浅或变成白色?

A:镍离子脱落或者剥离,按照填料再生的操作重新挂镍离子。

Q:产品规格的体积指的是什么

A:指的是填料的体积,不包括保护液的

 Q:填料流速慢的原因

 A:1.柱子在清洗平衡步骤流速减慢,柱子下筛板堵塞或者是试剂中有杂质堵塞。2.上样过程中流速逐渐降低,样品中有不溶物 堵塞填料或者是样品粘稠。少数情况蛋白挂柱后 流速也会减慢。 3.洗杂洗脱步骤流速减慢,蛋白不稳定 在柱子上沉淀,可以选择低温条件纯化或者是在整个纯化过程中样品试剂中加入甘油保护蛋白。

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产品描述

HisSep Ni-NTA Agarose Resin以交联的6%琼脂糖凝胶为基质,通过化学方法偶联四配位的氮川三乙酸(NTA)为配体,螯合镍离子(Ni2+)后,形成非常稳定的八面体结构,镍离子处于八面体的中心,这样的结构可保护镍离子免受小分子的进攻,Ni-IDA树脂相比,更加稳定,可以耐受一定浓度的还原剂、变性剂或耦合剂等苛刻条件。已经成为实验室纯化His标签蛋白不可或缺的树脂之一

 

产品性质

基质(Matrix

交联的6%琼脂糖凝胶

径(Bead size

45-165 µm

载量(Capacity

40 mg 6×His-tagged protein/mL基质

耐压(Tolerance Pressuremax

0.1 MPa, 1 bar

储存缓冲液(Buffer

20%乙醇的1×PBS

 

运输和保存方法

冰袋运输。4保存有效期2年。

 

注意事项

1.了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

2.产品仅作科研用途!

 

使用方法

(一)纯化流程

1 缓冲液的准备

缓冲液使用原理:低咪唑上样,高咪唑洗脱,或者高pH上样,低pH洗脱。Buffer 在使用前最好用0.22 µm0.45 µm滤膜过滤除菌。

附表1 可溶性His标签蛋白纯化所需缓冲液及配方

缓冲液名称

配方

配制1L溶液所需各种试剂量

Lysis Buffer (pH8.0)

50 mM NaH2PO4 

300 mM NaCl

10 mM imidazole

NaOHpH8.0, 0.22 µm0.45 µm过滤除菌

NaH2PO4 ·2H2O    7.8 g

NaCl             17.54 g

Imidazole         0.68 g

Wash Buffer (pH8.0)

50 mM NaH2PO4 

300 mM NaCl

20 mM imidazole

NaOHpH8.0, 0.22 µm0.45 µm过滤除菌

NaH2PO4 ·2H2O    7.8 g

NaCl             17.54 g

Imidazole         1.36 g

Elution Buffer(pH8.0)

50 mM NaH2PO4 

300 mM NaCl

250 mM imidazole

NaOHpH8.0, 0.22 µm0.45 µm过滤除菌

NaH2PO4 ·2H2O    7.8 g

NaCl             17.54 g

Imidazole         17.0 g

 

包涵体组氨酸标签蛋白纯化所需缓冲液及配方详见附表2

附表2 包涵体His标签蛋白纯化所需缓冲液及配方

缓冲液名称

配方

配制1L溶液所需各种试剂量

Lysis Buffer (pH8.0)

8 M Urea

100 mM NaH2PO4 

100 mM Tris·HCl

盐酸溶液调pH8.0, 0.22 µm0.45 µm过滤除菌

Urea             480.5 g

NaH2PO4 ·2H2O    15.6 g

Tris·HCl              15.76 g

Wash Buffer (pH6.3)

8 M Urea

100 mM NaH2PO4 

100 mM Tris·HCl

盐酸溶液调pH6.3, 0.22 µm0.45 µm过滤除菌

Urea             480.5 g

NaH2PO4 ·2H2O    15.6 g

Tris·HCl              15.76 g

Elution Buffer(pH4.5)

8 M Urea

100 mM NaH2PO4 

100 mM Tris·HCl

盐酸溶液调pH4.5, 0.22 µm0.45 µm过滤除菌

Urea             480.5 g

NaH2PO4 ·2H2O    15.6 g

Tris·HCl              15.76 g

 

 

2 样品准备

2.1 细菌表达的蛋白(本说明以细菌表达的蛋白纯化为例)

1)挑取单菌落到含有适合抗性的LB培养基中,根据载体说明加入相应的诱导剂诱导相应的时间。

2)表达结束后,将培养液转至离心瓶,7000 rpm,离心15 min,收集菌体,然后加入1/10体积的裂解液(Lysis buffer)和PMSFPMSF在破碎前加入,其终浓度为1 mM),同时也可加入其他蛋白酶抑制剂,但不能影响目的蛋白与树脂的结合。

3)之后加入溶菌酶,使其工作浓度为1 mg/mL。【注】如果表达的宿主细胞内含pLysSpLysE,可以不加入溶菌酶。

4)将菌体沉淀悬浮起来(如果菌液浓度高,可考虑加入10 µg/mL RNase A5 µg/mL DNase I),混匀,置于冰上超声破碎细胞,至菌液基本保持澄清。

5)收集上述澄清蛋白液,10000 rpm4离心20-30 min。取上清0.22 µm0.45 µm滤膜过滤后置于冰上备用或-20保存。

 

2.2 酵母、昆虫和哺乳细胞分泌表达的可溶性蛋白

将细胞培养液转移至离心瓶,5000 rpm离心10 min,收集上清。如上清中不含EDTA、组氨酸和还原剂等,即可直接上柱纯化;如含有EDTA、组氨酸和还原剂等物质,则需用1×PBS 4下透析后方可上柱。【注】对于大量体积的上清,需加入硫酸铵进行沉淀浓缩,之后经1×PBS 4下透析后上柱。

 

2.3 包涵体蛋白纯化(以细菌为例)

1)将培养液转移至离心瓶,7000 rpm,离心15 min,收集菌体去上清。

2)按照菌体:裂解液=1:10w/v)的比例将菌体充分悬浮,混匀,冰浴超声破碎。

3)将破碎液转移至离心管,10000 rpm4离心20-30 min,去上清。可重复步骤2)和3)一次。

4)按照菌体:裂解液(含8 M尿素)=1:10w/v)的比例将包涵体充分悬浮。

5)变性条件下纯化His标签蛋白纯化。

 

3样品纯化

1装柱:将HisSep Ni-NTA Agarose Resin借助重力的作用装入合适的纯化中。

2清洗3-5倍柱体积去离子水冲洗色谱柱

3平衡至少5倍柱体积的Lysis Buffer 平衡色谱柱。

4上样:注意控制加样速度,确保目的蛋白与Ni2+充分接触,以提高纯化得率。【注】注意收集流出液,用于后续SDS-PAGE检测蛋白的结合情况。 

5平衡/洗杂Wash Buffer 平衡柱子,直到紫外吸收达到一个稳定的基线(一般至少10-15个柱体积)。注意收集流出液。【注】在样品和结合缓冲液中加入低浓度咪唑可以提高样品纯度。

6洗脱:使用5-10倍柱体积Elution Buffer洗脱,收集洗脱液即目的蛋白溶液。

7清洗:依次用3倍柱体积的Lysis Buffer5倍柱体积的去离子水清洗树脂。【注】建议在清洗之前用更高浓度咪唑(如500 mM)彻底清洗纯化柱上结合的杂蛋白。

8保存5倍柱体积的20%乙醇平衡树脂,最后将树脂保存在20%乙醇1×PBS中,置于4保存。

 

4 SDS-PAGE检测

将纯化过程中得到的样品(包括原始样品、流出组分、洗杂及洗脱组分等)利用SDS-PAGE进行检测,判定其纯化效果。

 

(二)在位清洗

当填料使用过程中发现反压过高(>0.5 Mpa)或者填料上面出现明显的污染时,需对其进行在位清洗(Cleaning-in-PlaceCIP)。在位清洗时,先把Ni2+脱掉,清洗结束后,将填料保存在20%乙醇中,后者重新挂Ni后再保存在20%乙醇中。建议按照下面操作去除填料上残留的污染物,如沉淀蛋白、疏水蛋白和脂蛋白等。

 

1 去除强疏水结合的蛋白,脂蛋白和脂类

使用30%异丙醇清洗5-10个柱体积,接触时间为15-20 min可以去除此类污染物。之后再用去离子水清洗10倍柱体积。也可以选择使用含有去污剂的酸性或者碱性溶液清洗填料2倍柱体积。例如含有0.1-0.5%非离子去污剂的0.1 M醋酸溶液,接触时间为1-2 h。去污剂处理后,需用70%的乙醇清洗5倍柱体积,彻底去除去污剂。最后利用去离子水清洗10倍柱体积。

 

2 去除离子作用结合的蛋白

使用1.5 M NaCl 溶液接触10-15 min,之后用去离子水清洗10倍柱体积。

 

(三)填料再生

当填料使用过程中发现反压过高,填料上面出现明显的污染,或填料载量明显变低时,需要对其进行镍离子剥离及重新挂镍处理,即填料再生。按照下面操作流程进行:

1使用5倍柱体积去离子水清洗填料;

2使用5倍柱体积100 mM EDTApH 8.0)剥落镍离子;

3使用10倍柱体积去离子水清洗填料

4使用0.5 M NaOH清洗5倍柱体积,停留10-15 min

5使用10倍柱体积去离子水清洗填料

6使用3-5倍柱体积100 mM NiSO4再生挂镍

7)去离子水清洗10倍柱体积。

填料再生后,可立即使用,也可保存在20%乙醇中,置于4备用。

 

附表3 HisSep Ni-NTA Agarose Resin试剂耐受情况

试剂种类

浓度

还原剂

5 mM DTE

0.5-1 mM DTT

20 mM β-mercaptoethanol

5 mM TCEP

10 mM reduced glutathione

变性剂

8 M urea

6 M Gua-HCl

去污剂

2% TritonTM X-100(nonionic)

2% TweenTM20(nonionic)

2% NP-40(nonionic)

2% Cholate (anionic)

1% CHAPS (zwitterionic)

其他类

500 mM imidazole

20% ethanol

50% glycerol

100 mM Na2SO4

1.5 M NaCl

1 mM EDTA

60 mM citrate

缓冲液

50 mM sodium phosphate, pH7.4

100 mM Tris-HCl, pH7.4

100 mM Tris-acetate, pH7.4

100 mM HEPJP, pH7.4

100 mM MOPS, pH7.4

100 mM sodium acetate, pH7.4

 

附表4 问题及解决方案

问题

可能原因

推荐解决方案

柱子反压过高

填料被堵塞

裂解液中可能含微小的固体颗粒,建议上柱前使用滤膜(0.22 µm0.45 µm)过滤,或离心去除。

样品中含高浓度的核酸,延长破碎时间直至粘度降低,或添加DNaseI (终浓度为5 µg/mL),Mg2+(终浓度1 mM),冰上孵育10-15 min

样品太黏稠

有机试剂或蛋白稳定试剂(如甘油等)可能会引起反压增高,降低操作流速。

洗脱组分中无目的蛋白

蛋白可能是包涵体

可通过电泳检测裂解液,分析上清中是否有目的蛋白,包涵体蛋白需按照包涵体蛋白的纯化方式

表达量太低

优化表达条件,使用包涵体纯化缓冲体系

目的蛋白结合比较弱,在洗杂步骤中已被洗下来

提高Wash BufferpH值,或者降低咪唑浓度

目的蛋白结合过强,不容易洗脱下来

降低Elution Buffer pH,或者增加Elution Buffer中的咪唑浓度

使用10-100 mM EDTA溶液剥离镍离子,同时得到蛋白

蛋白降解

菌体破碎时需添加一些蛋白酶抑制剂

4下进行纯化操作

洗脱组分不纯(含多种蛋白)

洗杂不彻底

增加Wash Buffer 体积

样品中含有其他His标签蛋白

通过调节pH值或咪唑浓度来优化洗杂条件。再使用其他纯化手段(如去离子交换,疏水等)进一步纯化洗脱组分。

填料颜色变浅或变成白色

镍离子脱落或者剥离

按照填料再生的操作重新挂镍离子

填料呈现褐色

缓冲液中含有DTT等还原剂

参考附3适当降低还原剂DTT的浓度,或改用巯基乙醇

上样过程中蛋白发生沉淀

操作温度太低

室温下进行上样

 

蛋白发生聚集

在样品和所有缓冲液中添加稳定剂,如0.1%Triton X-100Tween-20

 

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                                          HB20220718

Q:柱子反压过高是什么原因?

A:填料可能被堵塞:裂解液中可能含微小的固体颗粒,建议上柱前使用滤膜(0.22µm 或 0.45µm)过滤,或离心去除。

Q:为什么洗脱组分中无目的蛋白?

A:蛋白可能是包涵体:可通过电泳检测裂解液,分析上清中是否有目的蛋白,包涵体蛋白需按照包涵体蛋白的纯化方式;

Q:洗脱组分不纯(含多种蛋白)是什么原因?

A 样品中含有其他 His 标签蛋白:通过调节 pH 值或咪唑浓度来优化洗杂条件。再使用其他纯化手段(如去离子交换,疏水等)进一步纯化洗脱组分。

Q:为什么填料颜色会变浅或变成白色?

A:镍离子脱落或者剥离,按照填料再生的操作重新挂镍离子。

Q:产品规格的体积指的是什么

A:指的是填料的体积,不包括保护液的

 Q:填料流速慢的原因

 A:1.柱子在清洗平衡步骤流速减慢,柱子下筛板堵塞或者是试剂中有杂质堵塞。2.上样过程中流速逐渐降低,样品中有不溶物 堵塞填料或者是样品粘稠。少数情况蛋白挂柱后 流速也会减慢。 3.洗杂洗脱步骤流速减慢,蛋白不稳定 在柱子上沉淀,可以选择低温条件纯化或者是在整个纯化过程中样品试剂中加入甘油保护蛋白。

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proteinslides Ni-NTA或Cu-NTA表面

proteinslides Ni-NTA或Cu-NTA表面

应用说明: 

蛋白质分子仅通过具有受控方向的poly-His标签连接到表面,否则将尽可能远离表面。这确保了天然状态的蛋白质活性。无需样品预纯化。

图1.零背景Cu2 +表面由束缚在高密度PEG涂层上的螯合Cu2 +离子组成。蛋白质分子通过多组氨酸标签特异性连接。 

重组蛋白通常与聚组氨酸(His)标签一起产生,以促进纯化。这些蛋白质现在用于蛋白质微阵列的制造中。为了利用poly-His标签的可利用性,我们基于零背景PEG涂层开发了一种螯合的Cu2 +表面,如图1所示。该表面的使用基本上省去了纯化步骤,并将其直接掺入了蛋白质固定化过程,即可以将粗裂解物直接用于微阵列制造,如图2所示的绿色荧光蛋白(GFP)。除了N末端或C末端的多组氨酸标签外,由于PEG环境的排斥性,每个固定的蛋白质分子都远离表面并使其与表面的相互作用小化。结果是,对蛋白质天然构象的干扰小。化学环境的惰性和可控的取向都为固定的蛋白质分子保留其天然构象和活性提供了理想的环境,如图3所示。对于6xHis标记的磺基转移酶和碱性磷酸酶,可控的取向固定在Cu2 + / PEG表面,其活性与溶液相几乎相同。为了进行比较,以无规取向固定在3-氨丙基三乙氧基硅烷(γ-APS)涂层表面上的酶仅显示约10%的活性。化学环境的惰性和可控的取向都为固定的蛋白质分子保留其天然构象和活性提供了理想的环境,如图3所示。对于6xHis标记的磺基转移酶和碱性磷酸酶,可控的取向固定在Cu2 + / PEG表面,其活性与溶液相几乎相同。为了进行比较,以无规取向固定在3-氨丙基三乙氧基硅烷(γ-APS)涂层表面上的酶仅显示约10%的活性。化学环境的惰性和可控的取向都为固定的蛋白质分子保留其天然构象和活性提供了理想的环境,如图3所示。对于6xHis标记的磺基转移酶和碱性磷酸酶,可控的取向固定在Cu2 + / PEG表面,其活性与溶液相几乎相同。为了进行比较,以无规取向固定在3-氨基丙基三乙氧基硅烷(γ-APS)涂层表面上的酶仅显示约10%的活性。

图3.溶液相中酶活性与在γ-APS表面上随机取向或在Cu2 + / PEG表面上受控取向的酶活性的比较。 图2.左侧显示了吸附在螯合的Cu2 + / PEG表面的6xHis标签的GFP的固有荧光。该表面可抵抗没有His标签的GFP的非特异性吸附(右)。光斑直径约0.2毫米。

Cu2 + / PEG表面上的排斥性2D化学环境不仅对固定化蛋白分子的活性至关重要,而且对维持和恢复这种活性也至关重要。后者在固定在三个不同表面上的6xHis-GFP变性和重新折叠的重复循环后的荧光显微镜图像中得到证明(图4):(a)Cu2 + / PEG表面;(b)Cu 2+离子螯合在3-氨基丙基三乙氧基硅烷(gama-APS)功能化表面的表面亚氨基二乙酸基团上;(c)用于非特异性蛋白质吸附的γ-APS表面。尽管免疫染色显示相似量的GFP,但三个表面的固有荧光强度却有很大差异。Cu2 + / gamma-APS或gamma-APS表面的荧光强度为70%或< Cu 2+ / PEG表面的20%。尽管在变性步骤之后所有三个表面上均未检测到荧光,但重新折叠的结果是表面化学性质的强函数。在Cu2 + / PEG表面上,大多数荧光强度在重折叠步骤后得以恢复。相反,Cu2 + /γ-APS或γ-APS表面几乎没有荧光强度。在Cu2 + / PEG表面上,每个固定的GFP分子仅通过6xHis标签连接,但由于PEG功能的排斥性,更倾向于远离表面。表面的这种排斥或不结垢的性质确保了弱的蛋白质-表面相互作用不会在能量格局中为蛋白质重新折叠引入额外的障碍。在gamma-APS表面上,GFP与附近的“粘性”或结垢–NH2官能团之间存在吸引人的非特异性相互作用。变性后,与粘性环境的这种非特异性相互作用有望增加,从而有效地在能量格局中引入了无法克服的障碍,从而使蛋白质重新折叠。Cu2 + / PEG表面对蛋白质分子进行芯片重折叠的能力为许多潜在应用打开了大门,例如,直接在芯片上生成蛋白质微阵列,从重组蛋白质中去除包涵体等。这些涂层可供选择在标准显微镜载玻片,盖玻片和硅片上。我们的客户已成功将Cu2 + / PEG表面应用于各种应用,包括蛋白质传感器,蛋白质微阵列,单分子光谱,生物原子力显微镜和其他生物物理研究。即将推出:Cu2 + / PEG表面的三维(3D)版本正在开发中。微孔3D涂层提供的大表面积允许高聚His标签探针分子的高负载。这是检测极低浓度生物标志物的理想选择。

图4.在三个表面上变性(De)和再折叠(Re)循环前后的6xHis-GFP荧光显微镜图像:(a)Cu2 + / PEG;(b)Cu2 //γ-APS;(c)γ-APS。变性涉及将6xHis-GFP涂层的表面浸入pH = 3.5的缓冲溶液中,而重新折叠对应于将样品与含有1xPBS,20%蔗糖和10%甘油的pH = 8.1的缓冲溶液一起孵育。

阅读使用我们的Cu2 +表面发表的文章:蛋白质组学,2005,5,416;蛋白质组学,2007,7,1771; 自然方法,2008,5,507; BMC Biotech。,2009,1.等。

 

His标签蛋白琼脂糖高速纯化树脂 Ni-NTA琼脂糖凝胶|HisSep Ni-NTA Agarose Resin 6FF

His标签蛋白琼脂糖高速纯化树脂 Ni-NTA琼脂糖凝胶|HisSep Ni-NTA Agarose Resin 6FF

产品说明书

FAQ

COA

已发表文献

产品描述

HisSep Ni-NTA Agarose Resin 6FF以高度交联的6%琼脂糖凝胶为基质,通过化学方法偶联四配位的氮川三乙酸(NTA)为配体,螯合镍离子(Ni2+)后,形成非常稳定的八面体结构,镍离子处于八面体的中心,这样的结构可保护镍离子免受小分子的进攻,更加稳定,可以耐受一定浓度的还原剂、变性剂或耦合剂等苛刻条件。此外,因其基质的耐压性(可耐受最高0.3 MPa的压力),该产品可以用于工业大规模蛋白的纯化,可在相对较高的流速下,实现对目的蛋白的纯化。

产品性质

基质(Matrix)

高度交联的6%琼脂糖凝胶

粒径(Bead size)

45-165 µm

载量(Capacity)

>40 mg 6×His-tagged protein/mL基质

耐压(Tolerance Pressuremax

0.3 MPa,3 bar

储存缓冲液(Buffer)

含20%乙醇的1×PBS

运输和保存方法

冰袋运输。4℃保存。有效期2年。

注意事项

1) 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
2)本产品仅作科研用途!

使用方法

一、纯化流程

缓冲液的准备

缓冲液使用原理:低咪唑上样,高咪唑洗脱,或者高pH上样,低pH洗脱。Buffer 在使用前最好用0.22 µm或0.45 µm滤膜过滤除菌。可溶性组氨酸标签蛋白纯化所需配方详见附表2。包涵体组氨酸标签蛋白纯化所需缓冲液及配方详见附表3。

 

样品准备

2.1 细菌表达的蛋白(本说明以细菌表达的蛋白纯化为例)

1)挑取单菌落到含有适合抗性的LB培养基中,根据载体说明加入相应的诱导剂诱导相应的时间。
2)表达结束后,将培养液转至离心瓶,7000 rpm,离心15 min,收集菌体,然后加入1/10体积的裂解液(Lysis buffer)和PMSF(PMSF在破碎前加入,其终浓度为1 mM),同时也可加入其他蛋白酶抑制剂,但不能影响目的蛋白与树脂的结合。
3)之后加入溶菌酶,使其工作浓度为1 mg/mL。
注:如果表达的宿主细胞内含pLysS或pLysE,可以不加入溶菌酶。
4)将菌体沉淀悬浮起来(如果菌液浓度高,可考虑加入10 µg/mL RNase A和5 µg/mL DNase I),混匀,置于冰上超声破碎细胞,至菌液基本保持澄清。
5)收集上述澄清蛋白液至离心管中,10000 rpm,4℃离心20-30 min。取上清,置于冰上备用或-20℃保存。

2.2 酵母、昆虫和哺乳细胞分泌表达的可溶性蛋白

将细胞培养液转移至离心瓶,5000 rpm离心10 min,收集上清。如上清中不含EDTA、组氨酸和还原剂等,即可直接上柱纯化;如含有EDTA、组氨酸和还原剂等物质,则需用1×PBS 4℃下透析后方可上柱。

注:对于大量体积的上清,需加入硫酸铵进行沉淀浓缩,之后经1×PBS 4℃下透析后上柱。

2.3 包涵体蛋白纯化(以细菌为例)

1)将培养液转移至离心瓶,7000 rpm,离心15 min,收集菌体去上清。

2)按照菌体:裂解液=1:10(w/v)的比例将菌体充分悬浮,混匀,冰浴超声破碎。

3)将破碎液转移至离心管,10000 rpm,4℃离心20-30 min,去上清。可重复步骤2)和3)一次。

4)按照菌体:裂解液(含8M尿素)=1:10(w/v)的比例将包涵体充分悬浮。

5)变性条件下纯化His标签蛋白纯化。

装柱

1)用去离子水冲洗层析柱底筛板与接头,确保柱底筛板上无气泡,关闭柱底出口,并在柱底部留出1-2 cm的去离子水。

2)将树脂悬浮,小心地将浆液连续地倒入层析柱中。用玻璃棒沿着柱壁倒入浆液可减少气泡的产生。
3)如果使用储液器,应立即在层析柱和储液器中加满水,将进样分配器放置于浆液表面,连接至泵上,避免在分配器或进样管中产生气泡。
4)打开层析柱底部出口,开启泵,使其在设定的流速下进行。最初应让缓冲液缓慢流过层析柱,然后缓慢增加至最终流速,这样可避免液压对所形成柱床的冲击,也可以避免柱床形成的不均匀。如达不到推荐的压力或流速,可以用所用泵的最大流速,这样也可以达到一个较好的装填效果。当柱床高度稳定后,在最后的装柱流速下至少再上3倍柱体积的去离子水。标上柱床高度。注:在随后的色谱程序中,不要超过最大装柱流速的75%。

5)关闭泵,关闭层析柱出口。

6)如使用储液器,去除储液器,将分配器置于层析柱中。

7)将分配器推向柱子至标记的柱床高度处。允许装柱液进入分配器,锁紧分配器接头。

8)将装填好的层析柱连接至泵或色谱系统中,开始平衡。如需要可重新调整分配器。

样品纯化
装柱后,可用各种常规的中压色谱系统,以AKTA使用为例进行说明:
1)将泵管道注满去离子水。去掉产品上塞,连接至色谱系统中,打开下出口,将纯化柱连接到色谱系统中,注意旋紧。

2)3-5倍柱体积去离子水冲洗纯化柱。

3)至少5倍柱体积的Lysis Buffer 平衡色谱柱。1ml规格预装柱推荐流速为1 mL/min,5 mL预装柱推荐流速为5 mL/min。
4)利用泵或注射器上样,收集流出液,以便SDS-PAGE检测蛋白结合情况。
注:若样品粘度增加,即使上样体积很少也会导致层析柱很大反压;上样量不要超过柱子的结合能力;大量样品体积也可能造成很大的反压,使得进样器更难使用。

5)Wash Buffer 平衡柱子,直到紫外吸收达到一个稳定的基线(一般至少10-15个柱体积)。

注:在样品和结合缓冲液中加入低浓度咪唑可以提高样品纯度。
6)Elution Buffer一步法或梯度法进行洗脱。一步法洗脱中一般5倍柱体积洗脱液即可。梯度洗脱可以用一个小的梯度,例如20倍柱体积或更多来分离不同结合强度的蛋白质。
7)建议用更高浓度咪唑(如500 mM)彻底清洗纯化柱上结合的杂蛋白。随后依次用3倍柱体积的Lysis Buffer和5倍柱体积的去离子水清洗树脂。5倍柱体积的20%乙醇平衡树脂,最后将树脂保存在20%乙醇的1×PBS中,置于4℃保存。

 

5 SDS-PAGE检测

将纯化过程中得到的样品(包括原始样品、流出组分、洗杂及洗脱组分等)利用SDS-PAGE进行检测,判定其纯化效果。

 

二、在位清洗

当填料使用过程中发现反压过高(>0.5 Mpa)或者填料上面出现明显的污染时,需对其进行在位清洗(Cleaning-in-Place,CIP)。在位清洗时,先把Ni2+脱掉,清洗结束后,将填料保存在20%乙醇中,后者重新挂Ni后再保存在20%乙醇中。建议按照下面操作去除填料上残留的污染物,如沉淀蛋白、疏水蛋白和脂蛋白等。

去除强疏水结合的蛋白,脂蛋白和脂类

使用30%异丙醇清洗5-10个柱体积,接触时间为15-20 min可以去除此类污染物。之后再用去离子水清洗10倍柱体积。也可以选择使用含有去污剂的酸性或者碱性溶液清洗填料2倍柱体积。例如含有0.1-0.5%非离子去污剂的0.1 M醋酸溶液,接触时间为1-2 h。去污剂处理后,需用70%的乙醇清洗5倍柱体积,彻底去除去污剂。最后利用去离子水清洗10倍柱体积。

去除离子作用结合的蛋白

使用1.5 M NaCl 溶液接触10-15 min,之后用去离子水清洗10倍柱体积。

 

三、填料再生

当填料使用过程中发现反压过高(>0.5 Mpa),填料上面出现明显的污染,或填料载量明显变低时,需要对其进行镍离子剥离及重新挂镍处理,即填料再生。按照下面操作流程进行:

1)使用5倍柱体积去离子水清洗填料;

2)使用5倍柱体积100mM EDTA(pH 8.0)剥落镍离子;

3)使用10倍柱体积去离子水清洗填料;

4)使用0.5M NaOH清洗5倍柱体积,停留10-15min;

5)使用10倍柱体积去离子水清洗填料;

6)使用3-5倍柱体积100mM NiSO4再生挂镍;

7)去离子水清洗10倍柱体积。

填料再生后,可立即使用,也可保存在20%乙醇中,置于4℃备用。

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5×1 mL

 

附表1 HisSep Ni-NTA Agarose Resin试剂耐受情况

试剂种类

浓度

还原剂

5 mM DTE

0.5-1 mM DTT

20 mM β-mercaptoethanol

5 mM TCEP

10 mM reduced glutathione

变性剂

8 M urea

6 M Gua-HCl

去污剂

2% TritonTM X-100,nonionic

2% TweenTM20,nonionic

2% NP-40,nonionic

2% Cholate,anionic

1% CHAPS,zwitterionic

其他类

500 mM imidazole

20% ethanol

50% glycerol

100 mM Na2SO4

1.5 M NaCl

1 mM EDTA

60 mM citrate

缓冲液

50 mM sodium phosphate,pH7.4

100 mM Tris-HCl,pH7.4

100 mM Tris-acetate,pH7.4

100 mM HEPJP,pH7.4

100 mM MOPS,pH7.4

100 mM sodium acetate,pH7.4

 

缓冲液名称

配方

配制1L溶液所需各种试剂量

Lysis Buffer,pH8.0

50 mM NaH2PO4

300 mM NaCl

10 mM imidazole

NaOH调pH至8.0,0.22 µm或0.45 µm过滤除菌

NaH2PO·2H2O    7.8 g

NaCl             17.54 g

Imidazole         0.68 g

Wash Buffer,pH8.0

50 mM NaH2PO4

300 mM NaCl

20 mM imidazole

NaOH调pH至8.0,0.22 µm或0.45 µm过滤除菌

NaH2PO·2H2O    7.8 g

NaCl             17.54 g

Imidazole         1.36 g

Elution Buffer,pH8.0

50 mM NaH2PO4

300 mM NaCl

250 mM imidazole

NaOH调pH至8.0,0.22 µm或0.45 µm过滤除菌

NaH2PO·2H2O    7.8 g

NaCl             17.54 g

Imidazole         17.0 g

附表2 可溶性His标签蛋白纯化所需缓冲液及配方

 

附表3 包涵体His标签蛋白纯化所需缓冲液及配方

缓冲液名称

配方

配制1L溶液所需各种试剂量

Lysis Buffer,pH8.0

8 M Urea

100 mM NaH2PO4

100 mM Tris·HCl

盐酸溶液调pH至8.0,0.22 µm或0.45 µm过滤除菌

Urea             480.5 g

NaH2PO·2H2O    15.6 g

Tris              15.76 g

Wash Buffer,pH6.3

8 M Urea

100 mM NaH2PO4

100 mM Tris·HCl

盐酸溶液调pH至6.3,0.22 µm或0.45 µm过滤除菌

Urea             480.5 g

NaH2PO·2H2O    15.6 g

Tris              15.76 g

Elution Buffer,pH4.5

8 M Urea

100 mM NaH2PO4

100 mM Tris·HCl

盐酸溶液调pH至4.5,0.22 µm或0.45 µm过滤除菌

Urea             480.5 g

NaH2PO·2H2O    15.6 g

Tris              15.76 g

 

附表4 问题及解决方案

问题

可能原因

推荐解决方案

柱子反压过高

填料被堵塞

裂解液中可能含微小的固体颗粒,建议上柱前使用滤膜(0.22 µm或0.45 µm)过滤,或离心去除。

样品中含高浓度的核酸,延长破碎时间直至粘度降低,或添加DNaseI   (终浓度为5 µg/mL),Mg2+(终浓度1 mM),冰上孵育10-15 min

样品太黏稠

有机试剂或蛋白稳定试剂(如甘油等)可能会引起反压增高,降低操作流速。

洗脱组分中无目的蛋白

蛋白可能是包涵体

可通过电泳检测裂解液,分析上清中是否有目的蛋白,包涵体蛋白需按照包涵体蛋白的纯化方式

表达量太低

优化表达条件,使用包涵体纯化缓冲体系

目的蛋白结合比较弱,在洗杂步骤中已被洗下来

提高Wash Buffer的pH值,或者降低咪唑浓度

目的蛋白结合过强,不容易洗脱下来

降低Elution Buffer 的pH,或者增加Elution Buffer中的咪唑浓度

使用10-100 mM EDTA溶液剥离镍离子,同时得到蛋白

蛋白降解

菌体破碎时需添加一些蛋白酶抑制剂

在4℃下进行纯化操作

洗脱组分不纯(含多种蛋白)

洗杂不彻底

增加Wash Buffer 体积

样品中含有其他His标签蛋白

通过调节pH值或咪唑浓度来优化洗杂条件。再使用其他纯化手段(如去离子交换,疏水等)进一步纯化洗脱组分。

填料颜色变浅或变成白色

镍离子脱落或者剥离

按照填料再生的操作重新挂镍离子

填料呈现褐色

缓冲液中含有DTT等还原剂

参考附3适当降低还原剂DTT的浓度,或改用巯基乙醇

上样过程中蛋白发生沉淀

操作温度太低

室温下进行上样

蛋白发生聚集

在样品和所有缓冲液中添加稳定剂,如0.1%Triton X-100或Tween-20

 

Q:为什么填料会呈现褐色?

A:缓冲液中含有DTT 等还原剂,适当降低还原剂 DTT 的浓度,或改用巯基乙醇。

Q:为什么在上样过程中蛋白发生沉淀?

A:可能是操作温度太低,建议在可在室温下进行上样。

Q:洗脱组分不纯(含多种蛋白)是什么原因?

A:可能是洗杂不彻底:建议增加Wash Buffer 体积;

Q:为什么洗脱组分中无目的蛋白?

A:可能是目的蛋白结合比较弱,在洗杂步骤中已被洗下来:提高 Wash Buffer 的pH 值,或者降低咪唑浓度。

[1] Li C, Zhan W, Yang Z, et al. Broad neutralization of SARS-CoV-2 variants by an inhalable bispecific single-domain antibody. Cell. 2022;185(8):1389-1401.e18. doi:10.1016/j.cell.2022.03.009(IF:41.584)
[2] Li X, Liang Y, Lian C, et al. CST6 protein and peptides inhibit breast cancer bone metastasis by suppressing CTSB activity and osteoclastogenesis. Theranostics. 2021;11(20):9821-9832. Published 2021 Oct 11. doi:10.7150/thno.62187(IF:11.556)
[3] Zhang Z, Chu Y, Li C, et al. Anti-PEG scFv corona ameliorates accelerated blood clearance phenomenon of PEGylated nanomedicines. J Control Release. 2021;330:493-501. doi:10.1016/j.jconrel.2020.12.047(IF:7.727)
[4] Zhang X, Tang W, Wen H, et al. Evaluation of CTB-sLip for Targeting Lung Metastasis of Colorectal Cancer. Pharmaceutics. 2022;14(4):868. Published 2022 Apr 15. doi:10.3390/pharmaceutics14040868(IF:6.321)
[5] Wu Q, Huang Y, Gu L, Chang Z, Li GM. OTUB1 stabilizes mismatch repair protein MSH2 by blocking ubiquitination. J Biol Chem. 2021;296:100466. doi:10.1016/j.jbc.2021.100466(IF:5.157)

产品描述

HisSep Ni-NTA Agarose Resin 6FF以高度交联的6%琼脂糖凝胶为基质,通过化学方法偶联四配位的氮川三乙酸(NTA)为配体,螯合镍离子(Ni2+)后,形成非常稳定的八面体结构,镍离子处于八面体的中心,这样的结构可保护镍离子免受小分子的进攻,更加稳定,可以耐受一定浓度的还原剂、变性剂或耦合剂等苛刻条件。此外,因其基质的耐压性(可耐受最高0.3 MPa的压力),该产品可以用于工业大规模蛋白的纯化,可在相对较高的流速下,实现对目的蛋白的纯化。

产品性质

基质(Matrix)

高度交联的6%琼脂糖凝胶

粒径(Bead size)

45-165 µm

载量(Capacity)

>40 mg 6×His-tagged protein/mL基质

耐压(Tolerance Pressuremax

0.3 MPa,3 bar

储存缓冲液(Buffer)

含20%乙醇的1×PBS

运输和保存方法

冰袋运输。4℃保存。有效期2年。

注意事项

1) 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
2)本产品仅作科研用途!

使用方法

一、纯化流程

缓冲液的准备

缓冲液使用原理:低咪唑上样,高咪唑洗脱,或者高pH上样,低pH洗脱。Buffer 在使用前最好用0.22 µm或0.45 µm滤膜过滤除菌。可溶性组氨酸标签蛋白纯化所需配方详见附表2。包涵体组氨酸标签蛋白纯化所需缓冲液及配方详见附表3。

 

样品准备

2.1 细菌表达的蛋白(本说明以细菌表达的蛋白纯化为例)

1)挑取单菌落到含有适合抗性的LB培养基中,根据载体说明加入相应的诱导剂诱导相应的时间。
2)表达结束后,将培养液转至离心瓶,7000 rpm,离心15 min,收集菌体,然后加入1/10体积的裂解液(Lysis buffer)和PMSF(PMSF在破碎前加入,其终浓度为1 mM),同时也可加入其他蛋白酶抑制剂,但不能影响目的蛋白与树脂的结合。
3)之后加入溶菌酶,使其工作浓度为1 mg/mL。
注:如果表达的宿主细胞内含pLysS或pLysE,可以不加入溶菌酶。
4)将菌体沉淀悬浮起来(如果菌液浓度高,可考虑加入10 µg/mL RNase A和5 µg/mL DNase I),混匀,置于冰上超声破碎细胞,至菌液基本保持澄清。
5)收集上述澄清蛋白液至离心管中,10000 rpm,4℃离心20-30 min。取上清,置于冰上备用或-20℃保存。

2.2 酵母、昆虫和哺乳细胞分泌表达的可溶性蛋白

将细胞培养液转移至离心瓶,5000 rpm离心10 min,收集上清。如上清中不含EDTA、组氨酸和还原剂等,即可直接上柱纯化;如含有EDTA、组氨酸和还原剂等物质,则需用1×PBS 4℃下透析后方可上柱。

注:对于大量体积的上清,需加入硫酸铵进行沉淀浓缩,之后经1×PBS 4℃下透析后上柱。

2.3 包涵体蛋白纯化(以细菌为例)

1)将培养液转移至离心瓶,7000 rpm,离心15 min,收集菌体去上清。

2)按照菌体:裂解液=1:10(w/v)的比例将菌体充分悬浮,混匀,冰浴超声破碎。

3)将破碎液转移至离心管,10000 rpm,4℃离心20-30 min,去上清。可重复步骤2)和3)一次。

4)按照菌体:裂解液(含8M尿素)=1:10(w/v)的比例将包涵体充分悬浮。

5)变性条件下纯化His标签蛋白纯化。

装柱

1)用去离子水冲洗层析柱底筛板与接头,确保柱底筛板上无气泡,关闭柱底出口,并在柱底部留出1-2 cm的去离子水。

2)将树脂悬浮,小心地将浆液连续地倒入层析柱中。用玻璃棒沿着柱壁倒入浆液可减少气泡的产生。
3)如果使用储液器,应立即在层析柱和储液器中加满水,将进样分配器放置于浆液表面,连接至泵上,避免在分配器或进样管中产生气泡。
4)打开层析柱底部出口,开启泵,使其在设定的流速下进行。最初应让缓冲液缓慢流过层析柱,然后缓慢增加至最终流速,这样可避免液压对所形成柱床的冲击,也可以避免柱床形成的不均匀。如达不到推荐的压力或流速,可以用所用泵的最大流速,这样也可以达到一个较好的装填效果。当柱床高度稳定后,在最后的装柱流速下至少再上3倍柱体积的去离子水。标上柱床高度。注:在随后的色谱程序中,不要超过最大装柱流速的75%。

5)关闭泵,关闭层析柱出口。

6)如使用储液器,去除储液器,将分配器置于层析柱中。

7)将分配器推向柱子至标记的柱床高度处。允许装柱液进入分配器,锁紧分配器接头。

8)将装填好的层析柱连接至泵或色谱系统中,开始平衡。如需要可重新调整分配器。

样品纯化
装柱后,可用各种常规的中压色谱系统,以AKTA使用为例进行说明:
1)将泵管道注满去离子水。去掉产品上塞,连接至色谱系统中,打开下出口,将纯化柱连接到色谱系统中,注意旋紧。

2)3-5倍柱体积去离子水冲洗纯化柱。

3)至少5倍柱体积的Lysis Buffer 平衡色谱柱。1ml规格预装柱推荐流速为1 mL/min,5 mL预装柱推荐流速为5 mL/min。
4)利用泵或注射器上样,收集流出液,以便SDS-PAGE检测蛋白结合情况。
注:若样品粘度增加,即使上样体积很少也会导致层析柱很大反压;上样量不要超过柱子的结合能力;大量样品体积也可能造成很大的反压,使得进样器更难使用。

5)Wash Buffer 平衡柱子,直到紫外吸收达到一个稳定的基线(一般至少10-15个柱体积)。

注:在样品和结合缓冲液中加入低浓度咪唑可以提高样品纯度。
6)Elution Buffer一步法或梯度法进行洗脱。一步法洗脱中一般5倍柱体积洗脱液即可。梯度洗脱可以用一个小的梯度,例如20倍柱体积或更多来分离不同结合强度的蛋白质。
7)建议用更高浓度咪唑(如500 mM)彻底清洗纯化柱上结合的杂蛋白。随后依次用3倍柱体积的Lysis Buffer和5倍柱体积的去离子水清洗树脂。5倍柱体积的20%乙醇平衡树脂,最后将树脂保存在20%乙醇的1×PBS中,置于4℃保存。

 

5 SDS-PAGE检测

将纯化过程中得到的样品(包括原始样品、流出组分、洗杂及洗脱组分等)利用SDS-PAGE进行检测,判定其纯化效果。

 

二、在位清洗

当填料使用过程中发现反压过高(>0.5 Mpa)或者填料上面出现明显的污染时,需对其进行在位清洗(Cleaning-in-Place,CIP)。在位清洗时,先把Ni2+脱掉,清洗结束后,将填料保存在20%乙醇中,后者重新挂Ni后再保存在20%乙醇中。建议按照下面操作去除填料上残留的污染物,如沉淀蛋白、疏水蛋白和脂蛋白等。

去除强疏水结合的蛋白,脂蛋白和脂类

使用30%异丙醇清洗5-10个柱体积,接触时间为15-20 min可以去除此类污染物。之后再用去离子水清洗10倍柱体积。也可以选择使用含有去污剂的酸性或者碱性溶液清洗填料2倍柱体积。例如含有0.1-0.5%非离子去污剂的0.1 M醋酸溶液,接触时间为1-2 h。去污剂处理后,需用70%的乙醇清洗5倍柱体积,彻底去除去污剂。最后利用去离子水清洗10倍柱体积。

去除离子作用结合的蛋白

使用1.5 M NaCl 溶液接触10-15 min,之后用去离子水清洗10倍柱体积。

 

三、填料再生

当填料使用过程中发现反压过高(>0.5 Mpa),填料上面出现明显的污染,或填料载量明显变低时,需要对其进行镍离子剥离及重新挂镍处理,即填料再生。按照下面操作流程进行:

1)使用5倍柱体积去离子水清洗填料;

2)使用5倍柱体积100mM EDTA(pH 8.0)剥落镍离子;

3)使用10倍柱体积去离子水清洗填料;

4)使用0.5M NaOH清洗5倍柱体积,停留10-15min;

5)使用10倍柱体积去离子水清洗填料;

6)使用3-5倍柱体积100mM NiSO4再生挂镍;

7)去离子水清洗10倍柱体积。

填料再生后,可立即使用,也可保存在20%乙醇中,置于4℃备用。

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5×1 mL

 

附表1 HisSep Ni-NTA Agarose Resin试剂耐受情况

试剂种类

浓度

还原剂

5 mM DTE

0.5-1 mM DTT

20 mM β-mercaptoethanol

5 mM TCEP

10 mM reduced glutathione

变性剂

8 M urea

6 M Gua-HCl

去污剂

2% TritonTM X-100,nonionic

2% TweenTM20,nonionic

2% NP-40,nonionic

2% Cholate,anionic

1% CHAPS,zwitterionic

其他类

500 mM imidazole

20% ethanol

50% glycerol

100 mM Na2SO4

1.5 M NaCl

1 mM EDTA

60 mM citrate

缓冲液

50 mM sodium phosphate,pH7.4

100 mM Tris-HCl,pH7.4

100 mM Tris-acetate,pH7.4

100 mM HEPJP,pH7.4

100 mM MOPS,pH7.4

100 mM sodium acetate,pH7.4

 

缓冲液名称

配方

配制1L溶液所需各种试剂量

Lysis Buffer,pH8.0

50 mM NaH2PO4

300 mM NaCl

10 mM imidazole

NaOH调pH至8.0,0.22 µm或0.45 µm过滤除菌

NaH2PO·2H2O    7.8 g

NaCl             17.54 g

Imidazole         0.68 g

Wash Buffer,pH8.0

50 mM NaH2PO4

300 mM NaCl

20 mM imidazole

NaOH调pH至8.0,0.22 µm或0.45 µm过滤除菌

NaH2PO·2H2O    7.8 g

NaCl             17.54 g

Imidazole         1.36 g

Elution Buffer,pH8.0

50 mM NaH2PO4

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250 mM imidazole

NaOH调pH至8.0,0.22 µm或0.45 µm过滤除菌

NaH2PO·2H2O    7.8 g

NaCl             17.54 g

Imidazole         17.0 g

附表2 可溶性His标签蛋白纯化所需缓冲液及配方

 

附表3 包涵体His标签蛋白纯化所需缓冲液及配方

缓冲液名称

配方

配制1L溶液所需各种试剂量

Lysis Buffer,pH8.0

8 M Urea

100 mM NaH2PO4

100 mM Tris·HCl

盐酸溶液调pH至8.0,0.22 µm或0.45 µm过滤除菌

Urea             480.5 g

NaH2PO·2H2O    15.6 g

Tris              15.76 g

Wash Buffer,pH6.3

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100 mM NaH2PO4

100 mM Tris·HCl

盐酸溶液调pH至6.3,0.22 µm或0.45 µm过滤除菌

Urea             480.5 g

NaH2PO·2H2O    15.6 g

Tris              15.76 g

Elution Buffer,pH4.5

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100 mM NaH2PO4

100 mM Tris·HCl

盐酸溶液调pH至4.5,0.22 µm或0.45 µm过滤除菌

Urea             480.5 g

NaH2PO·2H2O    15.6 g

Tris              15.76 g

 

附表4 问题及解决方案

问题

可能原因

推荐解决方案

柱子反压过高

填料被堵塞

裂解液中可能含微小的固体颗粒,建议上柱前使用滤膜(0.22 µm或0.45 µm)过滤,或离心去除。

样品中含高浓度的核酸,延长破碎时间直至粘度降低,或添加DNaseI   (终浓度为5 µg/mL),Mg2+(终浓度1 mM),冰上孵育10-15 min

样品太黏稠

有机试剂或蛋白稳定试剂(如甘油等)可能会引起反压增高,降低操作流速。

洗脱组分中无目的蛋白

蛋白可能是包涵体

可通过电泳检测裂解液,分析上清中是否有目的蛋白,包涵体蛋白需按照包涵体蛋白的纯化方式

表达量太低

优化表达条件,使用包涵体纯化缓冲体系

目的蛋白结合比较弱,在洗杂步骤中已被洗下来

提高Wash Buffer的pH值,或者降低咪唑浓度

目的蛋白结合过强,不容易洗脱下来

降低Elution Buffer 的pH,或者增加Elution Buffer中的咪唑浓度

使用10-100 mM EDTA溶液剥离镍离子,同时得到蛋白

蛋白降解

菌体破碎时需添加一些蛋白酶抑制剂

在4℃下进行纯化操作

洗脱组分不纯(含多种蛋白)

洗杂不彻底

增加Wash Buffer 体积

样品中含有其他His标签蛋白

通过调节pH值或咪唑浓度来优化洗杂条件。再使用其他纯化手段(如去离子交换,疏水等)进一步纯化洗脱组分。

填料颜色变浅或变成白色

镍离子脱落或者剥离

按照填料再生的操作重新挂镍离子

填料呈现褐色

缓冲液中含有DTT等还原剂

参考附3适当降低还原剂DTT的浓度,或改用巯基乙醇

上样过程中蛋白发生沉淀

操作温度太低

室温下进行上样

蛋白发生聚集

在样品和所有缓冲液中添加稳定剂,如0.1%Triton X-100或Tween-20

 

Q:为什么填料会呈现褐色?

A:缓冲液中含有DTT 等还原剂,适当降低还原剂 DTT 的浓度,或改用巯基乙醇。

Q:为什么在上样过程中蛋白发生沉淀?

A:可能是操作温度太低,建议在可在室温下进行上样。

Q:洗脱组分不纯(含多种蛋白)是什么原因?

A:可能是洗杂不彻底:建议增加Wash Buffer 体积;

Q:为什么洗脱组分中无目的蛋白?

A:可能是目的蛋白结合比较弱,在洗杂步骤中已被洗下来:提高 Wash Buffer 的pH 值,或者降低咪唑浓度。

[1] Li C, Zhan W, Yang Z, et al. Broad neutralization of SARS-CoV-2 variants by an inhalable bispecific single-domain antibody. Cell. 2022;185(8):1389-1401.e18. doi:10.1016/j.cell.2022.03.009(IF:41.584)
[2] Li X, Liang Y, Lian C, et al. CST6 protein and peptides inhibit breast cancer bone metastasis by suppressing CTSB activity and osteoclastogenesis. Theranostics. 2021;11(20):9821-9832. Published 2021 Oct 11. doi:10.7150/thno.62187(IF:11.556)
[3] Zhang Z, Chu Y, Li C, et al. Anti-PEG scFv corona ameliorates accelerated blood clearance phenomenon of PEGylated nanomedicines. J Control Release. 2021;330:493-501. doi:10.1016/j.jconrel.2020.12.047(IF:7.727)
[4] Zhang X, Tang W, Wen H, et al. Evaluation of CTB-sLip for Targeting Lung Metastasis of Colorectal Cancer. Pharmaceutics. 2022;14(4):868. Published 2022 Apr 15. doi:10.3390/pharmaceutics14040868(IF:6.321)
[5] Wu Q, Huang Y, Gu L, Chang Z, Li GM. OTUB1 stabilizes mismatch repair protein MSH2 by blocking ubiquitination. J Biol Chem. 2021;296:100466. doi:10.1016/j.jbc.2021.100466(IF:5.157)