探针法支原体检测试剂盒说明书
产品详情
货号
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规格
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价格
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78EA10018-50T
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50T
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2600
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产品描述
《探针法支原体检测试剂盒》具有支原体识别率、最高的检测灵敏度、最高的检测正确率、含内参对照 从而可以区分真阴性样品和假阴性样品等一系列优点,该方法被认为是支原体快速检测的金标准。如果您实验室 已经拥有(或者打算购买)荧光定量 PCR 仪,我们强烈推荐您选择《探针法支原体检测试剂盒》。
经测试,本公司开发的《探针法支原体检测试剂盒》至少可以识别在体外细胞培养中曾经报道出现的 20 种支 原体,根据文献报道,这些支原体基本上占污染细胞的支原体种类。具体如下:(1)M. hyorhinis、(2) M. fermentans、(3)M. arginini、(4)M. hominis、(5)M. orale、(6)M. salivarium、(7)M.pirum、(8)A. laidlawii、(9)M. agalactiae、(10)M. bovis、(11) M. bovoculi、(12)A. axanthum、(13)M. buccale、 (14) M. pneumoniae、(15)M. arthritidis、(16)M. pulmonis、(17)M. gallisepticum、(18)M. gallinarum、(19)M. canis、 (20)Ureaplasma urealyticum(注:M.为 Mycoplasma 的缩写;A.为 Acholeplasma 的缩写)。
根据支原体 DNA 的 序列,本试剂盒可以识别 100 多种至今已发现的支原体,具有广谱的识别能力。
产品组分
(1) 探针法溶液 1P:550 μL(50 次),含支原体和内参检测用引物及荧光探针;
(2) 探针法溶液 2T:50 μL(50 次),酶溶液;
(3) 内参质粒 mycoIC2:500 μL;
(4) 去离子水:1.2 mL;
(5) 阳性支原体 DNA:50 μL。
使用方法
使用方法
待测样品的前处理 为了准确判断细胞是否有支原体的污染,待测的细胞培养液样品需要取自换液后培养 2-3 天且汇合度在 90% 左右的细胞培养液上清(贴壁细胞)。悬浮培养的细胞也需要在换液传代后,让细胞生长 2-3 天再取培养液进行检 测。可以按照以下两种方法之一进行样品的前处理: 方法一:对样品进行支原体 DNA 的提取。 很多样品(比如:培养很多天的细胞上清、血清、血浆等)由于含有抑制 PCR 扩增的成分,如果样品不进行 前处理而直接检测,有可能导致 qPCR 扩增失败(qPCR 结果:支原体通道和内参对照通道均无扩增曲线)。该类样品建议客户进行样品 DNA 提取(或者离心清洗,见后文方法二)后,再进行检测。提取 DNA 的过程有两个作用:
(1)基本可以去除所有抑制 PCR 扩增的成分,保证后续定量 PCR 扩增的正常进行;
(2)具有浓缩支原体 DNA 的作用,可以提高相对检测灵敏度 10-100 倍。 样品 DNA 的提取推荐使用本公司的《支原体基因组 DNA 提取试剂盒》。不同样品支原体基因组 DNA 的提取步骤,请参考本公司的《支原体基因组 DNA 提取试剂盒》的说明书。
方法二:样品不经 DNA 提取(推荐方法。该方法不仅可以浓缩支原体从而提高相对检测灵敏度,还可以去 除绝大部分可能的抑制物,PCR 扩增被抑制的可能性极低。如果该简单一步离心清洗的方法仍然无法去除抑制 物,可以使用后文注意事项部分的三步离心清洗的方法。),具体方法如下:
(1)根据浓缩倍数,可以取 100 – 1500 μL 上述待测样品到 1.5 mL 离心管内,在普通台式离心机上 1000 rpm (大约 150 g)低速离心 5 minutes,将离心后的上清转移到另一个离心管内,丢弃细胞沉淀。
(2)将上清继续 13000 rpm(约 16000 g)高速离心 5 minutes,小心吸走全部上清(为避免碰到底部沉 淀,可以保留底部 3-5 μL 液体),用 50μL 5 mM Tris-HCl, pH 8.0-8.8(样品可以长期保存。推荐)或者去 离子水(样品比较不稳定,只适合当天或短期内检测使用)重悬沉淀(沉淀中含有支原体),吹吸均匀【如果最初使用了 1500 μL 的样品,则支原体浓度大约提高了 30 倍】。
(3)往 50 μL 重悬后的样品中加入 4 μL 内参质粒 mycoIC2【内参质粒融化后,请混匀后再吸取】。
(4)至此,该样品可以直接进行检测,也可以进行热处理后再检测(热处理后,样品保存更稳定)。热 处理具体如下:95 ℃加热处理 5 minutes(可以转移到 PCR 管内,在 PCR 仪上进行加热处理),简单离心 (1000 g,5 seconds)后,取上清进行检测。
实验案例分析
阳性对照管:其 FAM 通道有典型的 S 型扩增曲线(即指数扩增),其 VIC 通道的扩增线呈直线或者S型曲线。
阴性对照管:其 FAM 通道的扩增线呈直线,其 VIC 通道应该有典型的 S 型扩增曲线。
如果阳性对照管、阴性对照管同时满足上述条件,则说明本次实验结果有效,否则实验结果无效。典型的阴性直线型扩增线和阳性 S 型扩增曲线如图 1 所示:
图 1. 典型的阴性直线型扩增线(左)和阳性 S 型扩增曲线(右)
注意事项
1. 实验全过程,应该佩戴一次性手套操作。
2. 如果出现qPCR的扩增被细胞的代谢产物抑制时(qPCR 结果:支原体通道和内参对照通道均无扩增曲线), 可以采取以下几种措施:
1) 将取样的时间提前到换液后 2 天或 3 天,此时细胞上清的 PCR 扩增抑制物相对比较少,一般不会产生严重的抑制。据我们测试,换液后 5 天,PCR 扩增抑制物就已经大量积累。
2) 用 PBS 对待测样品进行离心清洗,去除样品中的抑制物。具体方法如下:取 1 mL 细胞上清,先 13000 rpm 离心 5 minutes,吸走 950 μL 上清;加 PBS 950 μL,再次离心,吸走 950 μL 上清;再加 PBS 950 μL, 第三次离心,小心吸走全部上清(为避免碰到底部沉淀,可以保留底部 3-5 μL 液体),用 50 μL 5 mM Tris-HCl, pH 8.0-8.8 重悬沉淀,95 ℃加热处理 5 minutes,简单离心(1000 g,5 seconds)后,取上清进行检测。但是该方法有如下缺点:第一,如果样品支原体含量较少,离心清洗可能导致漏检,因为离心清洗过程中,可能导致支原体部分丢失。第二,个别样品,即使经过上述清洗也无法去除抑制剂。
3) 使用支原体基因组 DNA 抽提试剂盒(推荐使用本公司《支原体基因组 DNA 提取试剂盒》),抽提细胞上清的支原体 DNA 后再进行 PCR 鉴定。
4) 使用本公司生产的《一步法恒温支原体检测试剂盒》或者《发光法支原体检测试剂盒》进行检测,经测试,未发现这两种试剂盒会被细胞的代谢产物所抑制。
为了预防 PCR 的扩增被细胞的代谢产物抑制的问题,也可以考虑将所有待测样品全部进行离心清洗或者DNA 提取后,再使用本试剂盒进行检测。
3. 支原体检测样品可以分成两类:第一类,用含血清的培养液培养的哺乳动物细胞上清液,由于该条件非常适合支原体生长,培养数天后,支原体密度一般较高,可达107-9/mL,可以直接检测。第二类,低温保存的血浆、血清、脐带血、胰酶、抗生素、未使用的培养液等样品,由于这些样品即使有支原体污染,支原体含量一般很少,直接使用快速支原体检测试剂盒进行检测,往往检测不出来。这些样品建议:
(1)对样品的支原体进行离心浓缩或者使用本公司《支原体基因组 DNA 提取试剂盒》将支原体 DNA 浓缩提取,该两种方法大约可以将检测灵敏度继续提高 10-100 倍。该方法速度快,当天出结果,但是可靠性不如后面的培养法。
(2)使用支原体液体培养基(必须同时接种不含精氨酸和含精氨酸的两种支原体液体培养基)培养3-7 天后,再进行检测。具体方法请参考本公司《发光法支原体检测试剂盒》说明书中最后的注意事项部分。该方法速度较慢,需要 3-7 天,但是可靠性高。