Paragon Genomics CleanPlex说明书

 

CleanPlex® Ready-to-Use NGS Panels | Product Sheet CleanPlex® BRCA1 & BRCA2 Panel v3

CleanPlex®即用NGS面板|产品表CleanPlex®BRCA1&BRCA2面板v3

Sensitive detection of somatic and germline mutations in BRCA1and BRCA2

BRCA1和BRCA2体细胞和生殖系突变的敏感检测

亮点•目标区域的高覆盖率以整个编码区域为目标，包括在所有目标编码外显子周围填充20个碱基•敏感检测仅使用20 ng DNA检测低至1%变异等位基因频率的体细胞突变•快速，简化的工作流程使用快速的三步协议在3小时内生成可排序的库•性能使用CleanPlex®技术准备高质量的NGS库，具有的目标一致性和覆盖均匀性性能，以便有效地使用排序读取并降低成本

CleanPlex®BRCA1和BRCA2面板v3是一种多重PCRBase靶向重排序分析，旨在简化BRCA1和BRCA2基因体细胞和生殖系变异的评估。该小组的目标是BRCA1和BRCA2的所有外显子区域和20bpof侧翼内含子序列。从20纳克的DNA开始，测序准备好的文库可以在3小时内使用一个简化的工作流程来准备。该面板经过优化，可提供高目标性能和高覆盖均匀性的数据，以确保高效使用顺序读取。

灵敏的检测CleanPlex BRCA1和BRCA2面板v3只需要20 ng输入DNA（每个引物池10 ng），就可以检测1%频率的体细胞突变。平均扩增子大小为148bp，与从FFPE组织中分离的DNA等降解样品也相容。

 

CleanPlex BRCA1和BRCA2面板v3规格

参数规范富集方法多重PCR测序平台Illumina®离子流™ 基因数2靶点BRCA1和BRCA2基因的全外显子累积靶点大小19785bp变异型SNV，索引若干扩增子237扩增子大小111-200bp（平均148bp）引物池数2输入DNA要求10-40ng/池（推荐10 ng/池）血液、唾液样本类型基因组DNA，或组织；FFPE DNA总分析时间3小时手控时间75分钟设计覆盖率100%覆盖均匀性（平均覆盖率>0.2X的靶点）≥95%靶点对齐读数≥95%A。SNVs：单核苷酸变异；索引：插入缺失

CleanPlex流线型工作流CleanPlex BRCA1&BRCA 2 Panel v3提供了一个快速、流线型的工作流。从纯化和定量DNA开始，基于多重PCR的方案可以在3小时内完成，75分钟的操作时间，使用三步工作流程，小的管到管传输。每个步骤包括一个热循环或培养条件，然后使用磁珠进行“带珠”纯化.

CleanPlex背景清洗化学CleanPlex BRCA1和BRCA2面板v3由Paragon Genomics的CleanPlex技术提供动力，该技术使用专有的多重PCR背景清洗化学来有效去除非特异性PCR产品，从而获得宜的目标富集性能和测序读数的有效使用.

Recommended Sample Multiplexing for CleanPlex BRCA1 & BRCA2 Panel v3

每次运行的仪器样品™ 100系统7 MiniSeq™ 系统（中输出）14 MiniSeq系统（高输出）45 MiSeq®系统（v2化学纳米）1 MiSeq系统（v2化学微）7 MiSeq系统（v2化学）27 MiSeq系统（v3化学）45 A.每次运行的样品预期平均读取深度为5000x。
推荐

 

 

用于检测种系突变：每次运行的仪器样品™ 100系统73 MiSeq®系统（v2化学纳米）18 MiSeq系统（v2化学微米）73 B。每次运行的样品预期平均读取深度为500倍。

 

产品SKU CleanPlex BRCA1&BRCA2 Panel v3（8个反应）916112

CleanPlex BRCA1&BRCA2 Panel v3（96个反应）916113

CleanPlex双索引PCR引物，适用于Illumina集合A1（16个索引，16个反应）716005

CleanPlex双索引PCR引物，适用于Illumina集合A（96个索引，96反应）716006

清洁磁珠（1毫升）718001清洁磁珠（5毫升）718002清洁磁珠（60毫升）718003