invitek-molecular 土壤微生物dna提取试剂盒说明书
Instructions for useInvisorb® Spin Soil DNA Kit
该产品用于使用旋转柱技术手动分离土壤样品中微生物的DNA。
用户实验室设备提供的试剂和设备:
•微型离心机(所有方案均通过5415 D Eppendorf离心机验证)
•可选:离心15或50 ml
•热振动器(37°C-95°C)
•量筒(250 ml)
•一次性手套
•移液管和移液管尖
•涡流混合器
•反应管(1.5 ml、2.0 ml)
液体和溶剂:
•DNase/RNase游离水
•96-100%乙醇(非变性)
•异丙醇*
*用2-丙醇验证试剂盒;Carl Roth的Rotipuran®>99.7%,p.a.,ACS,ISO(订单号6752)
预期用途
Invisorb®旋转土壤DNA试剂盒是一种基于旋转柱技术的核酸提取试剂盒,用于从土壤样品中分离和纯化微生物DNA。相关的样品材料,如降解的植物材料或沙子也可用于样品提取。
该产品仅供专业人员使用,如实验室技术人员、医生和受过分子生物学技术培训的生物学家。
纯化DNA的产量和质量取决于细菌含量、样品来源和储存。土壤样品的性质和成分差异很大。腐殖酸含量、植物降解产物的比例和许多其他参数影响微生物组成,从而影响DNA产量。典型产率为1–10µg。
下游应用:
分离的核酸的产量和质量通常适用于大量分子诊断应用,如PCR技术、微生物组分析(NGS)和杂交方法。下游应用应根据各自制造商的规范进行。
原则和程序
1.溶解样品
土壤样品在高温变性条件下在裂解缓冲液P中裂解。
植物或动物源的生物材料在室温下裂解,细菌细胞和其他微生物的生物材料通过在90°C下孵育而有效裂解,建议对难以裂解的细胞(如革兰氏阳性菌)采用加热步骤。此外,添加氧化锆珠以提高裂解效率。
2.去除PCR抑制剂和蛋白质消化
裂解后,土壤中存在的DNA降解物质和PCR抑制剂被吸附到InviAdsorb基质上。InviAdsorb位于预先填充的安全锁定管中,必须将裂解液放入其中。结合的污染物和细胞碎片通过离心法造粒。上清液含有预纯化的DNA。
将蛋白酶K添加到上清液中以在高温下消化和降解蛋白质。
3.结合核酸
通过向裂解液中加入结合缓冲液A,调节最佳结合条件。然后将每种裂解物应用于RTA旋转过滤器,并将核酸吸附到膜上。
4.清洗以去除残留污染物
使用洗涤缓冲液I和洗涤缓冲液II有效地洗涤污染物,同时核酸仍与膜结合。
5.洗脱DNA
使用50-100µl洗脱缓冲液从RTA旋转过滤器中洗脱核酸。