在免疫过氧化物酶染色期间，已在组织切片中观察到内源性过氧化物酶活性。如果没有得到适当的抑制，内源性过氧化物酶会在免疫染色过程中产生错误信号和高背景。在应用一抗之前用过氧化物酶阻滞剂处理组织切片会抑制内源性过氧化物酶活性。