一步法RT-qPCR探针试剂盒|Hifair® Ⅲ One Step RT-qPCR Probe Kit
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COA
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Hifair® Ⅲ One Step RT-qPCR Probe Kit是以RNA为模板进行定量PCR反应的试剂盒。在实验的过程中,逆转录和定量PCR在同一反应管中进行,简化了实验操作,降低了污染的风险。本试剂盒以RNA为模板,使用基因特异性引物,利用耐热Hifair® Ⅲ Reverse Transcriptase高效合成第一链cDNA,并搭配使用探针和UNICON® HotStart Taq DNA Polymerase,配合优化的缓冲体系能够特异灵敏的对RNA模板进行精确定量。
本试剂盒以预混的Mix形式提供,2×Hifair® Ⅲ P buffer包含优化的缓冲体系和dNTPs等,优化了有效抑制非特异性 PCR扩增的因子和提升PCR反应扩增效率的因子,适用于荧光标记探针的高特异性检测系统。此外,Hifair® UH Ⅲ Enzymes包含比例优化的Hifair® Ⅲ Reverse Transcriptase、RNase inhibitor及UNICON® HotStart Taq DNA Polymerase等。
产品组分
组分编号 |
组分名称 |
产品编号/规格 |
|
11145ES50 (50 T) |
11145ES70 (200 T) |
||
11145-A |
2×Hifair® Ⅲ P buffer |
500 μL |
2×1 mL |
11145-B |
Hifair® UH Ⅲ Enzymes |
50 μL |
200 μL |
11145-C |
Hieff® 50×High Rox |
20 μL |
80 μL |
11145-D |
Hieff® 50×Low Rox |
20 μL |
80 μL |
11145-E |
RNase free ddH2O |
500 μL |
2×1 mL |
【注】P buffer 为Probe buffer 的简写,UH 为UNICON-Hifair 的简写。
适用机型
High Rox 适用机型:ABI 5700, 7000, 7300, 7700, 7900HT Fast, StepOne™, StepOne Plus™
Low Rox 适用机型:ABI 7500, 7500 Fast, ViiA™7, QuantStudio™ 3 and 5, QuantStudio™ 6,7,12k Flex
Stratagene MX3000P™, MX3005P™, MX4000P™
不需要 Rox 校正的仪器型号:
Bio-Rad CFX96™, CFX384™, iCycler iQ™, iQ™5, MyiQ™, MiniOpticon™, Opticon®, Opticon® 2, Chromo4™
Eppendorf Mastercycler® ep realplex, realplex 2 s; Qiagen Corbett Rotor-Gene® Q, Rotor-Gene® 3000, Rotor-Gene® 6000
Roche Applied Science LightCycler® 480, LightCycler® 2.0; Lightcycler® 96
Thermo Scientific PikoReal Cycler; Cepheid SmartCycler®; Illumina Eco qPCR
运输和保存方法
冰袋运输。-20℃避光保存,有效期1年。本品避免反复冻融。建议分装保存。
注意事项
1. 实验过程中请使用 RNase free 耗材。
2. 为了您的安全和健康,请穿实验服并佩戴一次性手套操作。
反应体系(以 20 μL为例)
组分 |
加入量 |
终浓度 |
2×Hifair® Ⅲ P buffer |
10 μL |
1× |
Hifair® UH Ⅲ Enzymes |
1 μL |
– |
Hieff® 50×High Rox or Low Rox |
0.4 μL |
– |
Gene Specific Primer Forward (10 µM) |
0.4 μL |
0.2 μM |
Gene Specific Primer Reverse (10 µM) |
0.4 μL |
0.2 μM |
TaqMan Probe (10 µM) |
0.2 μL |
0.1 μM |
模板 RNA |
Total RNA: 1 pg-1 µg |
– |
RNase free ddH2O |
to 20 μL |
– |
【注】:
a 所有试剂使用前应充分混匀。
b 参比染料:Rox的添加,可根据不同仪器型号进行选择,具体可参考【适用机型】。
c 引物浓度:通常引物终浓度为0.2 μM,也可以根据情况在0.1-1.0 μM之间进行调整。
d 探针浓度:探针终浓度可在50 nM-250 nM之间调整。
e 体系配制:请于超净工作台内配制,并使用无核酸酶残留的枪头、反应管;推荐使用带滤芯的枪头。避免交叉污染和气溶胶污染。
f 模板稀释:一步法RT-qPCR灵敏度极高,推荐将模板稀释后(如稀释至2-5 μL/样本)加入反应体系中,这样可以有效提高实验的重复性。
g 反应体系:建议以大体系进行实验,如20 μL或50 μL。
标准扩增程序
反应阶段 |
温度 |
时间 |
循环数 |
|
1 |
逆转录 |
50℃a |
15 minb |
1 |
2 |
预变性 |
95℃ |
30 sec |
1 |
3 |
扩增反应 |
95℃ |
10 sec |
45 cycles |
60℃ |
30 secc |
【注】:
a 对于含复杂二级结构或高GC含量的RNA模板,可将逆转录温度提高到55℃,有助于提升扩增效率和灵敏度。
b 逆转录时间可以根据模板的复杂程度进行调整,时间为5min时可满足大多数基因的鉴定。
c 不同的qPCR检测仪器所需的荧光信号采集时间不同,请根据最短时间限制进行设置。
HB220304
Hifair® Ⅲ One Step RT-qPCR Probe Kit是以RNA为模板进行定量PCR反应的试剂盒。在实验的过程中,逆转录和定量PCR在同一反应管中进行,简化了实验操作,降低了污染的风险。本试剂盒以RNA为模板,使用基因特异性引物,利用耐热Hifair® Ⅲ Reverse Transcriptase高效合成第一链cDNA,并搭配使用探针和UNICON® HotStart Taq DNA Polymerase,配合优化的缓冲体系能够特异灵敏的对RNA模板进行精确定量。
本试剂盒以预混的Mix形式提供,2×Hifair® Ⅲ P buffer包含优化的缓冲体系和dNTPs等,优化了有效抑制非特异性 PCR扩增的因子和提升PCR反应扩增效率的因子,适用于荧光标记探针的高特异性检测系统。此外,Hifair® UH Ⅲ Enzymes包含比例优化的Hifair® Ⅲ Reverse Transcriptase、RNase inhibitor及UNICON® HotStart Taq DNA Polymerase等。
产品组分
组分编号 |
组分名称 |
产品编号/规格 |
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11145ES50 (50 T) |
11145ES70 (200 T) |
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11145-A |
2×Hifair® Ⅲ P buffer |
500 μL |
2×1 mL |
11145-B |
Hifair® UH Ⅲ Enzymes |
50 μL |
200 μL |
11145-C |
Hieff® 50×High Rox |
20 μL |
80 μL |
11145-D |
Hieff® 50×Low Rox |
20 μL |
80 μL |
11145-E |
RNase free ddH2O |
500 μL |
2×1 mL |
【注】P buffer 为Probe buffer 的简写,UH 为UNICON-Hifair 的简写。
适用机型
High Rox 适用机型:ABI 5700, 7000, 7300, 7700, 7900HT Fast, StepOne™, StepOne Plus™
Low Rox 适用机型:ABI 7500, 7500 Fast, ViiA™7, QuantStudio™ 3 and 5, QuantStudio™ 6,7,12k Flex
Stratagene MX3000P™, MX3005P™, MX4000P™
不需要 Rox 校正的仪器型号:
Bio-Rad CFX96™, CFX384™, iCycler iQ™, iQ™5, MyiQ™, MiniOpticon™, Opticon®, Opticon® 2, Chromo4™
Eppendorf Mastercycler® ep realplex, realplex 2 s; Qiagen Corbett Rotor-Gene® Q, Rotor-Gene® 3000, Rotor-Gene® 6000
Roche Applied Science LightCycler® 480, LightCycler® 2.0; Lightcycler® 96
Thermo Scientific PikoReal Cycler; Cepheid SmartCycler®; Illumina Eco qPCR
运输和保存方法
冰袋运输。-20℃避光保存,有效期1年。本品避免反复冻融。建议分装保存。
注意事项
1. 实验过程中请使用 RNase free 耗材。
2. 为了您的安全和健康,请穿实验服并佩戴一次性手套操作。
反应体系(以 20 μL为例)
组分 |
加入量 |
终浓度 |
2×Hifair® Ⅲ P buffer |
10 μL |
1× |
Hifair® UH Ⅲ Enzymes |
1 μL |
– |
Hieff® 50×High Rox or Low Rox |
0.4 μL |
– |
Gene Specific Primer Forward (10 µM) |
0.4 μL |
0.2 μM |
Gene Specific Primer Reverse (10 µM) |
0.4 μL |
0.2 μM |
TaqMan Probe (10 µM) |
0.2 μL |
0.1 μM |
模板 RNA |
Total RNA: 1 pg-1 µg |
– |
RNase free ddH2O |
to 20 μL |
– |
【注】:
a 所有试剂使用前应充分混匀。
b 参比染料:Rox的添加,可根据不同仪器型号进行选择,具体可参考【适用机型】。
c 引物浓度:通常引物终浓度为0.2 μM,也可以根据情况在0.1-1.0 μM之间进行调整。
d 探针浓度:探针终浓度可在50 nM-250 nM之间调整。
e 体系配制:请于超净工作台内配制,并使用无核酸酶残留的枪头、反应管;推荐使用带滤芯的枪头。避免交叉污染和气溶胶污染。
f 模板稀释:一步法RT-qPCR灵敏度极高,推荐将模板稀释后(如稀释至2-5 μL/样本)加入反应体系中,这样可以有效提高实验的重复性。
g 反应体系:建议以大体系进行实验,如20 μL或50 μL。
标准扩增程序
反应阶段 |
温度 |
时间 |
循环数 |
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1 |
逆转录 |
50℃a |
15 minb |
1 |
2 |
预变性 |
95℃ |
30 sec |
1 |
3 |
扩增反应 |
95℃ |
10 sec |
45 cycles |
60℃ |
30 secc |
【注】:
a 对于含复杂二级结构或高GC含量的RNA模板,可将逆转录温度提高到55℃,有助于提升扩增效率和灵敏度。
b 逆转录时间可以根据模板的复杂程度进行调整,时间为5min时可满足大多数基因的鉴定。
c 不同的qPCR检测仪器所需的荧光信号采集时间不同,请根据最短时间限制进行设置。
HB220304
Q:标准曲线扩增效率小于 90%或者大于 110%,线性关系不好,这样的问题如何解决?
A:加样误差。加大模板稀释倍数,提高加样体积,使不同稀释度的加样体积更准确;
标准品降解。重新制备标准品;
模板浓度太高。存在反应抑制,增加模板稀释倍数; 引物扩增特异性不好。重新设计引物。
Q:反应结束无扩增曲线出现
A:反应循环数不够,可适当增加循环次数。一般设置为 40,需注意过多的循环会增加背景信号,降低数据可信度;
确认程序中是否设置了信号采集步骤。三步法扩增程序应该将信号采集设置在 72℃延伸阶段, 两步法一般在退火延伸阶段收集;
确认引物是否降解。长时间未使用的引物应先通过PAGE 电泳检测完整性; 模板浓度太低。减少稀释度重复实验;
模板降解。重新制备模板。
Q:实验重复性差如何解决?
A:加样体积不准。定期校正移液器,将模板高倍稀释,以大体积加入反应体系中; 定量PCR 仪器不同位置温度控制不一致,定期校准仪器;
模板浓度太低。模板浓度越低,重复性越差; 做 4-6 个复孔,删除其中重复性不好的孔。
Q:模板的稀释液如何选择?
A:Nuclease-Free water、DEPC 水或实验室自备的 ddH2O 都可以。不推荐使用 TE 作为稀释液,TE 里有EDTA 会抑制酶的活性。
[1] Liu CX, Li X, Nan F, et al. Structure and Degradation of Circular RNAs Regulate PKR Activation in Innate Immunity. Cell. 2019;177(4):865-880.e21. doi:10.1016/j.cell.2019.03.046(IF:36.216)
[2] Liu CX, Guo SK, Nan F, Xu YF, Yang L, Chen LL. RNA circles with minimized immunogenicity as potent PKR inhibitors. Mol Cell. 2022;82(2):420-434.e6. doi:10.1016/j.molcel.2021.11.019(IF:17.970)
[3] Chen S, Luo X, Wu W, et al. The long non-coding RNA MACC1-AS1 promotes nasopharyngeal carcinoma cell stemness via suppressing miR-145-mediated inhibition on SMAD2/MACC1-AS1 axis. Biomed Pharmacother. 2020;125:109986. doi:10.1016/j.biopha.2020.109986(IF:4.545)
[4] Wang J, Ren D, Sun Y, et al. Inhibition of PLK4 might enhance the anti-tumour effect of bortezomib on glioblastoma via PTEN/PI3K/AKT/mTOR signalling pathway. J Cell Mol Med. 2020;24(7):3931-3947. doi:10.1111/jcmm.14996(IF:4.486)
[5] Bi X, Jiang Z, Luan Z, Qiu D. Crocin exerts anti-proliferative and apoptotic effects on cutaneous squamous cell carcinoma via miR-320a/ATG2B. Bioengineered. 2021;12(1):4569-4580. doi:10.1080/21655979.2021.1955175(IF:3.269)
[6] Liu D, Wan L, Gong H, Chen S, Kong Y, Xiao B. Sevoflurane promotes the apoptosis of laryngeal squamous cell carcinoma in-vitro and inhibits its malignant progression via miR-26a/FOXO1 axis. Bioengineered. 2021;12(1):6364-6376. doi:10.1080/21655979.2021.1962684(IF:3.269)
[7] Shi M, Chen X, Li H, Zheng L. δ-tocotrienol suppresses the migration and angiogenesis of trophoblasts in preeclampsia and promotes their apoptosis via miR-429/ ZEB1 axis. Bioengineered. 2021;12(1):1861-1873. doi:10.1080/21655979.2021.1923238(IF:3.269)
[8] Tan Q, Lin S, Zeng Y, et al. Ginsenoside Rg3 attenuates the osimertinib resistance by reducing the stemness of non-small cell lung cancer cells. Environ Toxicol. 2020;35(6):643-651. doi:10.1002/tox.22899(IF:3.118)
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[10] Guo W, Wei B, Cheng T, Xu X, Ruan F, Xiang M. The Na+/K+ ATPase Inhibitor Ouabain Attenuates Stemness and Chemoresistance of Osteosarcoma Cells. Med Sci Monit. 2019;25:9426-9434. Published 2019 Dec 11. doi:10.12659/MSM.919266(IF:1.980)
[11] Wu X, Wang Y, Zhong W, Cheng H, Tian Z. The Long Non-Coding RNA MALAT1 Enhances Ovarian Cancer Cell Stemness by Inhibiting YAP Translocation from Nucleus to Cytoplasm. Med Sci Monit. 2020;26:e922012. Published 2020 May 20. doi:10.12659/MSM.922012(IF:1.918)
[12] Wu X, Wang Y, Zhong W, Cheng H, Tian Z. RNA Binding Protein RNPC1 Suppresses the Stemness of Human Endometrial Cancer Cells via Stabilizing MST1/2 mRNA. Med Sci Monit. 2020;26:e921389. Published 2020 Feb 23. doi:10.12659/MSM.921389(IF:1.918)