MGI文库构建专用配套试剂盒Set2|Hieff NGS® Complete Adapter Kit for MGI®,Set 2
产品说明书
FAQ
COA
已发表文献
Hieff NGS® Complete Adapter Kit for MGI®是针对MGI®高通量文库构建专用配套试剂盒,共分为3个Set,每个Set中包含8到96种不同的Barcode接头,适用于MGI®高通量测序平台多样品DNA文库构建。试剂盒中提供的所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证,最大程度保证了文库构建的稳定性和可重复性。
Set 1:8 index ,41-48
Set 2:16 index ,57-72
Set 3:96 index
产品组分
编号 |
组分 |
2 T |
4 T |
100 T |
13360 |
8 index |
10 μL each |
20 μL each |
500 μL each |
13361 |
16 index |
10 μL each |
20 μL each |
500 μL each |
13362 |
96 index |
10 μL each |
20 μL each |
500 μL each |
运输和保存方法
冰袋运输,-20℃保存,有效期18个月。
注意事项
1)切勿加热接头,应在室温让其缓慢溶解,实验室温度最好设置为20-25℃。接头避免反复冻融,可短暂存放于4℃。
2)使用Hieff NGS® Complete Adapter Kit for MGI®试剂盒构建的DNA文库结构如下:
5’ – Bottom Adapter – Insert DNA Sequence – Barcode Adapter- 3’
3) 试剂盒中提供的每种DNA Adapter中都包含Bottom Adapter,且提供一种Barcode序列标签,用于高通量测序时区分样品。
4)为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
5)MGI接头最多有96种index,当使用96 index规格的产品进行建库测序时,index的选择需按照MGI推荐的组合进行操作,具体规格见使用方法。
6)本产品index序列请索要excel格式的文件,或在官网上下载。
7)接头浓度为10μM。
使用方法
DNA Adapter的序列如下:
Barcode Adapter:5’-phos-AGTCGGAGGCCAAGCGGTCTTAGGAAGACAAXXXXXXXXXXCAACTCCTTGGCTCACA-3’
Bottom Adapter:5’-TTGTCTTCCTAAGGAACGACATGGCTACGATCCGACTT-3’
1XXXXXXXXXX表示接头的Barcode区域,其在每个接头中的序列见下表。测序前在Sample Sheet中只需输入这个Barcode序列(10 bp)即可。
图1. 96种MGI index成组规则
Index序列如下:
红色框中的8种index
Adapter编号 |
Index序列 |
Adapter编号 |
Index序列 |
01 |
TAGGTCCGAT |
13 |
CGGCAATCCG |
02 |
GGACGGAATC |
14 |
ATCAGGATTC |
03 |
CTTACTGCCG |
15 |
TCATTCCAGA |
04 |
ACCTAATTGA |
16 |
GATGCTGGAT |
蓝色框中的64种index
Adapter编号 |
Index序列 |
Adapter编号 |
Index序列 |
41 |
TTAGATGCAT |
57 |
ATTCAACGGA |
42 |
GTCCAGAGCT |
58 |
AACTGTACTG |
43 |
CACGTGATAG |
59 |
GTACCTCAAT |
44 |
CCACTAGTCC |
60 |
GACTTCTAAT |
45 |
TGGACTTGGC |
61 |
TGAAGCGTTG |
46 |
GCTTGACAGG |
62 |
CGTGCGATCC |
47 |
AAGACCTCTA |
63 |
TCGGAAGGCA |
48 |
AGTTGCCATA |
64 |
CCGATGTCGC |
Adapter编号 |
Index序列 |
Adapter编号 |
Index序列 |
65 |
ACTTAGAATG |
73 |
GACAATGCTC |
66 |
TCCAAGCCTG |
74 |
GCTAATCACA |
67 |
AGACGATGAT |
75 |
AGTCCATAGG |
68 |
CTCACAAGAC |
76 |
CTATCGCCTA |
69 |
CGTTCCTACT |
77 |
ATCGTGGTCT |
70 |
GTGGTTGTGA |
78 |
TGGCTAATAC |
71 |
GAAGGCCTGC |
79 |
CAGTGCAGAG |
72 |
TAGCTTGCCA |
80 |
TCAGGCTGGT |
Adapter编号 |
Index序列 |
Adapter编号 |
Index序列 |
81 |
ATACTCACGC |
89 |
CACCATGTCT |
82 |
ATGCTCCGCG |
90 |
ATATGTCTGG |
83 |
TGTGAACTTG |
91 |
AAGGAAGCGT |
84 |
GAGAGGTGCT |
92 |
TCAAGACGTC |
85 |
TGCACTGTAA |
93 |
CCGCTCAGTA |
86 |
GCCTAGGCAA |
94 |
GGTGTGTACA |
87 |
CCATCATAGC |
95 |
TTCACGTAAG |
88 |
CATGGTAATT |
96 |
GGTTCCACAC |
Adapter编号 |
Index序列 |
Adapter编号 |
Index序列 |
97 |
AGGTATTCTT |
121 |
CCTTGATCAA |
98 |
CGAATGCAAC |
122 |
GGAAGTGGCA |
99 |
TTCAACGGCG |
123 |
AACATTCTAC |
100 |
CTCGGCGGAA |
124 |
GACGCGAGTC |
101 |
ACGGTAATGG |
125 |
CTATAACACT |
102 |
GATCCGACGT |
126 |
AGTCTCGTGT |
103 |
TCACGATACA |
127 |
TCGGCCTATG |
104 |
GATTCTCTTC |
128 |
TTGCAGACGG |
紫色框中的24种index
Adapter编号 |
Index序列 |
Adapter编号 |
Index序列 |
Adapter编号 |
Index序列 |
25 |
TAGAGGACAA |
33 |
GCAACGATGG |
49 |
ATGTACGCAG |
26 |
CCTAGCGAAT |
34 |
TAATCGTTCA |
50 |
TTAATGAGAT |
117 |
ATGTCTATCC |
35 |
GTTCGCTCTA |
51 |
TGCGCCACTT |
28 |
GCTGAGCTGT |
36 |
TCTCACACAT |
52 |
CATTAAGGCC |
29 |
AACCTAGATA |
37 |
CTGTTAGGAT |
53 |
CCGCCTCAGA |
30 |
TTGCCATCTC |
38 |
CGCAGACGCG |
116 |
GCTCCATGAC |
114 |
CCAGAGTCAG |
39 |
AAGGATCATC |
55 |
GCCGGTTATC |
32 |
CGCTATCGGC |
115 |
AACAGGCAGT |
56 |
GGAATATTGA |
说明:
4 个 Adapter 成组:第 1 列(01-04,13-16),共计 2 组(图 1 红色框);
8 个 Adapter 成组:第 2-9 列(41-48、57-64、65-72、73-80、81-88、89-96、97-104 和 121-128),共计 8 组(图 1 蓝色框);
24 个 Adapter 成组:第 10-12 列,共计 1 组(图 1 紫色框)。
成组规则:
1)样本数1-4:选择红色框中index;也可以选择蓝色框中的index,尽量选择一列上的index,不要跨列选择。
2)样本数5–24:选择蓝色框中的index进行操作,尽量先选择同一列上的index,然后再选择第二列
3)样本数25–64:按照规格2进行操作;也可以选择紫色框中的所有index,然后加上蓝色框中的index。但不可以一部分index选择紫色框,一部分选择其他组别。
4)样本数:65–72:选择蓝色框中的所有index,然后再加上红色框中的index。
5)样本数:73–96:可以选择紫色框中全部index,再加红色框或蓝色框中的index.
【注】请按照以上说明,选择合适的接头进行文库构建,否则影响后期下机数据的拆分(不按照要求使用,会造成下机数据拆分均一性较差)
HB220530
Hieff NGS® Complete Adapter Kit for MGI®是针对MGI®高通量文库构建专用配套试剂盒,共分为3个Set,每个Set中包含8到96种不同的Barcode接头,适用于MGI®高通量测序平台多样品DNA文库构建。试剂盒中提供的所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证,最大程度保证了文库构建的稳定性和可重复性。
Set 1:8 index ,41-48
Set 2:16 index ,57-72
Set 3:96 index
产品组分
编号 |
组分 |
2 T |
4 T |
100 T |
13360 |
8 index |
10 μL each |
20 μL each |
500 μL each |
13361 |
16 index |
10 μL each |
20 μL each |
500 μL each |
13362 |
96 index |
10 μL each |
20 μL each |
500 μL each |
运输和保存方法
冰袋运输,-20℃保存,有效期18个月。
注意事项
1)切勿加热接头,应在室温让其缓慢溶解,实验室温度最好设置为20-25℃。接头避免反复冻融,可短暂存放于4℃。
2)使用Hieff NGS® Complete Adapter Kit for MGI®试剂盒构建的DNA文库结构如下:
5’ – Bottom Adapter – Insert DNA Sequence – Barcode Adapter- 3’
3) 试剂盒中提供的每种DNA Adapter中都包含Bottom Adapter,且提供一种Barcode序列标签,用于高通量测序时区分样品。
4)为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
5)MGI接头最多有96种index,当使用96 index规格的产品进行建库测序时,index的选择需按照MGI推荐的组合进行操作,具体规格见使用方法。
6)本产品index序列请索要excel格式的文件,或在官网上下载。
7)接头浓度为10μM。
使用方法
DNA Adapter的序列如下:
Barcode Adapter:5’-phos-AGTCGGAGGCCAAGCGGTCTTAGGAAGACAAXXXXXXXXXXCAACTCCTTGGCTCACA-3’
Bottom Adapter:5’-TTGTCTTCCTAAGGAACGACATGGCTACGATCCGACTT-3’
1XXXXXXXXXX表示接头的Barcode区域,其在每个接头中的序列见下表。测序前在Sample Sheet中只需输入这个Barcode序列(10 bp)即可。
图1. 96种MGI index成组规则
Index序列如下:
红色框中的8种index
Adapter编号 |
Index序列 |
Adapter编号 |
Index序列 |
01 |
TAGGTCCGAT |
13 |
CGGCAATCCG |
02 |
GGACGGAATC |
14 |
ATCAGGATTC |
03 |
CTTACTGCCG |
15 |
TCATTCCAGA |
04 |
ACCTAATTGA |
16 |
GATGCTGGAT |
蓝色框中的64种index
Adapter编号 |
Index序列 |
Adapter编号 |
Index序列 |
41 |
TTAGATGCAT |
57 |
ATTCAACGGA |
42 |
GTCCAGAGCT |
58 |
AACTGTACTG |
43 |
CACGTGATAG |
59 |
GTACCTCAAT |
44 |
CCACTAGTCC |
60 |
GACTTCTAAT |
45 |
TGGACTTGGC |
61 |
TGAAGCGTTG |
46 |
GCTTGACAGG |
62 |
CGTGCGATCC |
47 |
AAGACCTCTA |
63 |
TCGGAAGGCA |
48 |
AGTTGCCATA |
64 |
CCGATGTCGC |
Adapter编号 |
Index序列 |
Adapter编号 |
Index序列 |
65 |
ACTTAGAATG |
73 |
GACAATGCTC |
66 |
TCCAAGCCTG |
74 |
GCTAATCACA |
67 |
AGACGATGAT |
75 |
AGTCCATAGG |
68 |
CTCACAAGAC |
76 |
CTATCGCCTA |
69 |
CGTTCCTACT |
77 |
ATCGTGGTCT |
70 |
GTGGTTGTGA |
78 |
TGGCTAATAC |
71 |
GAAGGCCTGC |
79 |
CAGTGCAGAG |
72 |
TAGCTTGCCA |
80 |
TCAGGCTGGT |
Adapter编号 |
Index序列 |
Adapter编号 |
Index序列 |
81 |
ATACTCACGC |
89 |
CACCATGTCT |
82 |
ATGCTCCGCG |
90 |
ATATGTCTGG |
83 |
TGTGAACTTG |
91 |
AAGGAAGCGT |
84 |
GAGAGGTGCT |
92 |
TCAAGACGTC |
85 |
TGCACTGTAA |
93 |
CCGCTCAGTA |
86 |
GCCTAGGCAA |
94 |
GGTGTGTACA |
87 |
CCATCATAGC |
95 |
TTCACGTAAG |
88 |
CATGGTAATT |
96 |
GGTTCCACAC |
Adapter编号 |
Index序列 |
Adapter编号 |
Index序列 |
97 |
AGGTATTCTT |
121 |
CCTTGATCAA |
98 |
CGAATGCAAC |
122 |
GGAAGTGGCA |
99 |
TTCAACGGCG |
123 |
AACATTCTAC |
100 |
CTCGGCGGAA |
124 |
GACGCGAGTC |
101 |
ACGGTAATGG |
125 |
CTATAACACT |
102 |
GATCCGACGT |
126 |
AGTCTCGTGT |
103 |
TCACGATACA |
127 |
TCGGCCTATG |
104 |
GATTCTCTTC |
128 |
TTGCAGACGG |
紫色框中的24种index
Adapter编号 |
Index序列 |
Adapter编号 |
Index序列 |
Adapter编号 |
Index序列 |
25 |
TAGAGGACAA |
33 |
GCAACGATGG |
49 |
ATGTACGCAG |
26 |
CCTAGCGAAT |
34 |
TAATCGTTCA |
50 |
TTAATGAGAT |
117 |
ATGTCTATCC |
35 |
GTTCGCTCTA |
51 |
TGCGCCACTT |
28 |
GCTGAGCTGT |
36 |
TCTCACACAT |
52 |
CATTAAGGCC |
29 |
AACCTAGATA |
37 |
CTGTTAGGAT |
53 |
CCGCCTCAGA |
30 |
TTGCCATCTC |
38 |
CGCAGACGCG |
116 |
GCTCCATGAC |
114 |
CCAGAGTCAG |
39 |
AAGGATCATC |
55 |
GCCGGTTATC |
32 |
CGCTATCGGC |
115 |
AACAGGCAGT |
56 |
GGAATATTGA |
说明:
4 个 Adapter 成组:第 1 列(01-04,13-16),共计 2 组(图 1 红色框);
8 个 Adapter 成组:第 2-9 列(41-48、57-64、65-72、73-80、81-88、89-96、97-104 和 121-128),共计 8 组(图 1 蓝色框);
24 个 Adapter 成组:第 10-12 列,共计 1 组(图 1 紫色框)。
成组规则:
1)样本数1-4:选择红色框中index;也可以选择蓝色框中的index,尽量选择一列上的index,不要跨列选择。
2)样本数5–24:选择蓝色框中的index进行操作,尽量先选择同一列上的index,然后再选择第二列
3)样本数25–64:按照规格2进行操作;也可以选择紫色框中的所有index,然后加上蓝色框中的index。但不可以一部分index选择紫色框,一部分选择其他组别。
4)样本数:65–72:选择蓝色框中的所有index,然后再加上红色框中的index。
5)样本数:73–96:可以选择紫色框中全部index,再加红色框或蓝色框中的index.
【注】请按照以上说明,选择合适的接头进行文库构建,否则影响后期下机数据的拆分(不按照要求使用,会造成下机数据拆分均一性较差)
HB220530
Q: 接头中 index/Barcode 组合原则是什么?
A: 碱基平衡,荧光平衡(详情可查看翊圣生物公众号微信软文“一文全面解析NGS 接头的奥秘”)
Q: 双端接头,连接过程的注意事项,长接头和短接头有区别吗?
A: 长接头带完整的 index 序列,所以接头连接的时候直接完成文库构建,此时如果文库浓度达到测序要求,那么可以直接PCR-Free 建库;短接头建库,接头连接步骤双端同时连接相同的 PE Adapter。
暂无内容